O Tirsense ganhou a zona norte, o Feirense ganhou a zona centro e o União da Madeira ganhou a zona sul.
II Divisão Norte
PosEquipaJVEDGMGSDiffPts1Tirsense34201045623+33502Freamunde3417985533+22433Gil Vicente3418794930+19434Rio Ave3416995030+20415Desportivo Aves34141285436+18406Varzim34121484737+10387Felgueiras34121394535+10378Paços Ferreira34165134240+2379Vizela34121111383803510Joane3491783740-33511Salgueiros341014103437-33412Trofense34914112738-93213Marco34128144657-113214Bragança341011133442-83115Paredes34911143142-112916Moreirense3499162939-102717Amarante3449212663-371718Santa Maria3427252464-4013
II Divisão Centro
PosEquipaJVEDGMGSDiffPts1Feirense3423836918+51542Académica34211036623+43523Águeda34141644119+22444Marialvas3417895131+20425União Lamas34151094729+18406Sporting Covilhã34166126031+29387Peniche341311103843-5378Caldas34148125643+13369Oliveira Bairro341013112332-93310União Leiria34913124244-23111Portalegrense34127153947-83112CD Lousanense34127154253-113113Mangualde34119143446-123114Mealhada34810163252-202615Luso34712153143-122616Marinhense34611172259-372317Estrela Portalegre34412181741-242018Estarreja3457222985-5617
II Divisão Sul
PosEquipaJVEDGMGSDiffPts1União Madeira3420955422+32492Louletano34181155926+33473O Elvas3417984732+15434Olhanense34166125436+18385Torreense34131294232+10386Estoril341212103327+6367Atlético341211114034+6358Alverca34139124238+4359Olivais e Moscavide34146143541-63410Juventude Évora34101311434303311Barreirense341111124148-73312Lusitano Évora34913122731-43113Silves34814123450-163014Oriental34912133040-103015União Santiago34117163350-172916Esperança Lagos3497183149-182517Montijo3488184054-142418Sacavenense34512172153-3222
Categoria:Futebol de 1988 em Portugal Categoria:Futebol de 1989 em Portugal