Las favelas en la ciudad de Manaos comenzaron a aparecer a finales del , cuando diversas transformaciones socioeconómicas que vivía Brasil y transformaciones locales comenzaron a engrosar la zona central de la ciudad, formándose las primeras aglomeraciones subnormales.

Durante más de 350 años, Manaos ha alcanzado el desarrollo, pero el crecimiento desorganizado y sin planificación ha causado una serie de problemas ambientales en la ciudad. Varias zonas de Manaos surgieron y se convirtieron en barrios tras la invasión de terrenos públicos y privados. Este problema histórico se desencadenó por la falta de vivienda asequible. La incidencia de invasiones se intensificó con el aumento de la población resultante de la migración de personas de municipios del interior a la capital, además de los migrantes que llegaron de otros estados en busca de trabajo y mejores oportunidades de vida en Manaos tras el auge industrial. Por otro lado, también existen indicios de la existencia de apropiación de tierras. Un mercado criminal para la venta de terrenos ocupados irregularmente, que, según la policía, podría estar vinculado al crimen organizado.

Según datos del Ministerio de las Ciudades, el municipio tenía un déficit de aproximadamente 68.483 unidades habitacionales hasta 2006. Esto equivaldría, según dicha investigación, a aproximadamente 300.000 ciudadanos sin acceso a vivienda formal o viviendo en viviendas precarias. Según datos del IBGE de 2010, el barrio Cidade de Deus tiene el mayor número de favelas, con 10.559 viviendas en zonas desfavorecidas.

Los urbanistas y estudiosos de las cuestiones urbanas de Manaus señalan la región comprendida entre los ríos Solimões y Negro, así como el arroyo Mindu, como el área urbana donde el gobierno de la ciudad ha actuado históricamente con mayor rigor y planificación por parte de los poderes públicos, así como el área en la que los poderes públicos más han invertido, y donde se encuentran la mayoría de los barrios con mejores indicadores sociales de la ciudad. Esta región viene perdiendo población y presentando una densidad poblacional decreciente, a pesar de ser la zona de la ciudad con mayor índice de infraestructura y equipamientos sociales. Las poblaciones de menores ingresos y los delincuentes acaban invadiendo las zonas de los bordes del municipio, que están más desprovistas de infraestructura. Cabe mencionar, sin embargo, que incluso dentro del área delimitada por estos ríos existen algunas regiones de exclusión social, como la favela Ceasa, en el barrio de Mauazinho. Por otro lado, también existen algunas zonas de alta renta como Flores, Parque 10 de Novembro, Cidade Nova y los condominios Tarumã, que se ubican fuera del área delimitada por estos ríos.

Las regiones Centro-Sur, Norte e Este son las más afectadas por la reurbanización de la ciudad. El ayuntamiento continúa expropiando viviendas ubicadas a orillas del arroyo Mindu. También se está construyendo un Corredor Ecológico en la zona, un proyecto que conectará las zonas Norte y Centro-Sur con el Este. Manaos es la única ciudad brasileña que cuenta con un corredor ecológico.

Además de la dualidad centro-periferia que explica en parte la desigualdad social en la ciudad, también hay puntos donde el contraste es visible y coexisten grupos con perfiles de ingresos diversos, como es el caso de barrios como Cidade Nova, Aleixo y São José, que cuentan con conjuntos habitacionales de alta renta ubicados cerca de zonas de favelas.

thumb|250px|Variación del tejido urbano en la Zona Centro-Sur. Zonas contiguas, verticalizadas y edificios de baja altura.

Sin embargo, otros expertos señalan que la zona alrededor de la Avenida Torquato Tapajós estaba escasamente poblada debido al terreno anegado e insalubre de esa región cerca del límite del área urbana. La población construyó sus viviendas en el barrio de Santa Etelvina, ubicado más arriba. La ocupación de la avenida se produjo tras inversiones inmobiliarias privadas que consistieron en la construcción de varios condominios y oficinas, lo que cambió el perfil de esa región. El Instituto Municipal de Planificación Urbana (Implurb) y el Instituto Nacional del Patrimonio Histórico y Artístico (Iphan) firmaron un acuerdo con el objetivo de impulsar proyectos de infraestructura para Manaos, especialmente para el programa de revitalización del centro de la ciudad.

Debido a la creciente degradación del centro de la ciudad, se han sugerido algunos proyectos de renovación, recalificación y revitalización urbana. Barrios ubicados fuera del centro expandido, como Japiim, que hace años albergaba a una población pobre y trabajadora, y que hasta hace pocos años carecía de infraestructura, han experimentado una importante transformación económica. Hoy en día, estos barrios cuentan con instalaciones comerciales y cierta inversión en infraestructura. Otros investigadores atribuyen el gran crecimiento económico de la década de 1970 (conocido como el «milagro económico») y la llegada de miles de migrantes en busca de mejores condiciones de vida como la causa de los problemas de ocupación irregular en la ciudad

El suministro de agua en la ciudad es proporcionado por la empresa Águas de Manaus. La empresa ha estado trabajando para universalizar el suministro de agua y ampliar el acceso al saneamiento, del 35 % actual al 80 %, para 2030. La ciudad también cuenta con 36 plantas de tratamiento de agua y alcantarillado, de las cuales 25 están en funcionamiento, dos están desactivadas y nueve no funcionan. Aproximadamente el 22 % del área urbana de la ciudad está deforestada. La distribución de electricidad está a cargo de la empresa Amazonas Energia.

Véase también Manaos

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