alt=El mapa muestra las zonas de mayor frecuencia de los macrohaplogrupos L, M, N y R. |miniaturadeimagen|Mapa de distribución de haplogrupos de ADN mitocondrial. En la genética mitocondrial humana, el Haplogrupo D es un haplogrupo de ADN mitocondrial (ADNmt) humano. Es un haplogrupo descendiente del haplogrupo M, que se originó en Asia oriental, hace aproximadamente entre 60.000 y 35.000 años. Sus marcadores genéticos son 4883, 5178A y 16362.
El Haplogrupo D es el haplogrupo mitocondrial con mayor presencia en el Extremo Oriente y es importante entre los pueblos indígenas americanos.
Distribución Se encuentra al Este, Sudeste de Asia y Siberia. Los subclados D1, D2, D3 y D4h se encuentran entre los amerindios, al igual que otros subclados de A, B, C y X.
D es frecuente también en Asia Central,D. Comas et al., Admixture, migrations, and dispersals in Central Asia: evidence from maternal DNA lineages. European Journal of Human Genetics, 2004 donde es el segundo haplogrupo más frecuente después de H. También se encuentra en el Noreste de Europa y en Oriente Medio, aunque en bajas frecuencias.
Este de Asia: En China tiene un promedio aproximado de 32%,Yong-Gang Yao et al. 2001, Phylogeographic Differentiation of Mitochondrial DNA in Han Chinese Am J Hum Genet. 2002 March; 70(3): 635–651 con la frecuencia más alta en Qingdao con 62%; destacando también Xinjiang con 44.5%, Liaoning 41%, Tíbet 38.5% y Shanghái 33%. Frecuencias en Japón: 37.5%, Corea 33% y Taiwán 20%.Tanaka M et al. 2004, Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan Genome Res. 2004. 14: 1832-1850
Sudeste de Asia: En Vietnam 21%,Han-Jun Jin et al. 2008, The Peopling of Korea Revealed by Analyses of Mitochondrial DNA and Y-Chromosomal Markers. Department of Biological Sciences, Dankook University, Cheonan,Korea. Tailandia 17%Mait Metspalu et al. 2004, Most of the extant mtDNA boundaries in South and Southwest Asia were likely shaped during the initial settlement of Eurasia by anatomically modern humans. BMC Genetics 2004, 5:26. doi:10.1186/1471-2156-5-26 y en Insulindia un 4%.C. Hill et al. 2007, A Mitochondrial Stratigraphy for Island Southeast Asia. Am J Hum Genet. 2007 January; 80(1): 29–43.
Siberia: Ampliamente extendido.
América del Norte: Extendido. En los yupik alcanza 64%.Easton, Ruth D. et al 1996, mtDNA Variation in the Yanomami: Evidence for Additional New World Founding Lineages Destaca el subgrupo D2 en los nativos de las Islas Aleutianas y pueblos na-dené. D3 encontrados en esquimales.
América del Sur: Bien extendido, sobre todo en las regiones más australes como la Araucanía y la Patagonia; por ejemplo en nativos de Laitec con 57%, en fueguinos 57%, yámanas 52%, huiliches 49%, mapuches 49% y pehuenches 46%.García, F. y otros 2004, Origen y microdiferenciación de la población del Archipiélago de Chiloé. Revista chilena de historia natural v.77 n.3 Santiago sep. 2004 Común entre los indígenas de la Amazonia (28%), especialmente entre los pueblos mondé (Suruí, Gavião, Cintas-largas y Zoró), que registran frecuencias entre 60 y 90%. Otras frecuencias importantes están en los Wichí del Chaco con 54%, quechuas del Ecuador con 33% y otras etnias aisladas.Citlalin Xochime 2002, People of the Red Brown Earth.
Subclados El siguiente árbol filogenético está de acuerdo con Van Oven & Kayser 2009van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. PhyloTree.org - mtDNA subtree D y las denominaciones alternativas que figuran entre paréntesis van de acuerdo con Volodko et al. 2008.Volodko, Natalia et al. 2008 Mitochondrial Genome Diversity in Arctic Siberians, with Particular Reference to the Evolutionary History of Beringia and Pleistocenic Peopling of the Americas. AJHG 82, 5, 9 May 2008, 1084-1100 El análisis geográfico de estos subclados no es completo salvo en Japón.
Hay dos ramas principales, D4 y D5'6. D1, D2 y D3 son subclados de D4.
