Un locus de rasgo cuantitativo (QTL Quantitative Trait Loci en inglés) es un locus (sección de ADN) que se correlaciona con la variación de un rasgo cuantitativo en el fenotipo de una población de organismos. Los QTL se mapean identificando qué marcadores moleculares (como SNP o AFLP) se correlacionan con un rasgo observado. Este es a menudo un primer paso para identificar y secuenciar los genes reales que causan la variación del rasgo.
Definición Un locus de rasgo cuantitativo (QTL) es una región de ADN que está asociada con un rasgo fenotípico particular, que varía en grado y que puede atribuirse a efectos poligénicos, es decir, el producto de dos o más genes y su entorno. Estos QTL a menudo se encuentran en diferentes cromosomas. El número de QTL que explican la variación en el rasgo fenotípico indica la arquitectura genética de un rasgo. Puede indicar que la altura de la planta está controlada por muchos genes de pequeño efecto, o por algunos genes de gran efecto.
Por lo general, los QTL subyacen a los rasgos continuos (aquellos que varían continuamente, por ejemplo, la altura) en oposición a los rasgos discretos (rasgos que tienen dos o varios valores de caracteres, por ejemplo, cabello rojo en humanos, un rasgo recesivo o guisantes lisos o arrugados utilizados por Mendel en sus experimentos).
Además, un solo rasgo fenotípico generalmente está determinado por muchos genes. En consecuencia, muchos QTL están asociados con un solo rasgo. Otro uso de QTL es identificar genes candidatos subyacentes a un rasgo. Una vez que se identifica una región de ADN que contribuye a un fenotipo, se puede secuenciar. La secuencia de ADN de cualquier gen en esta región se puede comparar con una base de datos de ADN para genes cuya función ya se conoce, siendo esta tarea fundamental para la mejora de cultivos asistida por marcadores.
Historia La herencia mendeliana fue redescubierta a principios del . A medida que se extendieron las ideas de Mendel, los genetistas comenzaron a conectar las reglas de herencia de factores individuales de Mendel con la evolución darwiniana. Para los primeros genetistas, no estaba claro de inmediato que la variación suave en rasgos como el tamaño del cuerpo (es decir, Dominio incompleto) fuera causada por la herencia de factores genéticos únicos. Aunque el propio Darwin observó que las características endogámicas de las palomas de fantasía se heredaron de acuerdo con las leyes de Mendel (aunque Darwin no sabía realmente las ideas de Mendel cuando hizo la observación), no era obvio que estas características seleccionadas por los criadores de palomas de fantasía puedan explicar de manera similar variación cuantitativa en la naturaleza.
Un intento temprano de William Ernest Castle para unificar las leyes de la herencia mendeliana con la teoría de la especiación de Darwin invocó la idea de que las especies se diferencian unas de otras a medida que una u otra adquieren un factor mendeliano novedoso. La conclusión de Castle se basó en la observación de que los rasgos novedosos que podrían estudiarse en el laboratorio y que muestran patrones de herencia mendeliana reflejan una gran desviación del tipo salvaje, y Castle creía que la adquisición de tales características es la base de la «variación discontinua» que caracteriza especiación Darwin discutió la herencia de características mutantes similares, pero no las invocó como un requisito de especiación. En cambio, Darwin utilizó la aparición de tales características en las poblaciones reproductoras como evidencia de que la mutación puede ocurrir al azar dentro de las poblaciones reproductoras, lo cual es una premisa central de su modelo de selección en la naturaleza. Más adelante en su carrera, Castle refinaría su modelo de especiación para permitir que pequeñas variaciones contribuyan a la especiación con el tiempo. También pudo demostrar este punto criando selectivamente poblaciones de ratas de laboratorio para obtener un fenotipo encapuchado durante varias generaciones.
Castle fue quizás el primer intento realizado en la literatura científica para dirigir la evolución mediante la selección artificial de un rasgo con variación subyacente continua, sin embargo, la práctica había sido ampliamente utilizada en el desarrollo de la agricultura para obtener ganado o plantas con características favorables de las poblaciones que muestran variación cuantitativa en rasgos como el tamaño del cuerpo o el rendimiento de grano.
El trabajo de Castle fue uno de los primeros en intentar unificar las leyes recientemente descubiertas de la herencia mendeliana con la teoría de la evolución de Darwin. Aun así, pasarían casi treinta años hasta que el marco teórico para la evolución de los rasgos complejos se formalizara ampliamente. En un resumen temprano de la teoría de la evolución de la variación continua, Sewall Wright, un estudiante graduado que se formó con Castle, resumió el pensamiento contemporáneo sobre la base genética de la variación natural cuantitativa: "A medida que los estudios genéticos continuaron, se encontraron diferencias cada vez menores para mendelizar, y cualquier personaje, suficientemente investigado, resultó afectado por muchos factores". Wright y otros formalizaron la teoría de la genética de poblaciones que se había elaborado durante los últimos 30 años explicando cómo se pueden heredar tales rasgos y crear poblaciones reproductoras estables con características únicas. La genética de rasgos cuantitativos de hoy aprovecha las observaciones de Wright sobre la relación estadística entre genotipo y fenotipo en familias y poblaciones para comprender cómo ciertas características genéticas pueden afectar la variación en poblaciones naturales y derivadas.
