thumb|400px|Red de ferrocarriles de Andalucía en 2024.
La red ferroviaria de Andalucía está mayoritariamente sustentada en las vías construidas en el , enfocadas al transporte de pasajeros y mercancías de larga distancia. En la actualidad se encuentra en un proceso de renovación que la adaptará a las nuevas tecnologías y la creciente demanda de usuarios.
Historia 400px|thumb|La red de ferrocarriles en España durante el siglo XIX
La mayoría de los ferrocarriles de Andalucía fueron construidos entre los años 1850 y 1900. Sin embargo, el primer intento de construcción de ferrocarril en España se sitúa en Jerez de la Frontera y la Bahía de Cádiz. El proyecto consistía en una red férrea entre el Puerto de Santa María, Jerez de la Frontera, Sanlúcar de Barrameda y Rota. Aunque no se hizo realidad hasta la década de 1850, donde se unió Jerez de la Frontera con El Puerto de Santa María y, más adelante con el puerto del Trocadero, en Puerto Real, para poder transportar las botas de vino rumbo a Reino Unido en el denominado tren del vino.
La conexión ferroviaria entre Madrid y Andalucía, a través del paso de Despeñaperros, abrió la posibilidad de realizar trayectos de larga distancia. Este ferrocarril sigue, desde Linares, el curso del río Guadalquivir hacia Andújar, Córdoba y Sevilla. A partir de la capital andaluza no se siguió un trazado recto hacia la Bahía de Cádiz, sino que se optó por construir estaciones en las localidades intermedias para dar servicio a un mayor número de habitantes. El ferrocarril continúa vía Utrera, Las Cabezas de San Juan y Lebrija hasta conectar con las vías existentes, y terminar su trayecto por Puerto Real, San Fernando y Cádiz.
Una vez satisfecha la conexión con Cádiz, los ferrocarriles a Málaga y Granada fueron los siguientes en inaugurarse. Esta ramificación parte de Córdoba hacia el sur por Montilla y Puente Genil hasta entrar en la estación de Bobadilla, donde se divide a su vez en vías hacia Málaga y Granada. Un nuevo ramal hacia Algeciras, pasando por la serranía de Ronda, sería inaugurado en la década de 1890.
Diversos ramales fueron construidos en las siguientes décadas para llegar al resto de capitales andaluzas a partir del ferrocarril Madrid-Cádiz, como Linares-Guadix-Almería y Sevilla-Huelva-Ayamonte.
Las uniones transversales fueron las últimas en ser construidas. Desde Extremadura llegaron ferrocarriles desde Zafra hacia Sevilla y Huelva, así como un nuevo vial entre Utrera y Bobadilla para garantizar nuevos servicios entre Andalucía Occidental y Oriental. También una vía de Linares a Puente GenilFerrocarril de Linares a Puente Genil. Euroferroviarios conocida como la vía del aceite, hoy en día cerrada en su mayor parte.
Se puso también en servicio, ya en el , la conexión entre Andalucía y el Levante español, a través del ferrocarril del Almanzora. El posterior cierre de esta vía ha conllevado el descontento de los habitantes de Granada y Almería, puesto que ahora los trenes se ven obligados a dar un rodeo por el Alcázar de San Juan para llegar hasta Valencia y Barcelona.
Durante el transcurso del , se acometieron obras para electrificar el ferrocarril Madrid-Cádiz así como los ramales a Huelva, Jaén y Málaga, y entre Almería y las minas de Alquife.
En el cierre de líneas deficitarias de 1985 dejaron de prestar servicio otras vías, como la de Sanlúcar de Barrameda, y se dejaron sin uso otras que nunca llegaron a poner en funcionamiento. La Junta de Andalucía salva del cierre algunas líneas deficitarias como la Sevilla-Granada o las salidas a Extremadura.
El gobierno de Felipe González cambió el modelo hacia una red ferroviaria centrada en potenciar las líneas de alta demanda, además de crear los núcleos de Cercanías. En Sevilla se duplicó la vía electrificada entre Lora del Río y Dos Hermanas y se creó la "Variante de La Negrilla", un desvío por el este de la ciudad, utilizado por trenes de mercancías y cercanías. Málaga y Cádiz también estrenaron servicios de cercanías.
En 1986 el gobierno determina crear un nuevo acceso a Andalucía por el Valle de los Pedroches que servirá para aliviar el congestionado paso de Despeñaperros, en vía única. Posteriormente se decide que este acceso será una línea de alta velocidad en ancho europeo, la primera de España.
