Maria Ana da Baviera (; Munique, 21 de março de 1551 — Graz, 29 de abril de 1608), foi arquiduquesa da Áustria como esposa de Carlos II de Áustria.
Família Ela era a filha do duque Alberto V da Baviera e da arquiduquesa Ana de Áustria.
Seus avós paternos Guilherme IV da Baviera e Maria Jacobeia de Baden-Sponheim. Já seus avós maternos foram o imperador Fernando I do Sacro Império Romano-Germânico, e Ana da Boêmia e Hungria, filha do rei Vladislau II da Hungria.
Biografia Maria Ana contraiu matrimônio com seu tio materno Carlos II de Áustria, com quem teve quinze filhos.
Descendência Fernando de Habsburgo (1572). Arquiduque da Áustria.
Ana de Áustria (Graz, 16 de agosto de 1573 – Varsóvia, 2 de fevereiro de 1598). Arquiduquesa da Áustria, casada com Sigismundo III Vasa, Rei da Polônia.
Maria Cristina de Habsburgo (1574–1621). Arquiduquesa da Áustria.
Catarina de Habsburgo (1576–1595). Arquiduquesa da Áustria.
Isabel de Habsburgo (1577–1586). Arquiduquesa da Áustria.
Fernando II (Graz, 9 de julho de 1578 – Viena, 15 de fevereiro de 1637). Arquiduque da Áustria. Duque de Estíria (1590), Rei da Boêmia (1617), Rei da Hungria (1618) e Imperador Romano-Germânico (1619). Casado com Maria Ana de Baviera.
Carlos de Habsburgo (1579–1580). Arquiduque da Áustria.
Gregória de Habsburgo (1581–1597). Arquiduquesa da Áustria.
Leonor de Habsburgo (1582–1620). Arquiduquesa da Áustria.
Maximiliano de Habsburgo (1583–1616). Arquiduque da Áustria.
Margarida da Áustria, Rainha da Espanha (Graz, 25 de dezembro de 1584 – El Escorial, 3 de agosto de 1611). Arquiduquesa da Áustria. Casada com Filipe III de Espanha.
Leopoldo V de Habsburgo (Graz, 9 de outubro de 1586 – Tirol, 13 de setembro, 1632). Arquiduque da Áustria, Conde do Tirol. Casado com Cláudia de Médici.
Constança de Habsburgo (Graz, 24 de dezembro de 1588 – Varsóvia, [10 de julho de 1631). Arquiduquesa da Áustria. Casada com Sigismundo III Vasa da Polônia.
Maria Madalena de Áustria (Graz, 7 de outubro de 1589 – Florença, 1 de novembro de 1631). Arquiduquesa da Áustria. Casada com Cosme II de Médici, Grão-Duque da Toscana.
Carlos de Habsburgo (1590–1624). Arquiduque da Áustria.
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