El fútbol base del Club Deportivo Guadalajara hace referencia al conjunto de equipos que participan en categorías inferiores a la Primera División de México y que generalmente no cuentan con derecho a ascenso. Su principal objetivo es nutrir de jugadores las filas del primer equipo del Club Deportivo Guadalajara, fomentando los valores de la institución y proporcionando al jugador una formación integral.
Gracias al gran trabajo realizado por la institución en sus fuerzas básicas, jugadores que se convirtieron en grandes figuras en la Época del Campeonísimo del Guadalajara donde el primer equipo rojiblanco tuvieron primero su paso por los equipos filiales; otros incluso lograron migrar en algunas de las mejores ligas del mundo. Jugadores como Sabás Ponce, Jose Villegas, Guillermo Sepúlveda, Salvador Reyes Monteón, Isidoro Díaz, Juan Jasso, Jaime Gómez, Crescencio Gutiérrez, Javier Valdivia, Raúl Arellano, Fernando Quirarte, Joel Sánchez, Paulo César Chávez, Alberto Medina, Omar Bravo, Javier "Chicharito" Hernández, Carlos Salcido, Carlos Vela, Marco Fabián de la Mora, Miguel Ángel Ponce y Jesús Sánchez se formaron en las fuerzas básicas del equipo.
Fuerzas Básicas
Años 1910 Desde principios de la década de 1910 se tienen registros de torneos realizados para equipos de fuerzas inferiores en el estado de Jalisco, Guadalajara participó en varios de estos con equipos formados con jugadores de menor edad y que no participaban en juegos con en el equipo principal, por lo general estos equipos recibían el nombre de Reservas y llevaban el mismo nombre que el Club de Primera Fuerza.
El primer equipo que presentó cierta autonomía y fue registrado como filial inferior del Guadalajara fue el «Club Colonias» el cual disputaba sus partidos en el torneo de Segunda Fuerza de Jalisco.
Para la temporada 1918-19 de la Primera Fuerza de la Liga de Occidente se registra un nuevo equipo sucursal, el cual llevaba por nombre «Ciudad de México». Dicho equipo estaba compuesto por integrantes del Club Guadalajara, que no tuvieron lugar en el primer equipo. Jugaba con uniforme blanco y sus integrantes fueron Ramiro Vázquez, Anastasio Morales, Enrique Macías, Nicolás Macías, Ricardo Sapien, Gabriel Amezcua, Gregorio Espinosa, Salvador Mejía, J. de Jesús Beltrán, Jesús González R. y Agustín Romano. Al finalizar la temporada el equipo se desintegra y no vuelve a participar en un torneo de primera fuerza.Fecha: 15-agosto-1982, Titulo:El Informador, Pais: México, Página:29Fecha: 02-noviembre-1918, Titulo:El Informador, Pais: México, Página:4
Años 1920 Con el tiempo en el club empezaron a surgir varias categorías de Fuerzas Básicas que iban desde Infantiles, Juveniles, Especial Juvenil, hasta llegar a reservas donde se encontraban los equipos desde cuarta a segunda fuerza, para después dar el gran salto y llegar al primer equipo que disputaba la Liga de Occidente. Estos equipos participaban en los torneos organizados por la Federación de Jalisco para cada una de sus divisiones respectivamente y su división hasta Juvenil se basaba únicamente en edad, una vez llegados a reservas el talento era lo que hacía emerger a un jugador hasta la primera fuerza.
En 1926 surge una nueva filial del Guadalajara que presentaba cierta autonomía en relación con el club de primera fuerza, su nombre fue «Club Deportivo Reforma» y participó en la liga de Primera Fuerza del campeonato de Jalisco en 1926-1927, esto debido al Cisma que se presentó en la liga jalisciense. Después de este torneo la liga volvió a unirse por lo que el Reforma pasó a jugar en divisiones inferiores.
Años 1930 En los años 1930, el equipo de segunda fuerza del Club Guadalajara, logró conquistar en dos ocasiones el título del campeonato oficial de Segunda Fuerza, organizado por la Federación de Occidente, esto fue en las temporadas 1934-35 y 1937-38. En 1939 el mismo equipo logra obtener el campeonato de Segunda Categoría de Occidente.
