Esta é uma lista de clãs japoneses. Os antigos clãs (Gōzoku) mencionados no Nihon Shoki e Kojiki perdieram o seu poder político antes do Período Heian, durante o qual emergiram em seu lugar novas aristocracias e famílias, Kuge. Após o período Heian, os clãs de guerreiros (samurái) foram gradualmente aumentando em importância e poder até dominar o país.
Nomes dos clãs da era Corte Imperial thumb|150px|Kamon de A Casa Imperial. A Casa Imperial - possivelmente descendentes dos Cinco Reis de Wa e dos Yamato no Período Kofun. Tanto os imperadores como os membros da família não possuem sobrenomes.
Gōzoku Clã Abe — descendentes do príncipe Ōhiko, filho do Imperador Kōgen; não possui relação direta com o Clã Abe da Ōshū. Clã Abe de Ōshū — descendentes de Abihiko (disputado); sem relação direta com o clã Abe descendente de Kōgen. Alguns membros importantes deste clã foram Abe no Hirafu e Abe no Yoritoki. Clã Aya da província de Sanuki — segundo o Kojiki, descendiam do príncipe Takekaiko, neto do Imperador Keikō. Clã Imube — descendente do lendário kami Ame no Futotama no Mikoto, e seu descendente Ame no Tomi no Mikoto, companheiro do Imperador Jimmu. Clã Haji — descendente do lendário kami Nomi no Sukune. Clã Ki — descendente do Imperador Kōgen através do ministro Takeshi-uchi no Sukune. Um dos membros mais famosos deste clã foi o poeta Ki no Tsurayuki. Clã Kusakabe — descendentes do 9º Imperador Kaika ou do 36º Imperador Kōtoku (disputado). Clã Mononobe — descendentes do lendário kami Nigihayahi no Mikoto, um descendente dos irmãos seniores de Ninigi no Mikoto, bisavô do Imperador Jimmu. Um importante membro deste clã foi Mononobe no Moriya, conhecido por se opor ao budismo. Clã Nakatomi — descendentes do lendário kami Ame no Koyane no Mikoto, e o seu descendente Ame no Taneko no Mikoto, companheiro de armas do Imperador Jimmu; a este clã pertenceu Nakatomi no Kamatari, fundador do Clã Fujiwara. Clã Ō — descendente do príncipe Kamuyaimimi no Mikoto, filho do Imperador Jimmu. Clã Ochi — descendentes do Clã Mononobe. Clã Ōe — descendentes do Clã Haji. Clã Ōtomo — descendentes de Michi-omi no Mikoto, companheiro de armas do Imperador Jimmu; sem relação com o clã imigrante Ōtomo e o clã feudal Ōtomo. O famoso poeta e estadista Ōtomo no Yakamochi pertenceu a este clã. Clã Sugawara — descendentes do Clã Haji. O famoso erudito, político e poeta Sugawara no Michizane foi membro deste clã. Clã Soga — descendentes do Imperador Kōgen, através do ministro Takeshi-uchi no Sukune. Grandes defensores do budismo no Japão, um membro destacado deste clã foi Soga no Umako. Clã Takahashi .
Clãs imigrantes Clã Hata — descendentes do príncipe Yuzuki no Kimi, um descendente do imperador Qin Shi Huang da Dinastia Qin da China. Clã Kawachi no Aya . Clã Kawachi no Fumi — descendentes do erudito Wani, a partir do Imperador Gāozǔ da Dinastia Han da China. Clã Koremune — ramo do Clã Hata descendente do príncipe Kōman-Ō da Dinastia Qin da China. Clã Kudara no Konikishi — descendentes do rei Uija de Baekje, um dos Três Reinos da Coreia. Clã Ōkura — uma linhagem do clã Yamato no Aya. Clã Ōtomo — descendentes de imigrantes chineses; sem relação com o nativo Clã Ōtomo e o Clã feudal Ōtomo. Clã Takamuko — descendentes do Imperador Wen da dinastia chinesa Cao Wei; um dos seus membros mais conhecidos foi o estudioso Takamuko no Kuromaro, que contribuiu para a elaboração das reformas Taika. Clã Tatara — descendentes do príncipe Rinshō, filho do rei Seong de Baekje (disputado). Clã Yamato no Aya — descendentes do príncipe Achi no Omi, um tetraneto do Imperador Ling de Han da Dinastia Han da China. Clã Yamato no Fumi — possivelmente uma linhagem do clã de Yamato no Aya.
