La Plena Edad Media en Rumania comenzó con la retirada de los mongoles, la última de las poblaciones migratorias en invadir el territorio de la Rumania moderna, después de su ataque de 1241-1242. Y la época medieval terminó con el reinado de Miguel el Valiente (r. 1593-1601), quien logró, durante un corto tiempo en 1600, gobernar los tres principados de Valaquia, Moldavia y Transilvania, cuyos territorios se unirían unos tres siglos más tarde para forma Rumania.

Durante la mayor parte de ese período, el Banato, Crişana, Maramureş y Transilvania, ahora regiones de Rumania al oeste de los Cárpatos, formaron parte del Reino de Hungría. Se dividieron en varios tipos de unidades administrativas, como «condados» y «sedes». Los cabezas de los condados de Transilvania o "condes" estaban subordinados a un funcionario real especial llamado voivoda, pero la provincia rara vez se trataba como una sola unidad, ya que los asientos de sículos y sajones se administraban por separado. En el reino, los campesinos rumanos, al ser ortodoxos, estaban exentos del diezmo (tithe), un impuesto eclesiástico que pagaban todos los plebeyos católicos. Sin embargo, los nobles rumanos perdieron lentamente la capacidad de participar en la vida política, ya que los monarcas del siguieron una política ferviente a favor de los católicos. Su situación empeoró aún más después de 1437, cuando se formó la llamada «Unión de las Tres Naciones», una alianza de los nobles húngaros, los sículos y los sajones, para aplastar el levantamiento campesino de Bobâlna.

Valaquia, el primer estado medieval independiente entre los Cárpatos y el bajo Danubio se creó cuando Basarab I de Valaquia (ca. 1310-1352) puso fin a la soberanía del rey de Hungría con su victoria en la batalla de Posada en 1330. La independencia de Moldavia, al este de los Cárpatos, la logró Bogdan I (r. 1359-1365), un noble de Maramureş, quien encabezó una revuelta contra el exgobernante que fue designado por el monarca húngaro. La independencia de los dos principados, sin embargo, rara vez fue segura, y el vasallaje a varios estados se convirtió en un aspecto importante de su diplomacia. Aunque Valaquia rindió homenaje al Imperio otomano desde 1417 y a Moldavia desde 1456, sus dos monarcas medievales, Mircea el Viejo de Valaquia (r. 1386-1418) y Esteban el Grande de Moldavia (r. 1457-1504) llevaron a cabo exitosas operaciones militares contra los turcos otomanos. El comercio de los dos principados con otras partes de Europa comenzó a disminuir después de las últimas décadas del . Antes de esto, la venta de pieles, cereales, miel y cera al Sacro Imperio Romano Germánico, Venecia y Polonia, y la importación de seda, armas y otros productos manufacturados de esas áreas se había generalizado, pero a finales del el Imperio otomano se convirtió en el principal mercado de productos rumanos.

Transilvania, junto con los condados vecinos, ganó el estatus de un estado autónomo bajo la soberanía otomana después de que los territorios centrales del Reino de Hungría fueran anexionados por los otomanos en 1541. La caída del reino también privó a Valaquia y a Moldavia de su principal aliado en la lucha contra el Imperio otomano. En 1594, Miguel el Valiente de Valaquia se unió a la alianza anti-otomana iniciada por el papa Clemente VIII. Después de una serie de victorias sobre los otomanos, se volvió contra Transilvania y Moldavia, donde reinaban príncipes propolacos y prootomanos. Invadió y ocupó Transilvania en 1599 y Moldavia en 1600. Aunque la unión personal de los tres principados fracasó cuatro meses después, sirvió como un ideal para las generaciones posteriores que trabajaron por la unificación de las tierras que ahora forman Rumania.

