Durante el desarrollo de la Operación Fénix por parte de las Fuerzas Militares de Colombia, ocurrida en territorio ecuatoriano la madrugada del 1 de marzo de 2008, fueron encontrados varios computadores del jefe de la guerrilla de las Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia -Ejército del Pueblo FARC-EP, Raúl Reyes, que contenían información relacionada con las actividades del guerrillero al frente de las FARC-EP, incluyendo información que relaciona al grupo armado con el gobierno venezolano de Hugo Chávez y el gobierno ecuatoriano de Rafael Correa, además de una extensa red de cooperantes en varios países de América.
El ataque militar en el Ecuador logró la muerte de Raúl Reyes y otros guerrilleros. La incursión en territorio ecuatoriano desató la Crisis diplomática de Colombia con Ecuador y Venezuela de 2008.
En su momento los presidentes de Ecuador y Venezuela, Rafael Correa y Hugo Chávez, negaron la veracidad de la información obtenida en los computadores y, acusaron a Álvaro Uribe, presidente de Colombia en 2008, de querer provocar un conflicto bélico. También alegaron que Uribe pretendía tapar el escándalo interno de la parapolítica, que vinculó a círculos cercanos al gobierno colombiano con paramilitares de las Autodefensas Unidas de Colombia (AUC)
El gobierno de Colombia envió los computadores a la Policía Internacional (Interpol) para que se demostrara la veracidad de estos. Interpol asignó a tres técnicos expertos en computadores de Corea del Sur, Singapur y Australia para analizar el contenido.
Los computadores tenían 37.872 documentos de texto, 452 hojas de cálculo, 210.888 imágenes, 10.537 archivos multimedia, que pesaban 610 gigabytes de información.
En 2011, la Corte Suprema de Justicia de Colombia confirma la ilegalidad en el acopio de la información y que su información no serviría como evidencia legal.
Verificación de Interpol El ministro de Relaciones Exteriores Fernando Araújo, y los directores de la Policía General, Óscar Naranjo, y del Departamento Administrativo de Seguridad (DAS), María del Pilar Hurtado, entre otros altos cargos; fueron los receptores del informe de la Interpol dado a conocer a la opinión pública el 15 de mayo del 2008.
Según el informe presentado por Ronald K. Noble, secretario general de la Interpol, la información de los computadores no habría sido manipulada a mayo de 2008, por las autoridades colombianas. El informe original establece que la información tuvo un tratamiento ajustado al protocolo internacional para este tipo de pruebas a partir del 3 de marzo, fecha en que se entregó la información a autoridades especializadas en Colombia.
Entre el 1 de marzo y el 3 de marzo, fechas en las que el computador también estuvo en manos de las autoridades colombianas antes de ser entregada a técnicos de la Dirección de Investigación Criminal e Interpol (DIJIN) en dicho país, el acceso a los datos no se ajustó a los protocolos internacionales para el manejo de este tipo de pruebas. El informe añade que desde el día del incauto, el 1 de marzo en adelante, no se encontraron indicios de que se hayan creado, modificado o suprimido archivos de usuario en ninguna de las pruebas.
El investigador del grupo antiterrorista de la DIJIN, Ronald Hayden Coy Ortiz, posteriormente aceptó ante un juez colombiano especializado y en audiencia pública, que se rompió la cadena de custodia en los computadores de Raúl Reyes; es decir, en un determinado tiempo, los computadores estuvieron expuestos a posibles manipulaciones. Esto hace que cualquier información que se quiera tomar como prueba para un caso judicial, no pueden tomarse como evidencias, ya que no existen las certificaciones necesarias de la cadena de custodia, las cuales certifiquen que no se produjeron manipulaciones al computador incautado.
El gobierno colombiano pidió a la Fiscalía de dicho país, comenzar de inmediato los procesos judiciales.El Espectador: Gobierno insta a la Fiscalía a comenzar investigaciones por el computador de Reyes
Reacciones : El presidente venezolano Hugo Chávez calificó la presentación de la información como un «Show de payasos» y de «ridiculez», agregó: «montado por un policía gringo, agresivo, corrupto y vagabundo, sobre el cual no vale perder tiempo» refiriéndose a Ronald K. Noble.El Unviersal (Venezuela): "Show y ridiculez" de laptop provoca revisión de relaciones
También lanzó agravios contra el chileno Arturo Herrera, también funcionario de Interpol, argumentando que éste había trabajado para la policía durante la dictadura militar de Augusto Pinochet en Chile y de haber participado en la Operación Retiro de televisores, en la que los cadáveres de ejecutados durante la dictadura de Augusto Pinochet fueron exhumados ilegalmente y lanzados al mar, para evitar que los crímenes salieran a luz pública. El Gobierno chileno descartó que Arturo Herrera estuviera implicado en el encubrimiento de violaciones a los derechos humanos.
