La Casa Real Incaica, denominada también Ayllu Real,Es una forma alternativa castellanizada parcialmente del quechua equivalente a "Qhapaq Ayllu" o su forma fonéticamente castellanizada de "Cápac Ayllu". Cápac AylluNo se debe confundir al igual que su variante en quechua con el presunto nombre homónimo atribuido al ayllu del emperador Túpac Inca Yupanqui. Es equivalente a "Ayllu Real".(en quechua clásico: Qhapaq Ayllu lit. "linaje Real o noble") o Familia Imperial Incaica, fue el clan familiar Real fundado por Manco Cápac, por lo que agrupaba las ramas Hurin y Hanan Cuzco así como sus respectivas subramas o ayllus de cada gobernante.
Algunas posturas como la que asegura el investigador Donato Amado, indican que la denominación panaka se daba a las familias de los reyes-sacerdotes antiguos incas, pertenecientes a la dinastía Hurin Cuzco, en tanto la denominación de Ayllu Real corresponde a la dinastía Hanan Cuzco. En consecuencia el más elevado rango de la nobleza Inca pertenece al aillu real del Inca Huayna Cápac, cuya casa fue la última en gobernar hasta y durante la conquista hispana.
Luego de su conquista e incorporación al Imperio español, se les expulsó a las afueras de la ciudad del Cusco para asentarse en los barrios de San Jerónimo y San Sebastián. Como consecuencia del principio de pactismo, su importancia estratégica simbólica y necesidad del sistema político virreinal, la nobleza inca pasó a un régimen jurídico de excepción, reconociéndoles como sucesores legítimos de los "Reyes del Pirú" y como la principal nobleza de la República de Naturales, a la cual aspiraban muchos caciques andinos (sin ser raras las falsificaciones documentales) y algunos españoles criollos y peninsulares. La nobleza incaica sostuvo litigios con encomenderos por el recorte progresivo de sus propiedades, aunque mantuvo una importante presencia social, religiosa y cultural que se acentuó entre los siglos y (como a través del Alférez Real de los Incas), además de participar en un activismo político para la protección de los indios, con defensores como Juan Bustamante Carlos Inca y Calixto de San José Túpac Inca. Sin embargo, luego de la Rebelión de Túpac Amaru II, quedó muy debilitada por las políticas de persecusión cultural y represión social instigadas por José Antonio de Areche.
En los albores de la época republicana, principalmente en Ecuador, Bolivia y especialmente Perú, sufrieron la usurpación total de sus bienes, invalidación de sus títulos y otras reformas, las cuales le asestaron el golpe de gracia que terminó con cualquier rezago de influencia política y económica. Los descendientes de su mayorazgo o rama medular se pueden rastrear hasta nuestros días en la ciudad del Cusco, antigua capital del imperio de los incas, llamado Tahuantinsuyo o «Imperio de las Cuatro Regiones».
Descendencia del Inca Túpac Yupanqui thumb|200px|Máxima Zorreguieta, Reina consorte de los Países Bajos, descendiente de la ñusta Catalina Páucar Ocllo, quien perteneció al linaje del Inca Túpac YupanquiSiempre se es fruto de un árbol real. La Nación "Los Fernández Cornejo de Perú a Salta" de Atilio Cornejo, Rogelio Saravia Toledo y Carlos Ferrary Storni, año 2007 ISBN 9879878876, thumb|200px|Hernando Siles, Presidente de Bolivia entre 1926 y 1930. Padre del también presidente Hernán Siles Zuazo thumb|200px|José Luis Bustamante y Rivero, Presidente Constitucional del Perú de 1945 a 1948 y presidente de la Corte Internacional de Justicia entre 1967 y 1969 thumb|200px|Mario Vargas Llosa, Marqués de Vargas Llosa, novelista y ensayista peruano español. Premio Nobel de Literatura en 2010 thumb|200px|Sebastián Piñera, Presidente de Chile Descendencia de la panaca de Túpac Yupanqui
