miniaturadeimagen|361x361px|Estructura de la COPI.
Los COP, o coatómeros(en inglés) son complejos proteicos que participan en la formación de las cubiertas de vesículas membranosas en el interior de las células, en el inicio de las vías secretoras. Se trata de un proceso conservado evolutivamente en los eucariotas. Existen dos clases de estas proteínas, cada una implicada en un tipo de transporte diferente: COPI (/cop uno/), que media el transporte retrógrado (desde el trans-Golgi al cis-Golgi y al retículo endoplasmático), y COPII (/cop dos/), que media el transporte anterógrado (desde el retículo endoplasmático al cis-Golgi). Otras proteínas de revestimiento de vesículas, que también participan en este proceso y que tienen funciones parecidas a las de los coatómeros, son las clatrinas, que intervienen cuando el transporte acontece desde el aparato de Golgi a la membrana plasmática. Los coatómeros son funcionalmente análogos y evolutivamente homólogos de las proteínas adaptadoras de la clatrina, también llamadas adaptinas, que regulan la endocitosis desde la membrana plasmática y el transporte desde la red trans-Golgi a los lisosomas.
Las proteínas que van a ser transportadas en las vías retrógrada y anterógrada presentan una secuencia de aminoácidos que determina el lugar de la célula a la que van destinadas, lo que hace que este proceso sea selectivo.
Las proteínas de revestimiento, como las COP, deben actuar solo en las ocasiones en que son necesarias, por lo que debe haber un control del tráfico de membranas nos distintos tipos de transporte. Como GTPasas reclutadoras de revestimiento, que son proteínas monoméricas, controlan la formación de vesículas. En alta concentración en el citoplasma, las moléculas reclutadoras inactivas ligadas a GDP son activadas por GEFs específicos en las membranas internas, que activan las reclutadoras asociándolas con GTP.ALBERTS, B.; BRAY, D.; LEWIS, J.; RAFF, M.; ROBERTS, K.; WATSON, J. D. Biologia molecular da célula. Porto Alegre: Artes Médicas, 1994. 1294 p.
La palabra coatómero proviene de la palabra inglesa coat (cubierta, recubrimento, revestimiento) y el sufijo griego meros (parte, porción).Diccionario etimológico méros
COPI La COPI es el complejo proteico de revestimiento responsable de la vía retrógrada, entre el aparato de Golgi y el retículo endoplasmático (RE). Se trata de una ruta de recuperación de moléculas biológicas útiles procedentes del RE, que pueden ser recicladas y reutilizadas por la célula en diversas actividades fisiológicas. Esa vía es importante para evitar un gasto excesivo de energía en la síntesis de nuevas moléculas, promoviendo una mejor viabilidad termodinámica en la homeostasis celular. Procesos como la propia envaginación de vesículas pueden ser reabastecidos por componentes recuperados en esa ruta, como es el caso de los SNAREs.
Para que la vía retrógrada ocurra, es imprescindible que haya una señal que marque las proteínas originarias del retículo endoplasmático, siendo los más comunes secuencias específicas de aminoácidos, conocidas cómo KDEL, KKXX (di-lisina) o KXKXX. Esos marcadores específicos señalizan que la proteína normalmente se encuentra en el RE en estado estacionario y no debe ser dirigida a otros dominios celulares por la región trans del aparato de Golgi, pero sin retornar por las cisternas cis a su lugar de origen. El marcaje de los sustratos que van a ser transportados es, de esa forma, extremadamente importante en la etapa de selección del contenido de las vesículas revestidas de COPI. Como proteínas cargamento retrógradas que llevan una señal de di-lisina se ligan directamente al revestimiento. Las proteínas del lumen del RE que poseen un motivo KDEL, como las chaperonas BiP y PDI, son reconocidas en la región cis-Golgi por un receptor KDEL (codificado lo pones gen ERD2 en lévedos) y son direcionados hacia vesículas COPI.Lippincott-Schwartz, J., Presley, J., Cole, N., Schroer, T., Hirschberg, K. and Zaal, K. (1997). ER-to-Golgi transport visualized in living cells. Nature, [on line] 389(6646), pp.81-85. Available at: https://www.nature.com/nature/journal/v389/n6646/full/389081a0.html [Accessed 5 Jul. 2017].Gürkan, C., Stagg, S., LaPointe, P. and Balch, W. (2006). The COPII cage: unifying principles of vesicle coat assembly. Nature Reviews Molecular Cell Biology, [on line] 7(10), pp.727-738. Available at: https://www.nature.com/nrm/journal/v7/n10/full/nrm2025.html [Accessed 5 Jul. 2017].Lee, C. and Goldberg, J. (2010). Structure of Coatomer Cage Proteins and the Relationship among COPI, COPII, and Clathrin Vesicle Coats. Cell, [on line] 142(1), pp.123-132. Available at: http://dx.doi.org/doi:10.1016/j.cell.2010.05.030 [Accessed 5 Jul. 2017].Bethune, J., Kol, M., Hoffmann, J., Reckmann, I., Brugger, B. and Wieland, F. (2006). Coatomer, the Coat Protein of COPI Transport Vesicles, Discriminates Endoplasmic Reticulum Residents from p24 Proteins. Molecular and Cellular Biology, 26(21), pp.8011-8021.