Tras la puesta en servicio de la alta velocidad, las obras avanzan para integrar el ferrocarril en las ciudades andaluzas. El gobierno de José María Aznar soterra las vías del tren en Cádiz, e inicia las obras de la alta velocidad a Málaga, que culminan en 2007, ya con José Luis Rodríguez Zapatero en el poder. Empiezan los trabajos para duplicar y ampliar las vías en las áreas metropolitanas de Cádiz y Málaga, y los trabajos de la alta velocidad a Granada, que continúan en la actualidad. La Junta de Andalucía inició las obras del Eje Ferroviario Transversal y el Corredor de la Costa del Sol, pero debido a la crisis económica iniciada en 2008 acaba renunciando a concluir estos proyectos. También han quedado paralizados los trabajos del Corredor Mediterráneo en Almería. El gobierno de Mariano Rajoy también suprime varios servicios deficitarios, dejando sin tráfico de viajeros la línea convencional Córdoba-Bobadilla, y el trayecto Linares-Granada que queda sin servicios diurnos. Se salvaron de la eliminación, una vez más, los trayectos entre Andalucía y Extremadura.
En 2015 se pone en servicio la línea de alta velocidad Sevilla-Cádiz, el tiempo Madrid-Cádiz bajó por primera vez de las cuatro horas, pero aún con vía de ancho ibérico y electrificada a 3 kV, a diferencia del resto de LAV españolas electrificadas a 25 kV. Debido a esto, los trenes circularán como máximo a 220 km/h por esta línea hasta que se cambie la electrificación. Un futuro cambio a ancho UIC permitiría que el AVE llegara a Cádiz, con un tiempo en el entorno de las tres horas y cuarto.El tren no baja de las cuatro horas - La Voz Digital En 2019 llegó la alta velocidad a Granada.Fomento retrasa de nuevo a otoño de 2017 la llegada del AVE a Granada - El Diario.es En 2020, a causa de la pandemia de covid-19, todos los trenes nocturnos son eliminados. En 2023 Iryo empieza a operar en la alta velocidad de Andalucía, rompiendo el monopolio de Renfe.Iryo termina con tres décadas de monopolio de la alta velocidad en Andalucía - El País
Alta velocidad thumb|Estación de Santa Justa en Sevilla. thumb|Estación de Málaga-María Zambrano en Málaga. thumb|Estación de Córdoba-Central. thumb|Estación de Granada. thumb|Estación de Jerez de la Frontera. thumb|Estación de Almería. thumb|Estación de Huelva.
thumb|Estación de Dos Hermanas. thumb|Estación de Jaén. thumb|Estación de Algeciras. thumb|Estación de San Fernando-Bahía Sur. thumb|Estación de El Puerto de Santa María.
La alta velocidad ferroviaria llegó a Andalucía en 1992 con la puesta en servicio del Nuevo Acceso Ferroviario a Andalucía, una vía doble de ancho internacional alternativa al paso de Despeñaperros que permite velocidades de hasta 300 km/h. Realiza el recorrido entre Madrid y Sevilla parando en Ciudad Real, Puertollano y Córdoba. El tiempo mínimo empleado por estos trenes para recorrer los 471 kilómetros es de 2 horas y 15 minutos. El AVE Madrid-Sevilla ha resultado ser un rotundo éxito, puesto que a fecha de 2006 el 85,5% de los viajeros entre estas dos ciudades, en el combinado avión-tren, eligieron el tren como medio de transporte.Tráficos corredores Andalucía Larga Distancia Respecto al total de transporte (carretera+tren+avión) el porcentaje ha superado el 45%Inglada, V. (2004) Internalización de las externalidades en el transporte. Disponible en
Desde 1992, los trenes que parten desde Madrid con destino a Huelva, Cádiz, Algeciras y Málaga han venido recorriendo parte de su trayecto por las vías de alta velocidad, reduciendo el tiempo de viaje, y haciendo muy competitivo al ferrocarril frente al vehículo privado.
La puesta en servicio, en 2006, del tramo Córdoba-Antequera de la LAV Córdoba-Málaga significó un nuevo recorte en los tiempos de viaje hacia Algeciras y Málaga, además de una nueva ruta para los trenes hacia Granada, que anteriormente entraban por Despeñaperros.
Esta línea de alta velocidad, de 155 kilómetros, fue inaugurada en su totalidad en diciembre de 2008, llegando el AVE de Madrid a Málaga en 2 horas y 30 minutos. Se pusieron también en servicio las estaciones de Puente Genil-Herrera y Antequera-Santa Ana, futuro centro de las vías de alta velocidad de Andalucía. Con posterioridad, en 2014, se construiría la estación de Villanueva de Córdoba-Los Pedroches.
