miniaturadaimagem|O túmulo do Ali Açajade em Albaqui, Medina. Alega-se que a árvore genealógica de Ali Khamenei descende dele. A família Khamenei (persa: خاندان خامنهای) ou dinastia Khamenei está entre as famílias iranianas azeris Saíde que afirmam ser descendentes do quarto imã do Islã, Ali ibn Husayn Zayn al-Abidin (persa/ árabe: علی بن حسین, زین العابدین) (conhecido como Imam Sajjad) —de acordo com a "árvore genealógica Khamenei". Seus locais de residência eram/são no Azerbaijão (Irã), Najaf, Tafresh, etc.
Seyyed Ali Khamenei, o líder supremo do Irã, era o membro mais poderoso da família política Khamenei. Sua descendência, conhecida como "Sadat-e Hosseini", também está ligada ao terceiro Imã, Husayn ibn Ali. Um documentário da Al-Manar TV, transmitido em março de 2020, afirmou que Khamenei era o 38º descendente do profeta islâmico Maomé por meio de sua linhagem.
O pai de Seyyed Ali Khamenei era Seyyed Javad Khamenei,Biography of Ayatollah Khamenei radiofarda.com Retrieved 21 September 2019MarkazeAsnade EnqelanEslami --Arshiv (Document Center Archive), No. 1225 e seu avô paterno era Seyyed Hussein, que foi enterrado em Najaf, Iraque (no cemitério de Wadi-us-Salaam). O pai de Seyyed Hussein era Seyyed Mohammad Hosseini Tafresshi, que era considerado um Saíde de Aftasi, cuja árvore genealógica estava ligada a Sultan-al-Ulama Ahmad (também conhecido como Seyyed Ahmad).
Ali Khamenei 200px|thumb|Mojtaba Khamenei, o Líder Supremo do Irão, desde fevereiro de 2026 Ali Khamenei casou com com Mansoureh Khojasteh Bagherzadeh, com quem teve seis filhos; quatro filhos (Mostafa, Mojtaba Khamenei, Masoud e Meysam) e duas filhas (Boshra e Hoda). Um de seus filhos, Mojtaba, casou-se com uma filha de Gholam-Ali Haddad-Adel. Seu filho mais velho, Mostafa, é casado com uma filha de Azizollah Khoshvaght. Outro filho, Masoud, é casado com a filha de Mohsen Kharazi. Ele tem três irmãos, incluindo Mohammad Khamenei e Hadi Khamenei. Uma de suas quatro irmãs, Badri Hosseini Khamenei (esposa do dissidente Ali Tehrani), fugiu para o exílio na década de 1980.
A sua esposa, Mansoureh Khojasteh Bagherzadeh, morreu a 2 de março de 2026, dias depois do assassinato de Khamenei e depois de ter sofrido ferimentos nos ataques das forças dos Estados Unidos e de Israel.
Árvore genealógica
Javad Khamenei (1895–1986) Mohammad Khamenei (1935) Ali Khamenei (1939–2026), casou com Mansoureh Khojasteh Bagherzadeh (1947–2026) Mostafa Khamenei (1965) Mojtaba Khamenei (1969) Masoud Khamenei (1974) Badri Khamenei (1942/1943), casou com Ali Tehrani (1926–2022) Farideh Moradkhani (1971) Hadi Khamenei (1948)
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