Edad Media Temprana

thumb|right|200px|Los Cárpatos y los principales ríos de la Rumanía moderna thumb|right|200px|Regiones históricas de Rumania thumb|right|200px|La derrota de los cumanos en la batalla del río Kalka les llevó a aceptar su dependencia del rey de Hungría

A finales del , el establecimiento del kaganato jázaro al norte de las montañas del Cáucaso creó un obstáculo en el camino de los nómadas que se desplazaban hacia el oesteSpinei 2009, pp. 47 – 49. En el período siguiente, la población local del área de los Cárpatos y del Danubio se benefició del clima político pacífico y de una cultura material unitaria, llamada "Dridu", que se desarrolló en la región.Spinei 2009, p. 50. Los hallazgos de los asentamientos de Dridu, como cuchillas y hoces, confirman el papel de la agricultura en su economía.Spinei 2009, p. 223. En el comenzaron los movimientos centrífugos en el kaganato jázaro. Uno de los pueblos sometidos, los húngaros abandonaron su dominio y se establecieron en la región entre los ríos Don y Dniéster. Abandonaron las estepas y cruzaron los Cárpatos alrededor de 896. Según la Gesta Hungarorum (Hechos de los húngaros) del , en el momento de la invasión húngara Transilvania estaba habitada por rumanos y eslavos y gobernados por Gelou, «un cierto rumano», mientras que Crişana estaba habitada por varios pueblos, entre ellos sículos. Si el autor de la Gesta tenía algún conocimiento de las condiciones reales del cambio de siglo y sigue siendo debatido por los historiadores.Spinei 2009, p. 75.

En 953 el gyula, el segundo líder en rango de la federación tribal húngara, se convirtió al cristianismo en Constantinopla. Alrededor de ese tiempo, según el emperador bizantino Constantino VII, los húngaros controlaban la región en la frontera de la actual Rumanía y Hungría a lo largo de los ríos Timiş, Mureş, Criş, Tisa y Toutis. En 1003, como narran los Anales de Hildesheim, Esteban I, el primer monarca coronado de Hungría (c. 1000-1038) «dirigió un ejército contra su tío materno, el rey Gyula», y ocupó el país de Gyula.

Esteban I otorgó privilegios a la Iglesia católica, por ejemplo al ordenar la imposición general del diezmo a la población. Los entierros en la mayoría de los cementerios precristianos locales, por ejemplo en Hunedoara, solo cesaron alrededor de 1100. Esteban I también dividió su reino, incluidos los territorios de la Rumanía moderna que había ocupado, en condados, es decir, unidades administrativas alrededor de las fortalezas reales, cada una administrada por un oficial real llamado conde. Con el tiempo, el voivoda, un alto funcionario real atestig­o por primera vez en 1176, se convirtió en el principal de todos los condes de Transilvania. En contraste con Transilvania, los condes en las modernas regiones del Banato y Crişana permanecieron en contacto directo con el rey que los nombraba y reemplazaba a voluntad. Desde finales del , los pechenegos controlaban los territorios al este y al sur de los Cárpatos. Según la saga de Eymund, lucharon junto con los Blökkumen ("rumanos") en la Rus de Kiev en la década de 1010.Spinei 2006, pp. 103 – 105. Los pechenegos fueron barridos de sus territorios por los cumanos entre 1064 y 1078. Una variante tardía de la crónica túrquica más antigua, el nombre de Oghuz relata que los cumanos derrotaron a muchas naciones, incluida la Ulâq ('rumanos'). Algunos de los pechenegos huyeron al Reino de Hungría, donde fueron empleados para vigilar los distritos fronterizos, por ejemplo, en Transilvania.

Los asentamientos del en Transilvania se caracterizan por pequeñas chozas con conjuntos de cerámica marcados por calderos de arcilla. El creciente número de hallazgos de monedas sugiere que la provincia experimentó un crecimiento económico a finales del . El primer documento perteneciente a la provincia es una carta real de 1075 que se refiere a los impuestos sobre la sal recaudados en Turda. La mina de metales preciosos más antigua de la Transilvania medieval, la mina de plata de Rodna aparece mencionada por primera vez en 1235.