Kuge , os quatro nobres clãs do Japão antigo:
Clã Minamoto — também conhecido como Genji; compreende 21 ramos menores da Casa Imperial do Japão. Daigo Genji (醍醐源氏) — descendentes do 60º Imperador Daigo. Go-Daigo Genji (後醍醐源氏) — descendentes do 96º Imperador Go-Daigo. Go-Fukakusa Genji (後深草源氏) — descendentes do 89º Imperador Go-Fukakusa. Go-Nijō Genji (後二条源氏) — descendentes do 94º Imperador Go-Nijō. Go-Saga Genji (後嵯峨源氏) — descendentes do 88º Imperador Go-Saga. Go-Sanjō Genji (後三条源氏) — descendentes do 71º Imperador Go-Sanjō. Go-Shirakawa Genji (後白河源氏) — descendentes do 77º Imperador Go-Shirakawa. Juntoku Genji (順徳源氏) — descendentes do 84º Imperador Juntoku. Kameyama Genji (亀山源氏) — descendentes do 90º Imperador Kameyama. Kazan Genji (花山源氏) — descendentes do 65º Imperador Kazan. Kōkō Genji (光孝源氏) — descendentes do 58º Imperador Kōkō. thumb|150px|Kamon de Murakami Genji. Murakami Genji (村上源氏) — descendentes do 62º Imperador Murakami. Montoku Genji (文徳源氏) — descendentes do 55º Imperador Montoku. Nimmyō Genji (仁明源氏) — descendentes do 54º Imperador Nimmyō. Ōgimachi Genji (正親町源氏) — descendentes do 106º Imperador Ōgimachi. Reizei Genji (冷泉源氏) — descendentes do 63º Imperador Reizei. Saga Genji (嵯峨源氏) — descendentes do 52º Imperador Saga. Sanjō Genji (三条源氏) — descendentes do 67º Imperador Sanjō. Seiwa Genji (清和源氏) — descendentes do 56º Imperador Seiwa; originário de vários clãs samurai. Kawachi Genji (河内源氏) — também conhecido como Genke; descendentes de Minamoto no Yorinobu; originários de Hitachi Genji (常陸源氏), Ishikawa Genji (石川源氏) e Kai Genji (甲斐源氏); conhecidos pelos três shogunatos de Kamakura. Settsu Genji (摂津源氏) — descendentes de Minamoto no Yorimitsu; originários de Tada Genji (多田源氏), Mino Genji (美濃源氏) e Shinano Genji (信濃源氏). Yamato Genji (大和源氏) — descendentes de Minamoto no Yorichika. Uda Genji (宇多源氏) — descendentes do 59º Imperador Uda; originários de Ōmi Genji (近江源氏). Yōzei Genji (陽成源氏) — descendentes do 57º Imperador Yōzei.
thumb|150px|Kamon do Clã Taira. Clã Taira (平氏) — também conhecido como Heishi; compreende quatro ramos menores da Casa Imperial japonesa. Kammu Heishi (桓武平氏) — descendentes do 50º Imperador Kammu; conhecido por Taira no Masakado. Bandō 8 Heishi (坂東八平氏) — descendentes de Taira no Yoshifumi. Ise Heishi (伊勢平氏) — também conhecido como Heike; descendentes de Taira no Korehira; famoso por Taira no Kiyomori. Kōkō Heishi (光孝平氏) — descendentes do 58º Imperador Kōkō. Montoku Heishi (文徳平氏) — descendentes do 55º Imperador Montoku. Nimmyō Heishi (仁明平氏) — descendentes do 54º Imperador Nimmyō.