La panaca del inca Túpac Yupanqui apoyó a Huáscar en su enfrentamiento contra Atahualpa, por ello sería perseguida y diezmada parcialmente por los capitanes atahualpistas. No obstante, los sobrevivientes apoyaron a los conquistadores españoles y obtuvieron a cambio diversas mercedes y privilegios, además de cacicazgos en el Cuzco y el Alto Perú. Entre las diferentes ramas se encuentran: Familia Cusicanqui. Caciques de Pacajes y Calacoto durante la época virreinal. Entre sus descendientes se encuentran los políticos bolivianos Silvia Rivera Cusicanqui y Hernán Siles Zuazo, expresidente del país altiplánico, y Felipe Cusicanqui, artista visual y pintor chileno. Familia Fernández Cornejo, establecida originalmente en Arequipa y con presencia en Moquegua, Bolivia y Argentina. Descendían de la ñusta Catalina Páucar Ocllo,"Los Fernández Cornejo de Perú a Salta" de Atilio Cornejo, Rogelio Saravia Toledo y Carlos Ferrary Storni, año 2007 ISBN 9879878876 hija del inca Túpac Hualpa, aunque del linaje de Túpac Yupanqui, a través de su nieta Mariana de Grado Maldonado casada con Diego Fernández Cornejo y del Carpio. Entre los descendientes documentados de esta pareja se encuentran los mayores productores y comerciantes de Plata del Potosí en 1750: Joseph y Juan Fernández Cornejo y Escudero, el alcalde de Salta José Antonio Fernández Cornejo y Rendón y el primer industrial de Argentina y explorador del Río Bermejo: Coronel Cornejo Juan Adrián Fernández Cornejo y Rendón del Ingenio San Isidro, los políticos argentinos José Antonino Fernández Cornejo, Héroe de la Independencia Argentina Marcelino Cornejo, Abraham Cornejo, Abel Cornejo, Hernán Hipólito Cornejo, Julio Cornejo, Lucio Cornejo Linares, Juan Carlos Cornejo Linares, Diputado y My. de Caballería Norberto Luis Cornejo Capobianco, el Historiador Dr. Atilio Cornejo Mollinedo,https://bibliotecasyarchivosalta.gob.ar/biblioteca.php?id=3 Cantante y compositora Feli Colina Cornejo, Jorge Zorreguieta y la reina Máxima de los Países Bajos, además de los políticos peruanos Nicolás de Araníbar Fernández Cornejo, José Gregorio Paz Soldán, Toribio Pacheco, José Luis Bustamante y Rivero y Carlos Neuhaus Rizo-Patrón, incluyendo a los intelectuales y escritores igualmente peruanos: Mariano Eduardo de Rivero y Ustariz, los hermanos Mateo y Mariano Felipe Paz Soldán, Juan de Arona, José Santos Chocano y Mario Vargas Llosa.
Descendencia de Bárbola Coya Yupanqui
A través de Bárbola Coya Yupanqui, sobrina (posible nieta) de Túpac Yupanqui y mujer del conquistador García Díaz de Castro, ha quedado una vasta descendencia establecida en Chile y Argentina, entre cuyas ramas se encuentran: Familia Medina y Ramírez de Montalvo, establecida en Tucumán y con presencia en Argentina. Descendían del encomendero Diego de Medina y Díaz de Castro, hijo de Catalina Díaz de Castro Yupanqui y nieto por lo tanto del conquistador García Díaz de Castro y la palla Bárbola. Entre sus descendientes destacan los políticos y militares argentinos Gregorio Aráoz de la Madrid, Eustoquio Díaz Velez, Bernabe Aráoz, Miguel Francisco Aráoz el Caudillo Federal Alejandro de la Cruz Figueroa Aráoz y Goyechea Cornejo (bisnieto también del Coronel Juan Adrián Fernández Cornejo y Rendón), el destacado empresario Mario Lacroix Figueroa; Ramas:Buscá-Sust Figueroa, Jorge, "Los Figueroa y Mendoza y su raigambre americana, Cordoba, año 2000 Aráoz Usandivaras, Aráoz Velarde, San Millan Figueroa, Figueroa Paz, Figueroa Peña, Cornejo Lacroix, así como el escritor Raúl Vera Ocampo. Familia Villafañe y Guzmán: políticos Benjamín Villafañe y su hijo Benjamín Villafañe Chaves además Ramas Manceras Villafañe, Ponce Manceras, Ponce Humarán, Meana Ponce, Cornejo