Estudios hechos en mamíferos encontraron la relevancia de la COPI en otra vía de transporte de vesículas: el transporte intra-Golgi. Esa vía está asociada a la conducción de biomoléculas entre las cisternas del orgánulo, donde pueden ocurrir diversos procesos bioquímicos relacionados con el procesamiento postraduccional, por ejemplo a glicosilación, la escisión de proproteínas y la fosforilación de estructuras. El revestimiento de la COPI fue identificado por primera vez en un ensayo de células libres de mamíferos que reproducían el transporte intra-Golgi. Las vesículas revestidas de COPI derivadas de Golgi se acumulan y pueden ser purificadas por medio de reacciones en las que el transporte es bloqueado con el análogo GTP no hidrolizable, GTP-g -S. La ARF ligada al GTP es una de las proteínas citosólicas necesaria para producir vesículas revestidas de COPI, constituyendo la maquinaria mínima para deformar la bicapa lipídica durante la envaginación de vesículas. La retirada de las vesículas de COPI se inicia cuando la ARF hidroliza su GTP, que libera la ARF y permite la fusión de la vesícula con la membrana diana. De esa forma, se sabe que, en células de mamíferos, el revestimiento de COPI está predominantemente asociado al lado cis del aparato de Golgi (vía retrógrada) y a las estructuras de compartimentos intermediarios, dispersas al largo del citoplasma (transporte intra-Golgi).
COP II La COP II es un complejo de proteínas que actúa en la envaginación de vesículas constitutivas de la vía anterógrada, o sea, originadas en el retículo endoplasmático y dirigidas al aparato de Golgi. Esa vía ejerce papel fundamental en las etapas iniciales de las actividades secretoras de la célula. Para iniciar su paso al largo de la vía biosintética-secretora, las proteínas que entran en el RE y que son destinadas al aparato de Golgi o más allá son, primeramente, empaquetadas en pequeñas vesículas de transporte revestidas de COPII. Esas vesículas de transporte brotan de regiones especializadas del RE llamadas sitios de salida, cuyas membranas no poseen ribosomas adheridos.
Ese tipo de revestimiento por COPII fue identificado por primera vez en levaduras, y sus componentes están implicados en la formación de vesículas revestidas por COPII esenciales para la viabilidad celular en ellas. Estudios in vitro identificaron que los componentes citosólicos del revestimiento de la COPII comprenden la pequeña GTPase Sar1p y dos complejos de proteínas heterodímeras, Sec23/24p y Sec13/31p. Recientemente se ha utilizado la microscopía electrónica para visualizar la estructura de las subunidades COPII y la estructura superficial de las vesículas revestidas de COPII. Por ello se sabe que el complejo Sec23/24p se asemeja a un lazo y el complejo Sec13/31p posee una estructura flexible de diámetro de 24/ 30 nm que comprende una estructura globular.
Regulación del montaje de revestimientos de COP II Para asegurar que el tráfico de membranas en dirección a un orgánulo y en el sentido contrario sea equilibrado, las proteínas de revestimiento deben estructurarse solamente cuando y donde son necesarias. Por eso, la actividad de GTPasas reclutadoras es fundamental en la regulación del montaje de los revestimientos, tanto de COPII como de COPI. Las GTPasas reclutadoras de revestimiento son miembros de una familia de GTPasas monoméricas. Entre ellas están las proteínas t, responsables del montaje de los revestimientos de COPI y de clatrina a partir de las membranas de Golgi, y la proteína Sar1, la cual es responsable del montaje del revestimiento de COPII en las membranas del RE.
Debido al funcionamiento de esas GTPasas, el surgimiento de la vesícula solo se inicia cuando una proteína transmembrana localizada en el retículo endoplasmático, Sec12p, media en el cambio de GTP/PIB a Sar1p. La Sar1p ligada a GTP entonces se liga firmemente a las membranas del retículo endoplasmático, probablemente incorporando una hélice alfa N-terminal en la bicapa de una manera semejante a la promovida por la ARF1 (la pequeña GTPase que actúa en el tráfico dependiente de COPI). La unión a la membrana de Sar1p-GTP permite el reclutamiento del complejo Sec23/24 y posteriormente del complejo Sec13/31p, que induce la polimerización del revestimiento y la deformación de la membrana para la envaginación de vesículas. Después del brote de la vesícula, el Sec23p actúa como una proteína activadora de GTPase específica para el Sar1p (GAP), ayudando el Sar1p a hidrolizar el GTP, lo que, a su vez, desencadena la liberación de la vesícula. El complejo Sec13/31p, una vez reclutado en la membrana induciendo la curvatura de la membrana, origina el aumento de la actividad de Sar1pGTPase mediada por la acción del Sec23p.
Las GTPasas reclutadoras de revestimiento también ejercen un papel en el desmontaje del revestimiento. La hidrólisis del GTP ligado, que se cambia por GDP, determina que la GTPasa modifique su conformación de modo que su cola hidrófoba se suelte de la membrana, haciendo que el revestimiento de la vesícula se deshaga. Aunque no se sabe qué desencadena el proceso de hidrólisis de GTP, se propuso que las GTPasas trabajan como temporizadores (timers), hidrolizando GTP a una tasa lenta, pero previsible.
Otra proteína esencial para la formación de vesículas COPII está codificada en el gen SEC16. La Sec16p es una proteína hidrófila de 240 kDa que es esencial para la viabilidad de la levadura y su función demostró ser estrictamente necesaria para el implante de vesículas dependientes de la COPII del retículo endoplasmático in vivo. No obstante, el Sec16p está firmemente y periféricamente ligado a las membranas reticulares y, por tanto, no es una de las proteínas citosólicas necesarias para impulsar el brote de la COPII. Interacciona directamente con varios componentes del revestimiento COPII, concretamente Sar1p, Sec23p, Sec24p y Sec31p, organizando uno de los pasos iniciales en el montaje de la COPII.
La selección de carga en vesículas revestidas por COP II