La Copa Intertoto 1990 es la 30.ª edición de este torneo de fútbol a nivel de clubes de Europa. Participaron 44 equipos de asociaciones miembros de la UEFA.

No se decretó un ganador específico del torneo en vista de que el torneo solo consiste en fase de grupos y cada equipo ganador de grupo ganaba la copa, pero se considera campeón al Lech Poznań de Polonia por ser el club que mostró el mejor rendimiento durante el torneo.

Fase de grupos Los 44 equipos fueron distribuidos en 11 grupos de 4 equipos cada uno, en donde el vencedor de cada grupo se llevó la copa y el premio monetario del torneo.

Grupo 1 Club G E P GF GC Pts. Neuchâtel Xamax 5 0 1 9 2 10 Sparta Praga 4 1 1 13 9 9 Lyngby BK 2 0 4 9 12 4 Admira Wacker Wien 0 1 5 7 15 1  XAM SPA LYN AWW XAM 0-1 2-0 1-0 SPA 0-3 1-0 4-1 LYN 1-2 2-4 4-2 AWW 0-1 3-3 1-2

Grupo 2 Club G E P GF GC Pts. Tirol Innsbruck 4 1 1 12 6 9 Bochum 3 1 2 8 6 7 St. Gallen 3 1 2 8 7 7 Slavia Sofia 0 1 5 3 12 1  TIR BOC STG SLA TIR 1-0 1-1 4-1 BOC 2-3 2-1 1-0 STG 2-1 0-2 2-1 SLA 0-2 1-1 0-2

Grupo 3 Club G E P GF GC Pts. Lech Poznań 5 0 1 15 7 10 Maccabi Haifa 3 2 1 14 5 8 Siófok 2 1 3 5 9 5 Bnei Yehuda 0 1 5 5 18 1  LEC HAI SIO BNE LEC 1-0 3-1 3-0 HAI 4-2 3-0 2-2 SIO 0-2 0-0 3-1 BNE 2-4 0-5 0-1

Grupo 4 Club G E P GF GC Pts. Slovan Bratislava 4 1 1 17 3 9 Vejle BK 4 1 1 11 9 9 IFK Norrköping 1 2 3 9 16 4 MTK 1 0 5 5 14 2  SLO VEJ NOR MTK SLO 5-1 7-0 2-0 VEJ 1-0 2-2 4-1 NOR 1-1 1-2 2-0 MTK 0-2 0-1 4-3

Grupo 5 Club G E P GF GC Pts. Malmö FF 3 2 1 10 4 8 Kaiserslautern 2 3 1 11 9 7 Energie Cottbus 3 1 2 10 10 7 Bohemians Praga 0 2 4 2 10 2  MAL KAI ENE BOH MAL 1-1 5-0 1-0 KAI 3-1 2-2 1-1 ENE 0-2 4-0 2-0 BOH 0-0 0-4 1-2

Grupo 6 Club G E P GF GC Pts. GAIS 3 2 1 13 7 8 Brøndby 3 1 2 15 11 7 Karlsruhe 2 1 3 12 12 5 Hansa Rostock 2 0 4 7 17 4  GAI BRO KSC HAN GAI 3-2 1-1 2-1 BRO 1-1 4-1 2-0 KSC 2-0 3-4 4-1 HAN 0-6 3-2 2-1

Grupo 7 Club G E P GF GC Pts. FC Luzern 4 1 1 13 8 9 Plastika Nitra 2 3 1 6 3 7 Örebro 2 2 2 8 6 6 Tatabánya 0 2 4 7 17 2  LUC NIT ÖSK TAT LUC 1-1 3-0 3-2 NIT 0-2 1-0 4-0 ÖSK 2-0 0-0 5-1 TAT 3-4 0-0 1-1

Grupo 8 Club G E P GF GC Pts. Vienna 3 2 1 7 5 8 AGF Aarhus 2 3 1 6 3 7 Vasas 2 2 2 4 5 6 Gefle IF 0 3 3 3 7 3  FIR AAR VAS GIF FIR 1-1 0-1 2-1 AAR 1-2 2-0 0-0 VAS 0-0 0-2 1-1 GIF 1-2 0-0 0-2

Grupo 9 Club G E P GF GC Pts. Chemnitz 3 2 1 4 2 8 Sturm Graz 2 3 1 9 3 7 Fortuna Düsseldorf 2 2 2 6 6 6 Petrolul Ploiești 1 1 4 6 14 3  CHE STU FOR PET CHE 0-0 2-0 1-0 STU 0-0 0-0 6-1 FOR 2-0 1-0 1-1 PET 0-1 1-3 3-2

Grupo 10 Club G E P GF GC Pts. Bayer Uerdingen 3 2 1 11 7 8 Olimpija Ljubljana 2 2 2 10 8 6 Dynamo Berlin 2 1 3 7 9 5 Grasshopper Club 2 1 3 10 14 5  UER OLI BER GRA UER 2-1 3-0 2-2 OLI 1-1 1-0 4-1 BER 1-2 1-1 2-1 GRA 2-1 3-2 1-3

Grupo 11 Club G E P GF GC Pts. OB 2 4 0 12 6 8 Pirin Blagoevgrad 3 2 1 8 5 8 Osijek 2 1 3 9 10 5 Sportul București 0 3 3 6 14 3  OSK PIR OSI SPO OBK 2-0 5-1 2-2 PIR 1-1 2-1 2-0 OSI 0-0 0-2 3-1 SPO 2-2 1-1 0-4

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