Sérgio Danilo Junho Pena (Belo Horizonte, 1947) é um médico geneticista brasileiro e colunista da revista Ciência Hoje.
Formado em Medicina pela Faculdade de Medicina da Universidade Federal de Minas Gerais, fez Doutorado no Department of Human Genetics da University of Manitoba, Canadá (1977) e pós-doutorado no Institute for Medical Research em Mill Hill, Londres. Atualmente é Professor Titular do Departamento de Bioquímica e Imunologia da Universidade Federal de Minas Gerais. com experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Humana e Médica, atuando principalmente em temas tais como diversidade genômica humana, formação e estrutura da população brasileira e aplicação de testes baseados na PCR para diagnóstico de doenças humanas. Também é Diretor do Laboratório de Genômica Clínica da Faculdade de Medicina da UFMG e Diretor Científico do GENE - Núcleo de Genética Médica. É membro do Conselho Nacional de Ciência e Teconologia e da Academia Brasileira de ciências. Dentre outras instituições, presidiu a Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, o Programa Latino-Americano do Genoma Humano e o Comitê Sul-Americano do Projeto de Diversidade Genômica Humana.
Sérgio Danilo Pena e sua equipe da UFMG tem desenvolvido importantes pesquisas sobre a composição genética da população brasileira, cujos resultados apontam para a falácia do conceito de raça do ponto de vista biológico.
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