Lacroix Meana ; también Garcia de Valdez, Sanchez de Lamadrid y Villafañe. Familia Prado y Medina, establecida originalmente en Tucumán y con presencia en Chile. Descendían de Petronila de Medina y Garnica, bisnieta de la Palla Bárbola y nieta del conquistador Gaspar de Medina. Entre sus descendientes destacan Mateo de Toro Zambrano y los siguientes condes de la Conquista, a través de la familia Correa de Saa y Toro-Zambrano, así como Melchor Concha y Toro e Ignacio de la Carrera, padre de los hermanos Carrera, próceres de la independencia de Chile, . Familia Garmendia Alurralde, establecida originalmente en Tucumán y con presencia en Chile y Argentina. Descienden de Elena María Alurralde, madre de los patriotas tucumanos Ildefonso de las Muñecas y José Ignacio Garmendia y Alurralde, además de Luisa Garmendia Alurralde, esposa del general Francisco Antonio Pinto, tercer presidente de Chile y ancestros por lo tanto de importantes personajes chilenos como Aníbal Pinto, Manuel Bulnes Pinto, Gonzalo Bulnes, Fernando Ariztía Ruiz y Sebastián Piñera.
Descendencia del inca Huayna Cápac
Descendencia del inca Atahualpa
Investigaciones sustentan que el inca Atahualpa, hijo de Huayna Cápac, dejó una importante descendencia en el Ecuador. De la cual se podría nombrar al tronco familiar Proaño de Ecuador, pues el genearca de esta familia, el capitán Francisco Proaño de los Ríos, no dejó descendencia con su legítima esposa Agustina Suárez de Figueroa, pero sí la tuvo de su unión con Isabel Atahualpa Inca y María. Así dio inicio a la familia Proaño en el Ecuador. Sin embargo otras investigaciones afirman que este linaje se extinguió en el año de 1624. Lo cual estaría en duda, ya que actualmente existen descendientes de Francisco Proaño en el Ecuador y su única descendencia fue por medio de Isabel y María descendientes del Inca Atahualpa.
Descendencia de Paullu Inca thumb|right|200px|Justo Sahuaraura Inca, autor de los Recuerdos de la Monarquía Peruana (1850) thumb|200px|José Domingo Choquehuanca, escritor y político peruano de inicios de la República Es el conjunto de los descendientes de Cristóbal Paullu Inca, hijo del emperador Huayna Cápac, de quien actualmente una de sus ramas detenta el mayorazgo o descendencia directa patrilineal. Tanto por su descendencia legítima como por sus hijos legitimados por el emperador Carlos V, tenemos las siguientes ramas:
Familia Obando Tito Atauchi
Son los descendientes de Quispe Topa Inka, que asumió el nombre colonial de Bartolomé Topa Atao o Quispe Tito Atauchi, quienes durante el adoptaron el apellido Ramos Tito Atauchi y en el , el de Obando u Obando Titu Atauchi. Según el historiador John Hemming esta rama de la familia real incaica es el resultado de la unión de la descendencia de dos Casas Incas de mucha importancia o de dos hijos príncipes del emperador Huayna Capac: Paullo Inca y Titu Atauchi Inca. Sin embargo el estudio del genealogista Ronald Elward, refiere que más bien son descendientes del Canciller Titu Atauchi otro príncipe Inca hermano del emperador Huayna Capac Inca, cuya hija o nieta tuvo un hijo con el príncipe Paullo Inca, que fue legitimado por el emperador Carlos V, llamado Bartolomé Titu Atauchi. En la actualidad se destacan las siguientes 2 ramas principales: Rama Obando Titu Atauchi Inca. Descendientes de los nobles incas don Lizandro Obando (Titu Atauchi) Camero: cuyos hijos conocidos según la referida investigación del diario El Comercio de Lima, son Agripino Obando Chávez y Gregorio Obando Chávez. Herederos: Gladys Obando Montes, Sylvain Obando, Marie Angehelie Alarcón Obando, Ruth Obando Montes, José Luis Obando Montes, Jael Obando Montes, Joselyn Alarcón Obando, Tifany Zarate Obando.