Años 1940 Durante estos años las fuerzas básicas del club estuvieron nutridas por jóvenes de ligas rurales como la liga interparroquial, y de equipos como el SUTAJ, Corona, Imperio y el Río Grande, de donde saldrían grandes figuras para el equipo que más adelante formarían al famoso Campeonísimo.
Años 1970 En la época de los 1960s y principios de los 1970s, se jugaba el torneo nacional de reservas como preliminar de los partidos del equipo profesional. En ese período surgen figuras como Pepe Martínez.
En 1975, el torneo de reservas desaparece, y Chivas adhiere su equipo de reservas a la tercera división con el nombre de Club Deportivo Tapatío. El equipo hace una muy buena temporada, ganando la mayoría de los juegos, por lo que se le da el ascenso a segunda división para el siguiente torneo.
En ese equipo de reservas brillaban jugadores de 16 a 17 años, entre ellos Fernando Quirarte, quien anotó muchos goles de cabeza en jugadas de balón detenido, y Héctor Prieto. En la temporada 1976 siendo Horacio Troche el entrenador del primer equipo, dieron el salto a primera división Héctor Prieto, el Snoopy Pérez y Fernando Quirarte.
Ya con el equipo en segunda división dirigido por el "Jamaicón" Villegas, tienen temporadas regulares hasta la temporada 1979-80 donde pierden la final contra Morelia. En ese equipo la mayoría era jugadores sub-20, estando entre la alineación titular Celestino Morales, Carlos Rizo, Demetrio Madero, José Gutiérrez, Jaime León, Jaime Navarro Onofre, Rodolfo Rodríguez, Alejandro Guerrero, Néstor De la Torre, Eduardo De la Torre y el Javier Pillo Dávalos.
Años 1980 En la temporada 1980-81 siendo Diego Mercado entrenador del Tapatío, llegan al primer equipo Madero, Gutiérrez y Guerrero. Celestino Morales ya había salido a la banca desde una temporada anterior siendo el entrenador Carlos Miloc después de que este dio de baja al portero titular Jorge García Rulfo dándole la titularidad del primer equipo a Javier Ledesma.
A la llegada de Albero Guerra en 1982, prácticamente todo el plantel del equipo Tapatío asciende al primer equipo. Después de esto, el equipo fue regular en la división de ascenso y los únicos logros fue la incursión de algunos jugadores al primer equipo como Luis Manuel Díaz, Armando González, Diego Silva, Gutiérrez Aldaco, Ignacio Vázquez, C. Hernández, Mario Califas Arteaga, R. Cadena, y Manuel Vidrio entre otros.
Durante estos años también se dio la incorporación del Club Deportivo Alianza, equipo filial en Tercera División, el cual disputaba sus partidos en la población de Sayula, Jalisco. En esta filial tuvieron participación algunos elementos de las fuerzas básicas como Mario Califas Arteaga y Manuel Vidrio.
Años 1990 A principios de los 1990s, se reinicia el torneo nacional de reservas, ahí chivas arma un trabuco y en la temporada 1992-93 se coronan ganando 3-0 a las reservas del Toluca en el partido preliminar de la Final León - Puebla. La mayoría de estos jugadores pasaron de reservas al primer equipo sin pasar por el Tapatío.
En ese equipo ya muchos jugadores habían debutado en primera división pero todavía eran muy jóvenes, la mayoría fueron seleccionados (sub-20 en 1991 y 1993, olímpicos en 1992 e incluso sub-17 en 1994).
Resaltaron jugadores como Ricardo Cadena, Manuel Vidrio, Guillermo "Campeoncito" Hernández, Joel Sánchez, Paulo César Chávez, Gabriel García, Mario Arteaga, Everaldo Begines, Ignacio Vázquez y Manuel Martínez.
En 1994, se constituye la Primera "A" y se establece como la segunda categoría del Sistema de ligas de fútbol en México. El equipo Tapatío permanece en Segunda División, por lo que automáticamente pasa a disputar el campeonato en la tercera liga en importancia.
En 1996, llega José Luis Real a la institución y reestructura el equipo. A partir de 1999 el equipo Tapatío, dirigido primero por Sergio Pacheco y después por Juan Carlos Chávez, logra grandes campañas en Segunda División, disputando cuatro finales. Para 2001, la institución rojiblanca decide adquirir la franquicia de Primera "A" de los Gallos de Aguascalientes, y con ello se da el ascenso del Tapatío a esta división.
