Las Ligas Superiores fueron un grupo selecto de clubes de cada departamento, que se enfrentaban solamente entre sí y arrojaban un campeón y un subcampeón que accedían directamente a jugar la Etapa Departamental de la Copa Perú.
Historia En 2004 la Federación Departamental de Lambayeque creó de manera experimental la Liga Superior de Lambayeque con doce equipos participantes: Deportivo Pomalca, José Pardo, Universidad de Chiclayo, San Lorenzo, Rayos X-Medicina, Mariscal Sucre de Ferreñafe, Defensor Chongoyape, Sport Victoria de Túcume, Unión Juventud, Unión Tumán, Independiente de La Victoria y Deportivo Cachorro de Motupe.Hoy sale el fixture Terminado el torneo el primer campeón fue Universidad de Chiclayo que clasificó a la Etapa Departamental.¡Salió el campeón! Al año siguiente la Federación Peruana de Fútbol emite la resolución Nº002-FPF-2005 que declara como oficiales los torneos siguientes de dicha Liga Superior.Resolución Nº002-FPF-2005
En los demás departamentos las Ligas Superiores fueron creadas oficialmente en 2009. Ese año fueron nueve las Federaciones Departamentales que decidieron adoptar este formato: Arequipa, Ayacucho, Cajamarca, Huánuco, Lambayeque , Pasco, Piura, Puno y Tumbes.
En 2010, el departamento de Cusco y Callao adoptar su Liga Superior y la Federación Departamental de Ayacucho decidió la suspensión de la Liga Superior de Ayacucho para esta temporada 2010 por la falta de participantes y debido a que el torneo había perdido el interés de la temporada anteriores, debido a las buenas acciones de Inti Gas Deportes en la Primera División Peruana. Al año siguiente Ancash decidió crear su Liga Superior mientras que Arequipa, Cusco, Huánuco y Pasco dejaron de organizarla.
En 2023 sólo el Departamento de Piura mantienía activa su respectiva Liga Superior. Al año siguiente no fue implementada por lo que quedó discontinuado.
Campeones Liga Superior de Áncash Temporada Campeón Subcampeón Tercero2011Universidad Nacional Santiago Antúnez de Mayolo (Huaraz, Huaraz) Universidad San Pedro (Chimbote, Santa) Unión Juventud (Chimbote, Santa)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Barrios Altos (, Carhuaz). Cultural Casma (, Casma). Deportivo Cushin (, Huari). | style="width:370px" | Escuela de Minas (, Recuay). Santa Rosa (Cátac, Recuay). Juventud Tambo Real (, Santa). | style="width:370px" | SiderPerú (Chimbote, Santa). Sport Rosario (Huaraz, Huaraz). Juventud La Unión (Chimbote, Santa).
Liga Superior de Arequipa Temporada Campeón Subcampeón Tercero2009Unión Minas (Orcopampa, Castilla) Juventus Corazón (Majes-Pedregal, Caylloma) Deportivo TISUR (Mollendo, Islay)2010 Sportivo Huracán (Arequipa, Arequipa) FBC Aurora (Arequipa, Arequipa) Atlético Mollendo (Mollendo, Islay)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Inclán Sport Club (Mollendo, Islay). Social Deportivo Camaná (Camaná, Camaná). FBC Piérola (Arequipa, Arequipa). | style="width:370px" | Defensor Piérola (Camaná, Camaná). Social Corire (Corire, Castilla). Cerrito de Los Libres (Cayma, Arequipa)). | style="width:370px" | Juvenil Andino (Cayma, Arequipa). Saetas de Oro (La Joya, Arequipa). Unión Salaverry (Uchumayo, Arequipa).
Liga Superior de Ayacucho Temporada Campeón Subcampeón Tercero2008FC Pichari (Pichari, VRAEM) Juventud Gloria filial Inti Gas (Ayacucho, Ayacucho) Sport Churcampa (, Churcampa)2009 Municipal de Huamanga (, Huamanga)Froebel Deportes Club (Ayacucho, Ayacucho)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Los Legendarios Morochucos (Los Morochucos, Cangallo). Club Deportivo ElectroCentro/Productos del País (, Huanta). | style="width:370px" | Deportivo Municipal (Anco, La Mar). FC Huracán Fajardino (Huancapi, Víctor Fajardo).
Liga Superior de Cajamarca Temporada Campeón Subcampeón Tercero2009 Deportivo Municipal (, Chota) Deportivo Municipal (Santa Cruz, Cutervo) Los Inseparables (Cutervo, Cutervo)2010 Comerciantes Unidos (, Cutervo) Cultural Volante (Bambamarca, Hualgayoc) Deportivo Municipal(San Ignacio)2011 UTC (, Cajamarca) Cultural Volante (Bambamarca, Hualgayoc) Deportivo Municipal (, Chota)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Deportivo El Inca (, Cajamarca). Alianza Industrial (, Cajabamba). Club Defensor Tembladera (, Contumazá). | style="width:370px" | Unión San Ignacio (, San Ignacio). Descendencia Michiquillay (, Cajamarca). Defensor Morro Solar (Jaén, Jaén). | style="width:370px" | Carniche (Cutervo, Cutervo). Sport Universitario (, Cajamarca).
Mayor información y detalle: Liga Superior de Cajamarca 2009. Liga Superior de Cajamarca 2010.
Liga Superior del Callao Temporada Campeón Subcampeón Tercero2010 Atlético Pilsen Callao (Dulanto) José López Pasos (Carmen de la Legua - Reynoso) Juventud La Perla (Bellavista y La Perla)2011 Atlético Pilsen Callao (Dulanto) Adebami (Carmen de la Legua - Reynoso) Nuevo Callao (Carmen de la Legua - Reynoso)2012 Juventud La Perla (Bellavista y La Perla) José Gálvez (Carmen de la Legua - Reynoso) Nuevo Callao (Carmen de la Legua - Reynoso)2013 Márquez F.C. (Ventanilla) Juventud La Perla (Bellavista y La Perla) Nuevo Callao (Carmen de la Legua - Reynoso)2014 Adebami (Carmen de la Legua - Reynoso)]Juventud La Perla (Bellavista y La Perla) No se disputó la final Somos Aduanas (Bellavista y La Perla)2015 Juventud La Perla (Bellavista y La Perla) Somos Aduanas (Bellavista y La Perla) Atlético Chalaco (Callao)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Cultural Centella (Carmen de la Legua - Reynoso). | style="width:370px" | Unión Deportiva Los Próceres (Ventanilla). | style="width:370px" | América Callao (Callao).
Liga Superior de Cusco Temporada Campeón Subcampeón Tercero2010 Deportivo Municipal Convención (Santa Ana, La Convención) Humberto Luna (, Calca) Cienciano Junior (Cusco, Cusco)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Heraldos de Uchoccarcco (Uchoccarcco, Chumbivilcas). Deportivo Municipal Espinar (Espinar, Espinar). Deportivo Inka Ollantay (Ollantaytambo, Urubamba). Estrella Juniors (Oropesa, Quispicanchi). | style="width:370px" | Unión Pumacahuina (Sicuani, Canchis). Atlético Universidad Andina (Wanchaq, Cusco). Deportivo Municipal Yanaoca (Yanaoca, Canas).
Liga Superior de Huánuco Temporada Campeón Subcampeón Tercero2008Alianza Universidad (Huánuco, Huánuco) León de Huánuco (Huánuco, Huánuco) Deportivo Municipal (Huácar, Ambo).2009 Alianza Universidad (Huánuco, Huánuco) León de Huánuco (Huánuco, Huánuco) Lolo FC (Aucayacu, Leoncio Prado)2010 Bella Durmiente (, Leoncio Prado) Alianza Universidad (Huánuco, Huánuco) Cosmos de Ripán (Ripán, Dos de Mayo)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Universidad Nacional Agraria de la Selva (Rupa Rupa, Leoncio Prado) Unión Castillo Grande (, Leoncio Prado). Señor de Chacos (San Rafael, Ambo). | style="width:370px" | Unión Bambamarca (, Tocache, San Martín). Unión Chaglla (Chaglla, Pachitea). Deportivo Auragshay (Panao, Pachitea).
Liga Superior de Lambayeque Temporada Campeón Subcampeón Tercero2004 Universidad de Chiclayo ( ,Chiclayo) Cachorro (Motupe) 2005 Juan Aurich 2006 2007Cruzada Deportiva (Eten, Chiclayo) Deportivo Pomalca (Chiclayo, Chiclayo) 2008 Universidad Señor de Sipán (Chiclayo, Chiclayo) Deportivo Pomalca (Chiclayo, Chiclayo) Universidad de Chiclayo2009 Deportivo Pomalca (Chiclayo, Chiclayo) Universidad de Chiclayo Universidad Señor de Sipán (Chiclayo, Chiclayo)2010 Deportivo Pomalca (Chiclayo, Chiclayo) Universidad Señor de Sipán (Chiclayo, Chiclayo) Defensor Cabrera (Íllimo, Lambayeque)2011 Los Caimanes (Etén, Chiclayo) Universitarios (Illimo, Lambayeque) Defensor Cabrera (Íllimo, Lambayeque)2012 Universidad Señor de Sipán (Chiclayo, Chiclayo) Flamengo FC (José Leonardo Ortiz, Chiclayo) Unión Tumán (Tumán, Chiclayo)2013 Universidad Señor de Sipán (Chiclayo, Chiclayo) Willy Serrato (Pimentel, Chiclayo) Flamengo FC (José Leonardo Ortiz, Chiclayo)2014 La Nueva Alianza (Chiclayo, Chiclayo) Cruz de Chalpón (Motupe, Ferreñafe) Flamengo FC (José Leonardo Ortiz, Chiclayo)2015 La Nueva Alianza (Chiclayo, Chiclayo) Universidad Señor de Sipán (Chiclayo, Chiclayo) Alianza Vista Alegre (Oyotún, Chiclayo)2016 Juan Aurich (Chongoyape, Chiclayo) La Nueva Alianza (Chiclayo, Chiclayo) Universidad Señor de Sipán (Chiclayo, Chiclayo)
Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Independiente (Monsefú, Chiclayo). Invencibles FC (Mochumí, Lambayeque). Rayos X Medicina (Chiclayo, Chiclayo). Mariscal Sucre (, Ferreñafe). Defensor Chongoyape (Chongoyape, Chiclayo). Sport Victoria (Túcume, Lambayeque). | style="width:370px" | Defensor Pueblo Nuevo (Mochumí, Lambayeque). Juan Aurich Pastor (Pítipo, Ferreñafe). Los Íntimos (Chiclayo, Chiclayo). Universidad Santo Toribio de Mogrovejo (, Chiclayo). Dínamo FBC (Chiclayo, Chiclayo). Sport José Pardo (Tumán, Chiclayo). Juventud La Joya (Lambayeque, Lambayeque). | style="width:370px" | San Lorenzo de Almagro (Chiclayo, Chiclayo). Sport Boys Tumán (Tumán, Chiclayo). Construcción Civil (, ). Universitario de Tongorrape (Motupe, Lambayeque). Defensor España (, ). Defensor Monsefú (Monsefú, Chiclayo).
Liga Superior de Pasco Temporada Campeón Subcampeón Tercero2009 Deportivo Municipal (Yanahuanca, Daniel Alcides Carrión) Unión Minas (Cerro de Pasco, Pasco) Columna Pasco (Yanacancha, Pasco)2010 Unión Minas (Cerro de Pasco, Pasco) Sport Ticlacayán (Ticlacayán, Pasco) Columna Pasco (Yanacancha, Pasco) Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Universitario (Yanacancha, Pasco). Sociedad Tiro 28 de Smelter (Tinyahuarco, Pasco). | style="width:370px" | Sport Travieso (Colquijirca, Pasco). Túpac Amaru (Vicco, Pasco).
Liga Superior de Piura Temporada Campeón Subcampeón Tercero2009 Atlético Grau (Piura, Piura) Cultural Locuto (Tambo Grande, Piura) Unión Deportiva Paita (, Paita)2010 Atlético Grau (Piura, Piura) Cultural Locuto (Tambo Grande, Piura) Universidad de Piura (Piura, Piura)2011 Petroperu FC (Piura, Piura) Estrella Roja (Piura, Piura) Deportivo Ignacio Merino (Piura, Piura)2012 Juana & Víctor (Bellavista, Sullana) Carlos Concha (La Brea, Talara) Cosmos FC (Pariñas, Tarara)2013 Atlético Grau (Piura, Piura) José Olaya (, Paita) Juana & Víctor (Bellavista, Sullana)2014 Atlético Grau (Piura, Piura) Jorge Chávez (, Sullana) Juana & Víctor (Bellavista, Sullana)2015 Defensor La Bocana (Sechura, Sechura) Escuela Piuranitos (, ) Atlético Grau (Piura, Piura) 2016 Atlético Grau (Piura, Piura) San Antonio (, ) Juana & Víctor (Bellavista, Sullana) 2017 San Antonio Juana & Víctor Comerciantes de Chulucanas Melgar de Marcavelica2018 San Miguel Juventud Cautivo San Pedro Chanel Juana & Víctor2019 Juventud Cautivo Sport Estrella Melgar de Marcavelica Juana & Víctor2023 Academia Cristo Rey Semillero Tambogrande Juventud Cautivo Otros equipos participantes:
| style="width:370px" | Atlético San Martín (Piura, Piura). Alianza Libertad (Castilla, Piura). Defensor Malacasí (, Morropón). Olimpia (La Unión, Piura). | style="width:370px" | Juan de Mori (Catacaos, Piura). Almirante Grau (Pariñas, Tarara). Atlético Fronterizo (Lancones, Sullana). Unión Deportivo Tablazo (, Paita). | style="width:370px" | Melgar (Marcavelica, Sullana). Olger Jara (, ). San Juan (, ). Comerciantes de Chulucanas (, ).
Liga Superior de Puno Temporada Campeón Subcampeón Tercero2008 Diablos Rojos (Juliaca, San Román) Franciscano San Román (Juliaca, San Román) Unión Carolina (Puno, Puno)2009 Franciscano San Román (Juliaca, San Román) Unión Carolina (Puno, Puno) San Felipe Volante (Caracoto, San Román)2010 Unión Fuerza Minera (Putina, San Antonio de Putina) Alianza Unicachi (, Yunguyo) Unión Carolina (Puno, Puno)2011 Club Politécnico (Juliaca, San Román) Franciscano San Román (Juliaca, San Román) Defensor Sandia (Sandia, Sandia)2012Alfonso Ugarte (Puno, Puno) Deportivo Binacional (Chucuito, Puno) Racing (Cuyo Cuyo, Sandia) Otros equipos participantes:
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