En los siglos y llegaron a Transilvania hospites ('colonos invitados') procedentes de Germania y de las regiones francófonas del río Rin, que con el tiempo se conocieron colectivamente como «sajones». En 1224, Andrés II de Hungría (r. 1205-1235) otorgó libertades especiales a los sajones que se habían establecido en el sur de Transilvania. Por ejemplo, estaban autorizados a elegir a sus líderes locales; sólo el jefe de toda la comunidad, el conde de Sibiu, era nombrado por el rey. También se les concedió el derecho a utilizar «el bosque de los rumanos y los pechenegos». Las primeras referencias a la vinicultura en Transilvania están conectadas a los viñedos de los hospites de Cricău, Ighiu y Romos.

thumb|Ruinas del monasterio de Cârţa

Como resultado de la inmigración sajona, los sículos—guerreros libres de habla húngara que cultivaban tierras comunales—, fueron trasladados al sureste de la provincia. Desde el fueron gobernados independientemente del voivoda por un funcionario real, el conde de los sículos. Además de los sajones, los cistercienses se convirtieron en agentes de expansión en Transilvania. Cuando se estableció su abadía en Cârța a principios del , Andrés II ordenó que la franja de tierra que se extendía hacia las montañas entre los cortos ríos Olt, Cârţişoara y Arpaş pasará de los rumanos al nuevo monasterio.

Tras la derrota de los cumanos por los mongoles en el río Kalka en 1223, algunos jefes de las tribus cumanas occidentales aceptaron la autoridad del rey de Hungría. Su conversión llevó a la creación de la diócesis católica de Cumania al este de los Cárpatos.Spinei 2006, p. 154. Sin embargo, la población rumana ortodoxa del territorio habría recibido los sacramentos de «algunos pseudo-obispos del rito griego», según una bula papal de 1234.Spinei 2006, pp. 154 – 155. En 1233 Oltenia se organizó en una frontera militar zona del Reino de Hungría, llamada Banato de Severin.

La expansión a través de los Cárpatos fue detenida por la invasión de los mongoles que duró desde el 31 de marzo de 1241 hasta abril de 1242. Fue un hito importante en la historia medieval de la región: aunque el número de bajas es discutido, incluso las estimaciones más prudentes no descienden del 15% de la población total.

Alta Edad Media (1242-1396)

Regiones de los Cárpatos Exteriores

Después de la retirada del Reino de Hungría, las fuerzas mongolas se detuvieron en Sarai (ahora Rusia) en el río Volga, donde su líder, Batu Khan, estableció su propia capital. A partir de entonces, las estepas entre los ríos Dnieper y Danubio estuvieron bajo la influencia de los mongoles del Volga, conocidos como la Horda Dorada. Desde la década de 1260, un pariente de Batu, Nogai Khan se estableció en Isaccea en el Bajo Danubio y se convirtió en el amo absoluto de las regiones vecinas. Se independizó de la Horda de Oro alrededor de 1280, pero murió en una batalla en 1299.

A mediados del , los territorios mongoles más occidentales estaban sujetos a frecuentes ofensivas militares polacas y húngaras. El gran príncipe Olgierd de Lituania penetró más que cualquier ejército europeo hasta entonces en los territorios controlados por la Horda Dorada . En 1363, cerca del mar Negro, en la batalla de las Aguas Azules obtuvo una gran victoria sobre las tropas mongolas unidas en el Dnieper.

Regiones intracarpaticas

thumb|right|Iglesia ortodoxa rumana en Densuş thumb|right|Los dominios de Ladislao Kán y otros oligarcas en el Reino de Hungría a principios del siglo XIV thumb|right|Fortaleza de Ladislao Kán en Deva thumb|Asentamientos sajones en Transilvania

Tras haber sido atacada dos veces por los mongoles en un solo año, Transilvania sintió las consecuencias de la invasión de 1241-1242 durante más de dos décadas. Los centros administrativos de la provincia, como Alba Iulia y Cetatea de Baltă, habían sido destruidos. Debido a la severa despoblación, se inició un proceso de colonización organizada que se prolongó durante varias décadas. Por ejemplo, una nueva ola de colonización resultó en el establecimiento de los asientos sajones de Sighişoara y de Mediaș ; y el señor de Ilia recibió, en 1292, un permiso real para asentar a rumanos en las tierras que poseía.