Desde la llegada de Real, el equipo produjo grandes jugadores pero el divorcio empresarial entre la Promotora Deportiva y la Asociación Civil que manejaba el Club, no permitía la salida de estos, aun así llegaron al primer equipo jugadores como Juan Pablo Alfaro,Erick Lopez, Omar Bravo y Alberto Medina.
Paralelamente existieron otros proyectos como el Nacional Tijuana y Chivas Tijuana, equipo que surge en 1997 y desaparece en 1999, dejando como legado un subcampeonato de Primera "A" en la temporada Invierno 1998. Así mismo en Tercera y Segunda División participó el equipo Chivas Rayadas, creado en 1993 por iniciativa de la Promotora, y que lograría ser campeón de Copa de la Segunda División, campeón de Filiales de la Segunda División, campeón de Filiales de la Tercera División y Campeón de Campeones de la Tercera División.
Años 2000 220px|thumb|Chicharito Hernández en las inferiores del Guadalajara en 2006. El Tapatío juega el Apertura 2003 en la Primera "A", llegando a la liguilla pero siendo eliminado por el Irapuato. La siguiente temporada llega a la final que pierde contra el León, siendo su alineación la siguiente: Talavera, M. Jiménez, Carlos Ortega, Alfaro, Rodríguez, Salcido, Vela, N. Gutiérrez, Gutiérrez, Mendoza, Romo, Sandoval.
De 2004 a 2005, el equipo de segunda división con las generaciones 1985-87 y reforzado con 3 jugadores generación 1983 Camcho, Ramos, Borboa, ganaron dos títulos en segunda división de filiales, Atlas y Santos Laguna fueron los rivales. En estos equipos campeones estaban jugadores como Renato Rivera, Héctor Gómez, Max Pérez, Marco Parra, Christian Armas, Sergio Rodríguez, Álvaro Estrada, y ocasionalmente jugaban algunos de la generación 1987 como Ochoa, Galván, Solís, Báez, Padilla, Fernando Mendoza y Zárate.
El equipo de segunda división, Chivas San Rafael, logra el título del campeonato de filiales en el apertura 2006, jugando con la generación 1989. Jugadores como Nava, Ocampo, Salazar, Cárdenas, Marco De León, y algunos refuerzos mayores le ganaron a las reservas de Toluca para coronarse.
Mientras tanto en reservas, el equipo gana el Clausura 2006 (último torneo de reservas) derrotando al Atlas, jugando en su mayoría elementos de la generación 86, 87 y 88 como el "Chicharito" Hernández, "Chore" Mejía, Ayala, Galván, Padilla, Valdovinos, Arias, Ledesma, De Luna, Báez, Ochoa, Estrada, Solís, Zárate y Mendoza.
En julio de 2006 Chivas terminó el campeonato Nacional Juvenil de Fuerzas Básicas en Aguascalientes como Campeón de la categoría 89-90, al vencer en la Final a los Rayos del Necaxa, por 2-1 con anotaciones de Mauricio Curiel y Antonio Salazar, mientras que la categoría 91 también levantaron el trofeo de número uno a nivel nacional, al vencer 1-0 al Pachuca con anotación de Ulises Dávila.
En tercera división, la generación 1988 ganó el campeonato derrotando a Toluca en el 2005 (Araujo, Ledesma, el Chore, Esparza, Chicharito, Carlos Vela etc). Una temporada después repitió el título la generación 1989 derrotando a Morelia. Un torneo después la generación 1990 quedaría como subcampeón, y la generación 1991 llegaría hasta la instancia de semifinales.
Mientras tanto en divisiones inferiores desde la Cuarta división hasta las Escuelas de Fuerzas básicas, Chivas ha logrado una serie de reconocimientos y títulos. La Escuela de Fútbol Chivas Gigantera, logró durante dos años consecutivos (2005-2006) consolidarse como la institución más ganadora en la Liga Córdica y Metropolitana, donde participan los grupos de Fuerzas Básicas del fútbol de Jalisco. En el Clausura 2006 se coronaron campeones los equipos de la Cuarta División de la Categoría 90 y subcampeón en la Cuarta División A, modalidad 91.