Clã Fujiwara (藤原氏) — descendentes de Fujiwara no Kamatari. Quatro Famílias de Fujiwara (藤原四家) — descendentes dos quatro filhos de Fujiwara no Fuhito. Fujiwara Hokke (藤原北家) — Família do Norte; descendentes de Fujiwara no Fusasaki. Fujiwara Kyōke (藤原京家) — Família da Capital; descendentes de Fujiwara no Maro. Fujiwara Nanke (藤原南家) — Família do Sul; descendentes de Fujiwara no Muchimaro. Fujiwara Shikike (藤原式家) — Família Cerimonial; descendentes de Fujiwara no Umakai. Clã Ōshū Fujiwara (奥州藤原氏) — descendentes de Fujiwara no Hidesato.
Clã Tachibana (橘氏) — descendentes do Príncipe Naniwa-Ō, filho do Príncipe Shōtoku-Taishi (572-621), neto do Imperador Yōmei; sem relação direta com o Clã Tachibana feudal (立花氏).
Clãs da era feudal (Myōji/苗字)
Clã Abe de Mikawa (阿部氏) — descendentes do Imperador Kōgen e do antigo Clã Abe (阿部氏); sem relação direta com o Clã Abe de Ōshū (安倍氏). Clã Adachi (安達氏) — descendentes do Clã Fujiwara. Clã Akahoshi (赤星氏) — linhagem inferior do Clã Kikuchi que descendeu do Clã Fujiwara. Clã Akamatsu (赤松氏) — descendentes do Murakami Genji. Clã Akechi (明智氏) — ramo menor do Clã Toki que descendeu do Seiwa Genji; famoso por Akechi Mitsuhide. Clã Akita (秋田氏) — descendentes do Clã Abe de Ōshū. Clã Akiyama (秋山氏) — linhagem inferior do Clã Takeda que descendeu do Seiwa Genji. Clã Akizuki (秋月氏) — descendentes do Príncipe Achi no Omi da Dinastia Han chinesa. Clã Amago (尼子氏) — linhagem inferior do Clã Sasaki que descendeu do Uda Genji. Clã Amakasu (甘粕氏) — linhagem inferior do Clã Nitta que descendeu do Seiwa Genji (disputado). Clã Amakusa (天草氏) — descendentes do Clã Ōkura. Clã Anayama (穴山氏) — linhagem inferior do Clã Takeda que descendeu do Seiwa Genji. Clã Andō — descendentes do Clã Abe de Ōshū, por Abe no Hirafu. Clã Asakura (朝倉氏) — descendentes do Príncipe Kusakabe, filho do Imperador Temmu. Clã Asano (浅野氏) — linhagem inferior do Clã Toki que descendeu do Seiwa Genji. Clã Ashikaga (Genji) (足利氏) — descendentes do Seiwa Genji; conhecido pelo Shogunato Ashikaga; sem relação direta com o Clã Ashikaga (Fujiwara). Clã Ashikaga (Fujiwara) (足利氏) — descendentes do Fujiwara Hokke; sem relação direta com o Clã Ashikaga (Genji). Clã Ashina (蘆名氏) — linhagem inferior do Clã Miura que descendeu de Kammu Heishi. Clã Aso (阿蘇氏) — descendentes do Imperador Jimmu pelo Clã Ō. Clã Asō (麻生氏) — linhagem inferior do Clã Utsunomiya que descendeu de Fujiwara Hokke; famoso por Tarō Asō. Clã Atagi (安宅氏) — linhagem inferior do Clã Ogasawara que descendeu de Seiwa Genji (disputado). Clã Azai (浅井氏) — descendentes do Clã Fujiwara. Clã Bitō (尾藤氏) — descendentes do Fujiwara Hokke. Clã Chiba (千葉氏) — descendentes do Kammu Heishi. Clã Chōsokabe (長宗我部氏) — descendentes do Clã Hata (disputado). thumb|150px|Kamon do Clã Date. Clã Date (伊達氏) — também conhecido por Clã Idate ou