Servicios ferroviarios actuales
En la actualidad, los servicios son prestados por la compañía Renfe Operadora y por Iryo.
Alta Velocidad-Larga Distancia
A Madrid Tren Origen Paradas intermedias Destino observaciones AVES100 Madrid-Puerta de Atocha Ciudad Real · Puertollano · Villanueva de Córdoba-Los Pedroches · Córdoba-Central Sevilla-Santa Justa Mínimo 2:20 h20 trenes diarios por sentido AVES102 Madrid-Puerta de Atocha Ciudad Real · Puertollano · Córdoba-Central · Puente Genil-Herrera · Antequera-Santa Ana Málaga-María Zambrano Mínimo 2:25 h12 trenes diarios por sentido IryoETR 1000 Madrid-Puerta de Atocha Córdoba-Central Sevilla-Santa Justa Mínimo 2:42 h6 trenes diarios por sentido IryoETR 1000 Madrid-Puerta de Atocha Córdoba-Central · Antequera-Santa Ana Málaga-María Zambrano Mínimo 2:44 h4 trenes diarios por sentido AVES102 Madrid-Puerta de Atocha Ciudad Real · Puertollano · Córdoba-Central · Puente Genil-Herrera · Antequera-Santa Ana · Loja Granada-Andaluces Mínimo 3:05 h3 trenes diarios por sentido Alvia Madrid-Puerta de Atocha Córdoba-Central · La Palma del Condado Huelva-Término Mínimo 3:35 h1 tren diario por sentido Alvia Madrid-Puerta de Atocha Ciudad Real · Puertollano · Córdoba-Central · Sevilla-Santa Justa · Jerez de la Frontera · Puerto de Santa María · San Fernando-Bahía Sur Cádiz Mínimo 4:17 h3 trenes diarios por sentido Intercity Madrid-Puerta de Atocha Ciudad Real · Puertollano · Córdoba-Central · Antequera-Santa Ana · Ronda Algeciras Mínimo 5:30 h1 tren diario por sentido Intercity Madrid Chamartín Madrid Atocha Cercanías · Alcázar de San Juan · Manzanares · Valdepeñas · Vilches · Linares-Baeza · Jódar-Úbeda · Guadix Almería Mínimo 6 h1 tren diario por sentido
Los trenes de Madrid a Jaén forman parte de la categoría de Media Distancia.
A Barcelona
Tren Origen Paradas intermedias Destino observaciones AVES103 Barcelona-Sants Campo de Tarragona · Lérida-Pirineos · Zaragoza-Delicias · Ciudad Real · Puertollano · Córdoba-Central Sevilla-Santa Justa 5:37 h2 trenes diarios por sentido AVES103 Barcelona-Sants Campo de Tarragona · Lérida-Pirineos · Zaragoza-Delicias · Córdoba-Central · Puente Genil-Herrera · Antequera-Santa Ana Málaga-María Zambrano 5:45 h2 trenes diarios por sentido AVE S103 Barcelona-Sants Tarragona · Lérida · Zaragoza · Córdoba · Antequera AV Granada 6:19h 1 tren diario por sentido InterCity torre del oro Barcelona-Sants San Vicente de Calders · Tarragona · Salou · La Aldea-Amposta-Tortosa · Vinaroz · Benicarló-Peñíscola · Salou · Castellón de la Plana · Valencia · Játiva · Albacete · Alcázar de San Juan · Manzanares · Valdepeñas · Vilches · Linares-Baeza · Espeluy · Andújar · Córdoba-Central- Sevilla-Santa Justa-
Jerez de la Frontera-
El puerto de Santa maría-
San Fernando-Bahia Sur- Cádiz 11:30 h1 tren diario por sentido A otros destinos
Tren Origen Paradas intermedias Destino observaciones Estrella Bilbao-Abando Miranda de Ebro · Burgos Rosa Manzano · Valladolid-Campo Grande · Medina del Campo · Ávila · Manzanares · Valdepeñas · Vilches · Linares-Baeza · Córdoba-Central · Puente Genil · Bobadilla Málaga-María Zambrano Suprimido
Media Distancia-Avant
Renfe Media Distancia Id. Trayecto 58 Madrid - Jaén 65 Sevilla - Cádiz 66 Sevilla - Córdoba - Jaén 67 Sevilla - Málaga 68 Granada - Almería 70 Algeciras - Antequera 72 Sevilla - Huelva 74 Sevilla - Mérida - Cáceres
Trenes eliminados en 2013: