Las principales universidades de Oaxaca, públicas y privadas, son:
Universidades públicas Universidad Autónoma Benito Juárez de Oaxaca (UABJO) Facultad de Economía Facultad de Odontología Facultad de Ciencias Químicas Facultad de Idiomas Facultad de Enfermería y Obstetricia Facultad de Arquitectura 5 de Mayo Facultad de Arquitectura C.U. Facultad de Derecho y Ciencias Sociales Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia Facultad de Cultura Física y Deporte Facultad de Medicina y Cirugía Facultad de Contaduría y Administración Instituto de Ciencias de la Educación Facultad de Gastronomía Facultad de Bellas Artes Escuela de Ciencias
Sistema Suneo
Universidad Tecnológica de la Mixteca (UTM) Universidad del Mar (UMAR) Universidad de la Sierra Sur (UNSIS) Universidad del Istmo (UNISTMO) Universidad del Papaloapan(UNPA) Universidad de la Sierra (UNSIJ) Universidad de la Cañada (UNCA) Universidad de la Costa (UNCOS) Universidad de Chalcatongo (UNICHA)
Institutos tecnológicos Instituto Tecnológico de Oaxaca (ITO) Instituto Tecnológico de Pinotepa (ITP) Instituto Tecnológico de Tlaxiaco (ITTlaxiaco) Instituto Tecnológico de Tuxtepec (ITTux) Instituto Tecnológico del Istmo (ITISTMO) Instituto Tecnológico del Valle de Oaxaca (ITVO) Instituto Tecnológico Agropecuario no. 3 de Tuxtepec Instituto Tecnológico de Comitancillo Instituto Tecnológico de Salina Cruz (ITSAL) Instituto Tecnológico Superior de San Miguel el Grande (ITSMIGRA)
Escuelas Normales
Centro Regional de Educación Normal de Oaxaca(C.R.E.N.O.) Escuela Normal de Río Grande Escuela Normal de Educación Preescolar de Oaxaca Escuela Normal de Educación Especial de Oaxaca Escuela Normal Experimental Huajuapan Escuela Normal Experimental de Teposcolula Escuela Normal Experimental presidente Lázaro Cárdenas Escuela Normal Experimental presidente Venustiano Carranza Escuela Normal Rural Vanguardia de Tamazulapan Escuela Normal Superior Federal de Oaxaca Escuela Normal Urbana Federal del Istmo Escuela Normal Bilingüe e Intercultural de Oaxaca
Universidades tecnológicas Universidad Tecnológica de los Valles Centrales de Oaxaca (UTVCO)
Universidades privadas Universidad Regional del Sureste (URSE) Universidad UGMEX Facultad de Medicina y Cirugía Facultad de Ciencias Administrativas Facultad de Derecho y Ciencias Sociales Facultad de Psicología Escuela de Odontología Escuela de Arquitectura Escuela de Enfermería y Obstetricia Escuela de Idiomas Escuela de Nutrición Universidad Anáhuac Oaxaca (UAO) Escuela de Comunicación Escuela de Diseño Escuela de Derecho Escuela de Ingeniería Escuela de Medicina Escuela de Negocios Escuela de Psicología Escuela de Turismo y Gastronomía Centro de Lenguas Universidad Mesoamericana Universidad Mundo Maya, Campus Oaxaca (UMMA) Instituto de Ciencias Jurídicas de Oaxaca (ICJO) Instituto Tecnológico de la Construcción - Campus Oaxaca (ITC) Benemérita Universidad de Oaxaca (BUO) Instituto de Estudios Superiores del Golfo de México (IESGM) (UGMEX) Universidad Madero campus Papaloapan (UMAD) Universidad José Vasconcelos de Oaxaca (UNIVAS) Instituto Universitario Antequera de Oaxaca (UNAO) Instituto de Estudios Superiores de Oaxaca (IESO) Colegio Libre de Estudios Universitarios (CLEU) Instituto Bernal Díaz del Castillo, S.C. (IBDC) Centro Universitario Luis Donaldo Colosio Murrieta Universidad Pedagógica Nacional, Plantel Huajuapam de León Oaxaca. (UPN) Multiversidad Mundo Sin Fronteras Centro Universitario Casandoo Universidad CNCI, Campus Oaxaca
Ligas externas Asociación Nacional de Universidades e Instituciones de Enseñanza Superior: ANUIES
Universidad de la Sierra Sur: UNSIS Universidad del Mar: UMAR Universidad de la Costa: UNCOS