250px|thumb|right|Raúl Reyes. Contenido de computadores
Viktor Bout Además de desatar la crisis diplomática entre Colombia y Venezuela-Ecuador, la información encontrada en los computadores reveló el nexo con las FARC-EP de un traficante de armas llamado Viktor Bout y ayudó a su posterior localización y captura en Tailandia el jueves 6 de marzo de 2008. Bout, también llamado "el mercader de la muerte" es acusado de suministrar armas a las FARC-EP además de otros grupos terroristas. Bout es requerido por la justicia de Estados Unidos, Rusia, Tailandia y Colombia. Caleta en Costa Rica
Con información tomada del computador de Reyes, las autoridades colombianas informaron a las autoridades costarricenses de la existencia de un dinero perteneciente a Raúl Reyes y alias Rodrigo Granda. El monto del dinero encontrado fue de 480 000 dólares camuflados y que serían enviados a Colombia a petición de estos. El dinero fue dado a una pareja costarricense: Francisco Gutiérrez Cruz y Mery Prado Rojas, quienes dijeron que desde 1997 o 1998 guardaban en su casa la caja fuerte por solicitud directa de Granda, pero alegaron no saber el contenido real en la caja fuerte.El Tiempo (Colombia): Guardianes de caleta de las Farc en Costa Rica conocían a 'Rodrigo Granda' y a 'Raúl Reyes'
Uranio empobrecido Gobierno colombiano halló en la vereda (caserío) Pasquila, de la comuna 20 de Bogotá unos 30 kilos de uranio empobrecido, localizado tras revisar la información de los ordenadores del guerrillero Raúl Reyes. Según el general de las fuerzas militares de Colombia Freddy Padilla de León las FARC-EP al parecer pretendían crear una "bomba sucia". El vicepresidente Francisco Santos denunció esto ante la Conferencia de Desarme de las Naciones Unidas que se llevó a cabo en Europa.
El 19 de marzo de 2008 las FARC-EP emitieron un comunicado en el desmentían dicha información ya que no tenían los medios para procesar dicho material.
Iván Cepeda Iván Cepeda Castro es un político y defensor de derechos humanos colombiano, senador de la República, reconocido por su trabajo en temas de víctimas del conflicto armado y memoria histórica.
Tras la Operación Fénix de 2008, en la que murió el comandante de las FARC Raúl Reyes, se incautaron computadores con correos atribuidos a la guerrilla. En uno de esos mensajes, Reyes afirma: “Por pedido del compañero Iván Cepeda estoy coordinando la unidad de las marchas que se harán en todos los países el próximo 6 de marzo.” Estas menciones generaron controversia política; sin embargo, no dieron lugar a decisiones judiciales contra Cepeda, quien negó vínculos con las FARC y sostuvo que dichas interpretaciones carecen de sustento probatorio.
Plan para derribar aviones Según información revelada por el diario español El País, las FARC-EP estaban planeando derribar diez aviones del Ejército Nacional para "cambiar las reglas de la guerra en Colombia". Jorge Briceño, alias el Mono Jojoy, su hermano Grannobles y Henry Castellanos Alias Romaña habrían sido los encargados de desarrollar esa acción, considerada por Raúl Reyes una operación para cambiar el diseño de la seguridad.
Acuerdo humanitario
Alias "Teodora de Bolívar" La senadora colombiana Piedad Córdoba fue envuelta en el escándalo. Según el ministro de Defensa de Colombia, se encontró una serie de documentos donde aparentemente Raúl Reyes le asignó un correo electrónico a la senadora, usando el seudónimo de «Teodora de Bolívar».El Tiempo (Colombia): Investigan si senadora Piedad Córdoba estaría mencionada en computador de 'Raúl Reyes' El ministerio adujo que en un documento fechado el 14 de junio de 2007 (dos meses antes de que Córdoba fuese designada facilitadora por el presidente Álvaro Uribe), Reyes le pidió a una guerrillera incluir a la senadora en un listado para enviarle documentos de las FARC-EP, y le pidió que la llamasen Teodora de Bolívar.
Piedad Córdoba dijo que los computadores de Reyes eran una farsa y montaje del gobierno colombiano para vincularla con las FARC-EP y negó cualquier relación con el seudónimo de Teodora.El Espectador: Piedad Córdoba denuncia montaje del Gobierno para vincularla con las Farc
En octubre de 2010, el entonces jefe de la Procuraduría General de la Nación (Ministerio Público) Alejandro Ordóñez, reveló en una entrevista hecha para la revista colombiana Semana, que no existían correos electrónicos en los computadores de Raúl Reyes. Asimismo mucho tiempo atrás, en declaraciones hechas por uno de los investigadores de la DIJIN cap. Ronald Hayden Coy Ortiz, aseguró que no encontró correos electrónicos en los computadores de Raúl Reyes si no documentos word.
Entrenamiento guerrillero a Fuerzas Armadas de Venezuela Según la interpretación de los documentos de los computadores de "Reyes", Venezuela habría ayudado a armar a los insurgentes y junto con las FARC-EP acordaron un plan común de la seguridad y se buscó el entrenamiento básico en técnicas de la guerrilla a las fuerzas militares venezolanas. El gobierno colombiano reiteró que jamás manipuló los cerca de 16.000 archivos que contenían los portátiles del subversivo.El Espectador: Gobierno insiste en que no manipuló información de computadores de ‘Reyes'
Vínculos con Chávez
Pago de fianza a Chávez
En los documentos revelados por el gobierno colombiano se incluye una correspondencia de Raúl Reyes en la que destaca el supuesto agradecimiento de Chávez por la ayuda recibida por las FARC-EP cuando estaba en prisión, en 1992, después de intentar un golpe de estado, por 100 millones de pesos, unos 50 000 dólares a la tasa de cambio del momento.El Tiempo (Colombia): Ecuador estaba traficando con secuestrados con fines políticos, afirma Gobierno colombiano
Alias "Ángel" El Wall Street Journal y el periódico El País de España revelaron que "Ángel", el supuesto pseudónimo de Chávez en la correspondencia de las FARC-EP, habría puesto en contacto a las FARC-EP con traficantes de armas internacionales que las enviarían vía Maracaibo. De acuerdo con información que obtuvo la revista colombiana Semana de los computadores, a través de emisarios como el ex ministro del interior de Venezuela, Ramón Rodríguez Chacín, o miembros retirados del ejército, Venezuela habría aportado supuestamente 300 millones de dólares a las FARC-EP.
Masacre en el Estado Apure, Venezuela