Um elemento viral endógeno (EVE) é uma sequência de DNA derivada de um vírus e presente na linhagem germinativa de um organismo não viral. Os EVEs podem ser genomas virais inteiros (provírus) ou fragmentos de genomas virais. Eles surgem quando uma sequência de DNA viral se integra ao genoma de uma célula germinativa que, posteriormente, dá origem a um organismo viável. O EVE recém-estabelecido pode ser herdado de uma geração para a seguinte como um alelo na espécie hospedeira e pode até mesmo atingir a fixação.
Retrovírus endógenos e outros EVEs que ocorrem como provírus podem potencialmente manter a capacidade de produzir vírus infecciosos em seu estado endógeno. A replicação desses vírus endógenos "ativos" pode levar à proliferação de inserções virais na linhagem germinativa. Para a maioria dos vírus não retrovirais, a integração na linhagem germinativa parece ser um evento raro e anômalo, e os EVEs resultantes são frequentemente apenas fragmentos do genoma do vírus parental. Tais fragmentos geralmente não são capazes de produzir vírus infecciosos, mas podem expressar proteínas, RNA ou até mesmo receptores de superfície celular.
Diversidade e distribuição Elementos de transcrição endógenos foram identificados em animais, plantas e fungos. Em vertebrados, EVEs derivados de retrovírus (retrovírus endógenos) são relativamente comuns. Como os retrovírus se integram ao genoma nuclear da célula hospedeira como parte inerente de seu ciclo de replicação, eles são predispostos a entrar na linhagem germinativa do hospedeiro. Além disso, EVEs relacionados a parvovírus, filovírus, bornavírus e circovírus foram identificados em genomas de vertebrados. Em genomas de plantas, EVEs derivados de pararetrovírus são relativamente comuns. EVEs derivados de outras famílias de vírus não retrotranscritores, como Geminiviridae, também foram identificados em plantas. Além disso, EVEs relacionados a vírus gigantes (também conhecidos como GEVEs) do filo Nucleocytoviricota (NCLDV) semelhantes ao vírus Aureococcus anophagefferens (AaV) foram encontrados em 2019/2020.
Identificação Os EVEs são tradicionalmente identificados pela semelhança com vírus conhecidos. Em 2021, foi demonstrado que a composição de k-mer de vírus de RNA endógenos se assemelha à de seus homólogos exógenos. Como resultado, agora é possível identificar novos grupos de vírus de RNA endógenos cujos parentes exógenos foram extintos.
Co-optação e exaptação por espécies hospedeiras Os EVEs podem, por vezes, conferir uma vantagem seletiva aos indivíduos em que são inseridos. Por exemplo, alguns protegem contra a infecção por vírus relacionados. Em alguns grupos de mamíferos, incluindo primatas superiores, as proteínas do envelope retroviral foram exaptadas para produzir uma proteína que é expressa no sinciciotrofoblasto placentário e está envolvida na fusão das células do citotrofoblasto para formar a camada sincicial da placenta. Em humanos, essa proteína é chamada de sincitina e é codificada por um retrovírus endógeno chamado (ERVWE1) no cromossomo sete. Notavelmente, a captura de genes de sincitina ou semelhantes à sincitina ocorreu independentemente, a partir de diferentes grupos de retrovírus endógenos, em diversas linhagens de mamíferos. Genes distintos, semelhantes à sincitina, foram identificados em primatas, roedores, lagomorfos, carnívoros e ungulados, com datas de integração variando de 10 a 85 milhões de anos atrás.
Ver também
DNA antigo Retrovírus endógeno Paleovirologia Polidnavírus
Referências
Categoria:Virologia