Rasgos cuantitativos La herencia poligénica se refiere a la herencia de una característica fenotípica (rasgo) que es atribuible a dos o más genes y puede medirse cuantitativamente. La herencia multifactorial se refiere a la herencia poligénica que también incluye interacciones con el medio ambiente. A diferencia de los rasgos monogénicos, los rasgos poligénicos no siguen patrones de herencia mendeliana (categorías discretas). En cambio, sus fenotipos suelen variar a lo largo de un gradiente continuo representado por una curva de campana..
Un ejemplo de un rasgo poligénico es la variación del color de la piel humana. Varios genes influyen en la determinación del color natural de la piel de una persona, por lo que modificar solo uno de esos genes puede cambiar ligeramente el color de la piel o, en algunos casos, como en el caso de SLC24A5, moderadamente. Muchos trastornos con componentes genéticos son poligénicos, incluidos el autismo, el cáncer, la diabetes y muchos otros. La mayoría de las características fenotípicas son el resultado de la interacción de múltiples genes.
Ejemplos de procesos de enfermedad generalmente considerados resultados de muchos factores contribuyentes:
Malformación congénita
Paladar hendido Luxación congénita de la caderaEmery's Elements of Medical Genetics Defectos cardíacos congénitos Defectos del tubo neural Estenosis pilórica Talipes
Enfermedades de inicio en adultos
Diabetes mellitus Cáncer Glaucoma Hipertensión Enfermedad isquémica del corazón Desorden bipolar Esquizofrenia Psoriasis Enfermedades de la tiroides Enfermedad de Alzheimer
Se dice que las enfermedades hereditarias multifactoriales constituyen la mayoría de los trastornos genéticos que afectan a los humanos, lo que resultará en hospitalización o cuidados especiales de algún tipo.
Rasgos multifactoriales en general Los rasgos controlados tanto por el entorno como por factores genéticos se denominan multifactoriales. Por lo general, los rasgos multifactoriales fuera de la enfermedad dan como resultado lo que vemos como características continuas en los organismos, especialmente en los organismos humanos, tales como: altura, color de la piel y masa corporal. Todos estos fenotipos se complican por una gran cantidad de toma y daca entre los genes y los efectos ambientales. La distribución continua de rasgos como la altura y el color de la piel descritos anteriormente, refleja la acción de genes que no manifiestan patrones típicos de dominación y recesión. En cambio, las contribuciones de cada locus involucrado se consideran aditivas. Los escritores han distinguido este tipo de herencia como herencia poligénica o cuantitativa.
Por lo tanto, debido a la naturaleza de los rasgos poligénicos, la herencia no seguirá el mismo patrón que un simple cruce monohíbrido o dihíbrido. La herencia poligénica puede explicarse como herencia mendeliana en muchos loci, dando como resultado un rasgo que normalmente se distribuye. Si n es el número de loci involucrados, entonces los coeficientes de la expansión binomial de (a + b)2n darán la frecuencia de distribución de todas las combinaciones de n alelos. Para valores suficientemente altos de n, esta distribución binomial comenzará a parecerse a una distribución normal. Desde este punto de vista, un estado de enfermedad se hará evidente en una de las colas de la distribución, más allá de algún valor umbral. Se esperan estados de enfermedad de gravedad creciente cuanto más se supere el umbral y se aleje de la media.
Enfermedad hereditaria y herencia multifactorial Una mutación que resulta en un estado de enfermedad a menudo es recesiva, por lo que ambos alelos deben ser mutantes para que la enfermedad se exprese fenotípicamente. Una enfermedad o síndrome también puede ser el resultado de la expresión de alelos mutantes en más de un locus. Cuando hay más de un gen involucrado, con o sin la presencia de desencadenantes ambientales, se dice que la enfermedad es el resultado de una herencia multifactorial.
Cuantos más genes participen en el cruce, más se parecerá la distribución de los genotipos a una distribución gaussiana o normal. Esto muestra que la herencia multifactorial es poligénica, y las frecuencias genéticas se pueden predecir mediante un cruce mendeliano polihíbrido. Las frecuencias fenotípicas son un asunto diferente, especialmente si están complicadas por factores ambientales.
El paradigma de la herencia poligénica que se usa para definir la enfermedad multifactorial ha encontrado mucho desacuerdo. Se ha analizado cómo la herencia poligénica simple no puede explicar algunas enfermedades, como la aparición de diabetes mellitus tipo I, y que, en casos como estos, no se cree que todos los genes hagan una contribución igual.
La suposición de herencia poligénica es que todos los loci involucrados hacen una contribución igual a los síntomas de la enfermedad. Esto debería dar como resultado una distribución de curva normal de genotipos. Cuando no lo hace, la idea de herencia poligénica no puede ser apoyada por esa enfermedad.
Ejemplos Los anteriores son ejemplos bien conocidos de enfermedades que tienen componentes genéticos y ambientales. Otros ejemplos involucran enfermedades atópicas tales como eczema o dermatitis; espina bífida (columna abierta) y anencefalia (cráneo abierto).
Si bien la esquizofrenia se cree ampliamente que es multifactorialmente genética por los biopsiquiatras, no se han determinado con certeza marcadores genéticos característicos.
Si se demuestra que los hermanos y hermanas del paciente tienen la enfermedad, existe una gran posibilidad de que la enfermedad sea genética y que el paciente también será un portador genético. Esto no es suficiente, ya que también debe demostrarse que el patrón de herencia no es mendeliano. Esto requeriría estudiar docenas, incluso cientos de pedigríes familiares diferentes antes de llegar a una conclusión de herencia multifactorial. Esto a menudo lleva varios años.