thumb|Primera página del Génesis de la primera edición de 1611 de la King James Version autorizada. La KJV es una traducción inglesa moderna de la Biblia realizada por ciertos miembros de la Iglesia de Inglaterra que se inició en 1604 y se completó en 1611."And now at last, ...it being brought unto such a conclusion, as that we have great hope that the Church of England (sic) shall reape good fruit thereby..."Epistle Dedicatorie. The Authorized King James Version of the Holy Bible. 1611 – Wikisource. right|thumb|190px|John Winthrop (1587/8-1649), Gobernador de la Colonia de la Bahía de Massachusetts, que lideró a los puritanos en la Gran Migración, a partir de 1630. En el Cristianismo en el siglo XVII destaca la actividad misionera cristiana del en Asia y América creció con fuerza, echó raíces y desarrolló sus instituciones, aunque se encontró con la fuerte resistencia en Japón en particular. Al mismo tiempo, la colonización cristiana de algunas zonas fuera de Europa tuvo éxito, impulsada tanto por razones económicas como religiosas. Los comerciantes cristianos estaban muy implicados en el comercio de esclavos en el Atlántico, que tenía como efecto el transporte de africanos a las comunidades cristianas. La guerra terrestre entre el cristianismo y el islam continuó con las campañas de la monarquía de los Habsburgo y el Imperio Otomano en los Balcanes, con un punto de inflexión en Viena en 1683. El Zarato ruso, donde la Cristianismo Ortodoxo era la religión establecida, se expandió hacia el este, a Siberia y Asia Central, regiones de creencias islámicas y chamanistas, y también hacia el suroeste, a Ucrania, donde surgieron las Iglesias Católicas Orientales uniatas.
Se publicó un gran volumen de literatura cristiana, especialmente polémica y milenarista, pero también histórica y erudita. La Hagiografía se hizo más crítica con los Bolandistas, y la historia eclesiástica se desarrolló y debatió a fondo, con eruditos católicos como Baronius y Jean Mabillon, y protestantes como David Blondel marcando las líneas de la erudición. El arte cristiano del Barroco y la música derivada de las formas eclesiásticas llamaron la atención e influyeron en los artistas laicos que utilizaban expresiones y temas profanos. La poesía y el teatro trataban a menudo asuntos bíblicos y religiosos, por ejemplo El paraíso perdido de John Milton.
Cambio de actitudes protestantes y católicas A principios de siglo Jacobo I de Inglaterra se opuso al poder de deposición papal en una serie de obras polémicas,W. B. Patterson, King James VI and I and the Reunion of Christendom (1997), pp. 50,86 y el asesinato de Enrique IV de Francia provocó una intensa atención a las doctrinas teológicas relacionadas con el tiranicidio.Roland Mousnier, The Assassination of Henry IV: The Tyrannicide Problem and the Consolidation of the French Absolute Monarchy in the Early 17th Century, Part II (1973 English translation) Tanto Enrique como Jacobo, de diferentes maneras, persiguieron una política pacífica de conciliación religiosa, destinada a sanar finalmente la brecha causada por la Reforma protestante. Aunque el progreso en esta línea parecía más posible durante la Tregua de los Doce Años, los conflictos posteriores a 1620 cambiaron el panorama; y la situación de Europa occidental y central tras la Paz de Westfalia dejó una polarización más estable pero arraigada de estados territoriales protestantes y católicos, con minorías religiosas.
Los conflictos religiosos en la Francia católica en torno al jansenismo y Port-Royal dieron lugar a la polémica obra Lettres provinciales de Blaise Pascal. En ella arremetía contra el clima imperante en la teología moral, especialidad de la orden jesuita y la actitud del Collège de Sorbonne. Pascal argumentó contra la casuística de la época desplegada en los "casos de conciencia", en particular las doctrinas asociadas al probabilismo.