D4 D4 (3010, 8414, 14668): Extendido en Asia Oriental, Sudeste de Asia, Siberia, Asia Central y América originaria. D1: Exclusivo de los nativos americanos, especialmente en todo Sudamérica. D1f (16142): subhaplogrupo definido por la mutación 16142. La distribución geográfica de D1f posee una presencia notada no sólo en Norteamérica sino también en el noroeste de Sudamérica, específicamente en países como Ecuador y Perú. Las estimaciones de edad de coalescencia para D1f sugieren que llegó a Sudamérica durante los eventos iniciales de poblamiento, los cuales ocurrieron en un marco de tiempo relativamente corto de aproximadamente 1500 años, entre 16,0 y 14,6 mil años atrás. Este período de tiempo se alinea con la evidencia arqueológica de la presencia humana temprana en América del Sur. D1 + 16142-146-16148-16356-16278 (D1f4 sensu) D1g: subhaplogrupo mitocondrial originario de Sudamérica definido por las transiciones en las posiciones A8116G, C16187T, y C16189T. Su distribución geográfica se centra en el Cono Sur de Sudamérica; principalmente en el centro y sur de Argentina y Chile. Este clado presenta una gran diversidad interna con al menos seis sub ramas principales, D1g1 a D1g6. La estimación de edad de máxima verosimilitud (ML) para D1g es de aproximadamente 18,3 ± 2,4 mil años, lo que indica que es uno de los subhaplogrupos más antiguos de la región. D1 + 152-16311 (D1j'w sensu) D1 + 152-16311-200-2056-2080-6260-15468-16391 (D1w sensu) D1j (16242): subhaplogrupo mitocondrial que se encuentra en el Cono Sur de América del Sur, caracterizado por el patrón mutacional de la región de control T152C-C16242T-T16311C. La edad estimada del subhaplogrupo D1j es de aproximadamente 13.900 años. El origen más probable del subhaplogrupo D1j es la región de las Sierras Pampeanas, que ocupa el centro y parte de la porción noroeste de Argentina. D1 + 16242-16157 (D1j2 sensu) D1 + 16527-11665-(16519) (D1u sensu) D1 + 16527-11665-(16519)-14034-71.1G (D1u1 sensu) D1 + 10-55-56-64-279-998-5336-5600-11084-16126 (D1v sensu) D1 + 210G-11150A-15106A-16239T (D1x sensu) D4a (o D11): Extendido en el Extremo Oriente. Se encontró en Corea y Japón 8%, presente en China de forma irregular, destacando Qingdao con 8%. En chukchis 12%. Al sur de Tailandia se encontró 80% en Trang. D4a1 D4a2 D4a3 D4a4 D3 o D4b (8020): Extendido al este de Asia y en Siberia. Destaca el Tíbet con 18.5%. D3a o D4b1: En esquimales.J. Saillard et al 2000, MtDNA variation among Greenland Eskimos: The edge of the Beringian expansion. Am. J. Hum. Genet. 67 (2000), pp. 718–726 D3a1 (o D3): En Siberia, especialmente en evenkisMiroslava Derenko 2007 Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations The American Journal of Human Genetics 81, 5, Nov 07, 1025-1041 y nganasan. D3a2 (o D4b1a) D3a2a (o D4b1a2a) (13720): En naucanos (esquimo-siberianos), en esquimales de Canadá, Groenlandia y en siberianos como los chukchis, tuvanos y tubalares (Altái). D4b2 (o D3b): En China y Japón. Al sur de Siberia. D4c: Típico de todo el Asia Central, especialmente en turkmenos. En China en uigures. D4d: Poco en Asia Oriental y Siberia. D4e (o D2) D4e1: En Asia Oriental, Siberia y América. D4e1a: En Japón. D2 (o D2a1) (8703, 16129): Originado probablemente en la región Baikal al sur de Siberia.Derenko, M. et al 2010, Origin and Post-Glacial Dispersal of Mitochondrial DNA Haplogroups C and D in Northern Asia D2a'b D2a (o D2a1a) (11959): En América ártica y península de Chukchi. En aleutas, esquimo-siberianos y chukchis. Encontrado en Groenlandia en restos de hace 4.000 años.Gilbert, Thomas et al 2008, Paleo-Eskimo mtDNA Genome Reveals Matrilineal Discontinuity in Greenland D2a1 (9667) D2a1a (8910A): Alta frecuencia en aleutas con 65-100%. D2a1b: Esquimo-siberianos. D2a2 (4991): Esquimales y chukchis. D2a-16092: En los tlingit (na-dené). D2b: En Siberia y en los bargut (Mongolia). D2c: Encontrado en buriatos (Sibera). D4e2: En Japón. D4f: Encontrado en Japón. D4g: En Japón. D4h (o D10): Asia Oriental y en amerindios.Perego, Ugo et al. 2009, Distinctive Paleo-Indian Migration Routes from Beringia Marked by Two Rare mtDNA Haplogroups. Current Biology 19, 1, 13 Jan 2009, 1-8 D4h1: En Asia D4h2: En Asia D4h3 D4h3a: Minoritario pero muy difundido desde el extremo Sur de América hasta el California. Encontrado en Chile, Perú, Bolivia, Ecuador, Brasil, México, Estados Unidos, y en Colombia. Encontrado en restos de un niño de la cultura Clovis de hace 12.600 años.Rasmussen M, Anzick SL et al. 2014, The genome of a Late Pleistocene human from a Clovis burial site in western Montana. Nature. 2014 Feb 13;506(7487):225-9. doi: 10.1038/nature13025. D4h3b: En Qingdao (Shandong, China) D4h4: En Asia D4i (o D9): Poco en yukaguires de la región Kolymá (Siberia). En Asia Oriental. D4j (o D6): Extendido en Asia Oriental y Siberia. Encontrado en Lituania.Haplogroup D4j de Ian Logan (195) D4k: En Japón. D4o (o D4): En nganasan (Siberia). D4l (o D7): En yukaguires (Siberia). D4m (o D8): En yukaguires (Siberia). D4n: Poco en ainus y en China. D4q D4s: En China y tuvanos.
D5'6 (16189) D5: Muy extendido en Asia Oriental y Sudeste de Asia. En China destaca Qingdao con 10%. Poco en India, especialmente en Tripura y Arunachal. Poco en Siberia y Asia Central. D5a'b D5a D5b D5c D6: En las FilipinasTabbada, Kristina. et al. 2009, Philippine mitochondrial DNA diversity: a populated viaduct between Taiwan and Indonesia? Molecular Biology and Evolution, doi:10.1093/molbev/msp215 y en Japón.
Véase también
Enlaces externos PhyloTree.org - mtDNA subtree D de Mannis van Oven Dispersión del Haplogrupo D, de la National Geographic
Referencias
Categoría:Haplogrupos mitocondriales humanos