Clã Idachi, descendentes de Fujiwara Hokke; famoso por Date Masamune. Clã Doi (Genji) (土井氏) — linhagem inferior do Clã Toki que descendeu do Seiwa Genji (disputado); sem relação direta com o Clã Doi (Heishi). Clã Doi (Heishi) (土肥氏) — descendentes do Kammu Heishi; sem relação direta com o Clã Doi (Genji). Clã Gotō — linhagem inferior do Clã Takeda que descendeu de Seiwa Genji. Clã Hachisuka (蜂須賀氏) — linhagem inferior do Clã Ashikaga (Genji) pelo Clã Shiba que descendia de Seiwa Genji, famoso por Hachisuka Masakatsu. Clã Haga (芳賀氏) — descendentes do Clã Kiyowara. thumb|150px|Kamon do Clã Hashiba. Clã Hashiba (羽柴氏) — também conhecido pelo seu honsei: Clã Toyotomi (豊臣氏); descendentes de Toyotomi Hideyoshi. Clã Hatakeyama (畠山氏) — descendentes de Kammu Heishi antes de 1205. Após 1205, o clã Hatakeyama converteu-se numa linhagem inferior do Clã Ashikaga que descendia de Seiwa Genji. Clã Hatano (波多野氏) — descendentes de Fujiwara Hokke. Clã Hayashi (林氏) — linhagem inferior do Clã Kōno que descendia do Príncipe Iyo, filho do Imperador Kammu. Clã Hiki (比企氏) — descendentes de Fujiwara Hokke. thumb|150px|Kamon do Clã Hōjō. Clã Hirano — descendentes do Príncipe Toneri, filho do Imperador Temmu, pelo Clã Kiyowara. Clã Hitotsuyanagi — linhagem inferior do Clã Kōno que descendia do Príncipe Iyo, filho do Imperador Kammu. Clã Hōjō (北条氏) — descendentes do Kammu Heishi (disputado); sem relação direta com o Clã Odawara Hōjō (北条氏) nem com o Clã Kitajō (北条氏); regentes do Shogunato Kamakura. Clã Odawara Hōjō (後北条氏) — também conhecido como Clã Go-Hōjō; descendentes do Kammu Heishi; sem relação direta com o regente Clã Hōjō (北条氏) nem com o Clã Kitajō (北条氏). Clã Homma (本間氏) — também conhecido como Clã Honma ou Clã Homma de Sado; linhagem inferior do Clã Yokoyama que descendia de Ono no Takamura (disputado). Clã Honma de Sakata (酒田本間氏) — ramo menor. Clã Honda (本多氏) — descendentes do Fujiwara Hokke; famoso por Honda Tadakatsu. Clã Hosokawa (細川氏) — linhagem inferior do Clã Ashikaga que descendia do Seiwa Genji. Família Hosokawa Keichō (細川京兆家) — família principal. Família Hosokawa Tenkyū (細川典厩家) — ramo menor. Família Hosokawa de Awa (阿wa-Hosokawa-shi) — ramo menor; descendentes de Hosokawa Akiharu. Família Hosokawa de Ōshū (奥州細川家) — ramo menor; descendentes de Hosokawa Akiuji. Clã Hotta — descendentes do Imperador Kōgen, pelo Ministro Takeshi-uchi no Sukune. Família Ichijō (一条家) — descendentes do Fujiwara Hokke. Clã Ichijō de Tosa (土佐一条氏) — linhagem inferior da família Ichijō que descendia do Fujiwara Hokke. Clã Ii (井伊氏) — descendentes do Fujiwara Hokke; famoso por Ii Naomasa e Ii Naosuke. Clã Ikeda (Genji) (池田氏) — descendentes do Seiwa Genji; sem relação direta com outros clãs chamados Ikeda. Clã Ikeda (Iyo) (伊予池田氏) — sem relação direta com outros clãs chamados Ikeda.