A finales del , el Dictionnaire Historique et Critique de Pierre Bayle representaba los debates actuales en la República de las Letras, una red mayoritariamente laica de eruditos y sabios que comentaban en detalle tanto las cuestiones religiosas como las científicas. Los partidarios de una mayor tolerancia religiosa —y de una línea escéptica respecto a muchas creencias tradicionales— defendieron con creciente éxito cambios de actitud en muchos ámbitos (como el descrédito de las Falsas Decretales y la leyenda de la papisa Juana, la magia y la brujería, el milenarismo y los extremos de la propaganda anticatólica, y la tolerancia de los judíos en la sociedad).
Polemicismo y eirenismo Las disputas entre católicos y protestantes dieron lugar a una importante literatura polémica, escrita tanto en latín para atraer a la opinión internacional entre los cultos, como en lenguas vernáculas. En un clima en el que se pensaba que la opinión estaba abierta a la discusión, la producción de literatura polémica formaba parte del papel de los prelados y otros eclesiásticos prominentes, académicos (en universidades) y seminaristas (en colegios religiosos); e instituciones como el Chelsea College en Londres y el Arras College en París se crearon expresamente para favorecer este tipo de escritos.
Los grandes debates entre protestantes y católicos resultaron inconclusos, y las cuestiones teológicas dentro del protestantismo fueron divisorias, también se produjo un retorno al Irenismo: la búsqueda de la paz religiosa. David Pareus fue un destacado Teólogo reformado que favoreció un enfoque basado en la conciliación de puntos de vista. Otras figuras destacadas como Marco Antonio de Dominis, Hugo Grocio y John Dury trabajaron en esta dirección.
Herejía y demonología La última persona en ser ejecutada en el fuego por herejía en Inglaterra fue Edward Wightman en 1612. De hecho, la legislación relativa a esta pena no se modificó hasta 1677, fecha a partir de la cual los condenados por herejía sufrirían como máximo excomunión.Keith Thomas, Religion and the Decline of Magic Las acusaciones de herejía, ya fueran el resurgimiento de debates de la Antigüedad Tardía como los del pelagianismo y el arrianismo o puntos de vista más recientes como el socinianismo en teología y el copernicanismo en filosofía natural, siguieron desempeñando un papel importante en la vida intelectual.
Al mismo tiempo que la persecución judicial de la herejía se hacía menos severa, el interés por la demonología era intenso en muchos países europeos. Los argumentos escépticos contra la existencia de la brujería y la posesión demoníaca seguían siendo rebatidos en la década de 1680 por los teólogos. La Gangraena de Thomas Edwards utilizó un marco que equiparaba herejía y posesión para llamar la atención sobre la variedad de opiniones protestantes radicales vigentes en la década de 1640.
Juicio a Galileo thumb|Galileo ante el Santo Oficio, pintura del de Joseph-Nicolas Robert-Fleury. En 1610, Galileo Galilei publicó su Sidereus Nuncius, en el que describía las observaciones que había realizado con el nuevo telescopio. Estos y otros descubrimientos pusieron de manifiesto dificultades en la comprensión de los cielos vigentes desde la antigüedad y despertaron el interés por enseñanzas como la teoría heliocéntrica de Copérnico.
Como reacción, eruditos como Cosimo BoscagliaMichael Sharratt, Galileo: Decisive Innovator (2000), p. 109. sostenían que el movimiento de la Tierra y la inmovilidad del Sol eran heréticos, ya que contradecían algunos relatos de la Biblia tal y como se entendía en aquella época. La participación de Galileo en las controversias sobre teología, astronomía y filosofía culminó con su juicio y condena en 1633, bajo sospecha de herejía.
El Caso Galileo —el proceso por el que Galileo entró en conflicto con la Iglesia Católica por su apoyo a la astronomía copernicana— se ha considerado a menudo un momento decisivo en la historia de la relación entre ciencia y religión.
