A Linha tronco da Estrada de Ferro Araraquara (parte da atual EF 364) possui 421 km de extensão, ligando Araraquara a Santa Fé do Sul. Até 1973, a linha tronco chegava a estação de Presidente Vargas em Rubinéia. Com a construção da Usina Hidrelétrica de Ilha Solteira, o trecho final da linha tronco foi inundado, sendo desativado.
História esquerda|200x200px|Marca emblemática da Estrada de Ferro Araraquarense Sua construção teve início em 9 de novembro de 1896 , na cidade de Araraquara, sendo que seu projeto inicial seria a ligação desta com a então Vila de Ribeirãozinho (atualmente a cidade de Taquaritinga) em um total de 82 quilômetros. Em 1 de outubro de 1898 foi inaugurada o trecho inicial entre Araraquara e Itaquerê (hoje Bueno de Andrade), com 25 quilômetros de extensão. No ano seguinte a linha atingiria Matão e somente em 7 de dezembro de 1901 chegaria a Taquaritinga, concluindo o projeto inicial. Posteriormente a ferrovia foi sendo ampliada, mas devido aos problemas financeiros ocorridos em 1902 e 1912 na EF Araraquara (que culminaram na falência da empresa e sua encampação pelo estado de São Paulo 1919), a ferrovia, que chegaria ao em 1912 na cidade de São José do Rio Preto, teve sua expansão paralisada por 21 anos.
Nas décadas de 30, 40 e 50 a Estrada de Ferro Araraquara recebeu um pesado investimento do estado. As obras de expansão foram retomadas em 1933, sendo concluídas em 1952 quando a linha alcançou Presidente Vargas (atual Rubinéia), situada às margens do Rio Paraná. Após ter sua expansão concluída, foram iniciadas obras de retificação de trechos, modernização de estações existentes e abertura de novas estações, aquisição de novo material rodante e rebitolamento das vias (de 1,00m para 1,60m) para integrar a malha da EF Araraquara à da Linha Tronco da Companhia Paulista que possuía bitola de 1,60m.
Em 10 de novembro de 1971 a Estrada de Ferro Araraquara foi absorvida pela Fepasa. Com a construção da Usina Hidrelétrica de Ilha Solteira, o trecho final da linha tronco foi inundado, sendo a estação de Presidente Vargas desativada em 1973. Com isso o ponto final da linha tronco passou a ser a estação de Santa Fé do Sul.
A linha tronco foi ligada a nova linha da Ferronorte em 29 de maio de 1998, quando foi inaugurada a ponte rodoferroviária SP-MS que interligou as cidades de Rubinéia e Aparecida do Taboado. Nesse mesmo ano a Fepasa é incorporada à Rede Ferroviária Federal, posteriormente é efetuada a concessão do transporte de cargas à iniciativa privada. Em São Paulo, a maior parte da malha da extinta Fepasa (incluindo a linha Tronco Araraquara- Santa Fé do Sul) foi concedida à Ferroban em 1999.
A Ferroban operou de forma provisória o serviço de trens de passageiros entre Araraquara e São José do Rio Preto até 15 de março de 2001, quando foi cancelado. Em 2002 a Ferroban passou a fazer parte da Brasil Ferrovias S/A, empresa que foi adquirida pela América Latina Logística (ALL) em 2006. Atualmente, a concessão do transporte de carga dessa ferrovia é operada pela Rumo Logística, empresa que incorporou a ALL em 2014.
Em 4 de março de 2021, a Rumo Logística inaugurou a operação da Ferrovia Norte-Sul, que se conectou à linha tronco da EFA em Estrela d'Oeste. As conexões com a Ferronorte e a Norte-Sul fazem dessa ferrovia parte do principal corredor logístico do agronegócio brasileiro, ligando o Centro-Oeste ao Porto de Santos.
Trechos abertos ao tráfego
Trecho Data de AberturaComprimento (km)Araraquara - Itaquerê (atual Bueno de Andrade)1 de outubro de 189825Itaquerê - Matão16 de março de 189916Matão - Santa Ernestina1 de abril de 190122Santa Ernestina - Taquaritinga7 de dezembro de 190119Taquaritinga - Cândido Rodrigues1 de setembro de 190825Cândido Rodrigues - Fernando Prestes22 de fevereiro de 190910Fernando Prestes - Santa Adélia15 de junho de 190915Santa Adélia - Pindorama1 de janeiro de 191017Pindorama - Catanduva17 de maio de 191011Catanduva - Catiguá29 de novembro de 191014Catiguá - Uchoa20 de novembro de 191123Uchoa - Cedral1 de fevereiro de 191213Cedral - Rio Preto10 de junho de 191220Rio Preto - Mirassol4 de março de 193319Mirassol - Bálsamo1 de março de 194113Bálsamo - Engenheiro Balduíno1 de setembro de 194114Engenheiro Balduíno - Cosmorama15 de junho de 194332Cosmorama - Votuporanga10 de dezembro de 1944?Votuporanga - Fernandópolis17 de dezembro de 1949?Fernandópolis - Estrela D'Oeste 1 de maio de 1951? Estrela D'Oeste - Jales21 de agosto de 1951?Jales - Presidente Vargas (atual Rubinéia)10 de outubro de 1952?
Alargamento da via
Ligações externas História da EF Araraquara Estrada de Ferro Araraquara - Linha Tronco - no site estações ferroviárias do Brasil
Tronco Categoria:Estrada de Ferro Araraquara