La Vysshaya Divizion 1999 fue la octava edición de la máxima categoría del fútbol ruso desde la disolución de la Unión Soviética. El campeón fue el Spartak Moscú, que ganó su séptimo título. El goleador del campeonato fue Georgi Demetradze, del Alania Vladikavkaz.
Tabla de posiciones Pos.EquipoPtsPJPGPEPPGFGCDG35px1.Spartak Moscú||72||30||22||6||2||75||24||+51 |- style="background:#C5D2E4;" |35px||2.||align=left|Lokomotiv Moscú||65||30||20||5||5||62||30||+32 |- style="background:#FEDF68;" |35px||3.||align=left|CSKA Moscú||55||30||15||10||5||56||29||+27 |-style="background:#FEDF68;" |35px||4.||align=left|Torpedo Moscú||50||30||13||11||6||38||33||+5 |-style="background:#FEDF68;" |35px||5.||align=left|Dinamo Moscú||44||30||12||8||10||44||41||+3 |- style="background:#FEDF68;" |35px||6.||align=left|Alania Vladikavkaz||43||30||12||7||11||54||45||+9 |- style="background:#96FFFF;" |||7.||align=left|Rostselmash||41||30||11||8||11||32||37||-5 |- style="background:#96FFFF;" |||8.||align=left|Zenit||39||30||9||12||9||36||34||+2
| ||9.||align=left|Uralan Elista|||36||30||10||6||14||27||34||-7
| ||10.||align=left|FC Saturn|||34||30||8||10||12||30||38||-8
| ||11.||align=left|Lokomotiv Nizhny Novgorod||33||30||9||6||15||33||48||-15
| ||12.||align=left|Krylia Sovetov||31||30||8||7||15||39||49||-10
| ||13.||align=left|Rotor Volgogrado|||31||30||7||10||13||36||51||-15
| ||14.||align=left|Chernomorets Novorossiysk||29||30||7||8||15||30||49||-19 |- style="background:#FFC0D0;" |||15.||align=left|Zhemchuzhina Sochi||26||30||5||11||14||29||55||-26 |- style="background:#FFC0D0;" |||16.||align=left|Shinnik Yaroslavl||24'''3059162145-24
Pts = Puntos; PJ = Partidos jugados; PG = Partidos ganados; PE = Partidos empatados; PP = Partidos perdidos; GF = Goles a favor; GC = Goles en contra; DG = Diferencia de gol
35px Clasificado para la fase de grupos de la Liga de Campeones de la UEFA 2000-01 35px Clasificado para la tercera ronda previa de la Liga de Campeones de la UEFA 2000-01 35px Clasificado para la primera ronda de la Copa de la UEFA 2000-01 Clasificado para la Copa Intertoto de la UEFA 2000 Descendido a la '''Primera División 2000
border|50px|RusiaCampeónSpartak Moscú7° título
Goleadores #JugadorGolesEquipo1|| Georgi Demetradze21||Alania2 Andréi Tíjonov19Spartak3 Vladímir Kulik15CSKA4 Dmitri Loskov14Lokomotiv M. Oleg Teriojin14Dinamo6 Arsén Avákov13Lokomotiv NN7 Viacheslav Kamóltsev12Torpedo Serguéi Semak12CSKA Oleg Vereténnikov12Rotor10 Yegor Titov11Spartak
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