Protestantismo thumb|170px|right|Jiří Třanovský (1592-1637)- el "Luther de los eslavos" que actuó en Bohemia, Moravia, Polonia y Eslovaquia. Las tierras protestantes a principios del se concentraban en el norte de Europa, con territorios en Alemania, Escandinavia, Inglaterra, Escocia, y zonas de Francia, Países Bajos, Suiza, Reino de Hungría y Polonia. Se vieron fuertes luchas, en algunos casos continuación de los conflictos religiosos de los siglos anteriores, sobre todo en los Países Bajos y en el Electorado del Palatinado (que vio el estallido de la guerra de los Treinta Años). En Irlanda hubo un intento concertado de crear "plantaciones" de colonos protestantes en lo que era un país predominantemente católico, y las luchas con una dimensión religiosa fueron graves en las décadas de 1640 y 1680. En Francia, el asentamiento propuesto por el Edicto de Nantes se fue reduciendo, en perjuicio de la población hugonote, y el edicto fue revocado en 1685.
La Europa protestante se dividió en gran parte en Luteranos y Reformados (calvinistas), con la Iglesia de Inglaterra manteniendo una posición separada. Los esfuerzos por unificar a luteranos y calvinistas tuvieron poco éxito; y la ambición ecuménica de superar el cisma de la Reforma protestante siguió siendo casi totalmente teórica. La Iglesia de Inglaterra bajo William Laud se acercó seriamente a figuras de la Iglesia ortodoxa, buscando un terreno común.
Dentro del calvinismo se produjo una importante escisión con el auge del arminianismo; el Sínodo de Dort de 1618-19 fue una reunión nacional pero con repercusiones internacionales, ya que la enseñanza de Arminio fue firmemente rechazada en una reunión a la que fueron invitados teólogos protestantes de fuera de los Países Bajos. La Asamblea de Westminster de la década de 1640 fue otro gran concilio que se ocupó de la teología reformada, y algunas de sus obras siguen siendo importantes para las denominaciones protestantes.
Movimiento puritano y guerra civil inglesa En la década de 1640, Inglaterra, Escocia, Gales e Irlanda sufrieron luchas religiosas comparables a las que habían padecido sus vecinos algunas generaciones antes. El rencor asociado a estas guerras se atribuye en parte a la naturaleza del movimiento puritano, una descripción admitida como insatisfactoria por muchos historiadores. En sus primeras etapas, el movimiento puritano (finales del -) defendía la reforma de la Iglesia de Inglaterra, dentro de la tradición calvinista, con el objetivo de que ésta se asemejara más a las iglesias protestantes de Europa, especialmente Ginebra. Los puritanos se negaron a respaldar completamente todas las indicaciones y fórmulas rituales del Libro de Oración Común; la imposición de su orden litúrgico por la fuerza legal y la inspección agudizaron el puritanismo hasta convertirlo en un movimiento de oposición definido.
La guerra civil inglesa fue una serie de conflictos armados y maquinaciones políticas entre Parlamentarios y Realistas. La primera (1642-46) y la segunda (1648-49) enfrentaron a los partidarios del rey Carlos I contra los partidarios del Parlamento Largo, mientras que la tercera guerra (1649-51) vio la lucha entre los partidarios del rey Carlos II y los partidarios del Parlamento Rump. Las guerras terminaron con la victoria parlamentaria en la Batalla de Worcester el 3 de septiembre de 1651.
La guerra condujo al juicio y ejecución de Carlos I, al exilio de su hijo, Carlos II, y a la sustitución de la monarquía inglesa por, primero, la Commonwealth de Inglaterra (1649-53) y, después, por un protectorado (1653-59) bajo el gobierno personal de Oliver Cromwell. En Irlanda la victoria militar de las fuerzas parlamentarias estableció la Ascendencia Protestante.
thumb|Mapas del territorio en poder de realistas (rojo) y parlamentarios (verde), 1642-1645.