thumb|right|upright=0.8|Protestante escocés en oración; estatua en la Abadía de Culross La religión escocesa en el incluye todas las formas de organización y creencia religiosa en el Reino de Escocia en el . La Reforma del creó una Iglesia de Escocia, conocida popularmente como kirk, predominantemente calvinista en doctrina y presbiteriana en estructura, a la que Jacobo VI añadió un estrato de obispos en 1584.
Si bien estos términos implican ahora diferencias en la doctrina, en el Episcopaliana significaba iglesias gobernadas por obispos, normalmente nombrados por el monarca; presbiteriana implicaba el gobierno de ancianos, nombrados por las congregaciones. En la década de 1630, alrededor del 90-95% de los escoceses eran miembros de la iglesia, y a pesar de los desacuerdos en el gobierno, había una alineación general en la doctrina calvinista. En el , las disputas religiosas solían girar en torno a los principios políticos, ya que se asumía que "la verdadera religión y el verdadero gobierno" eran lo mismo.
Aunque ambas eran nominalmente episcopales, la Iglesia de Inglaterra era muy diferente en doctrina y práctica religiosa. Esto significaba que los intentos de Carlos I de imponer unas leyes canónicas compartidas y una nueva liturgia, condujeron al Pacto Nacional. Los Covenanters consiguieron el control del gobierno tras las guerras de los obispos de 1638-1639, pero luego se dividieron en facciones. Los intentos de consolidar su victoria llevaron a la participación de Escocia en las Guerras de los Tres Reinos y, tras la derrota en la Guerra anglosajona de 1649-1651, a la incorporación a la Comunidad inglesa.
La Restauración de 1660 restableció una estructura episcopaliana, pero muchos ministros se negaron a aceptarla y celebraron servicios o conventículos fuera de la Iglesia establecida. Los levantamientos de los Covenanters en 1666 y 1679 indujeron una fase más intensa de persecución, conocida como "la época de la matanza", y terminó con la deposición del católico Juan VII a finales de 1688. En marzo de 1689, su hija protestante Mary y su marido Guillermo de Orange fueron aceptados como monarcas y el Acuerdo de 1690 eliminó definitivamente a los obispos.
Antecedentes
thumb|right|upright=0.7|John Knox El uso moderno de presbiteriano o episcopal implica diferencias tanto en el gobierno como en la doctrina, pero no era así en los siglos y . Las estructuras episcopales estaban gobernadas por obispos, normalmente nombrados por el monarca; las presbiterianas implicaban el gobierno de ancianos, nombrados por sus congregaciones. Las discusiones sobre el papel de los obispos tenían que ver tanto con la política y el poder del monarca como con la práctica religiosa.
La Reforma Protestante creó una Iglesia de Escocia o kirk presbiteriana en su estructura y gobierno y predominantemente calvinista en su doctrina. La adición de un sistema episcopal en 1584 dio lugar a una situación en la que los obispos presidían las estructuras presbiterianas, mientras que los lairds o herederos locales controlaban el nombramiento del clero en sus distritos. Las tensiones entre estos tres centros de poder impulsaron muchos de los conflictos políticos y religiosos que dominaron el .
En 1567, la católica María, reina de Escocia, fue exiliada a Inglaterra, donde fue encarcelada y posteriormente ejecutada. Fue sustituida por su hijo de un año Jacobo VI, que fue educado como protestante; en la década de 1630, el catolicismo se limitaba en gran medida a los miembros de la aristocracia y a las zonas remotas de habla gaélica de las Tierras Altas e Islas.
1600 a 1651, Guerras de los Tres Reinos
thumb|left|upright=0.8|Los disturbios iniciados por Jenny Geddes en la Catedral de St. Giles causaron las Guerras de los Obispos Jacobo afirmaba que su autoridad como monarca y jefe de la Iglesia provenía de Dios; cuando llegó a ser también rey de Inglaterra en 1603, una Iglesia unificada de Escocia e Inglaterra gobernada por obispos se convirtió en el primer paso de su visión de un Estado centralizado y unionista. Aunque ambas eran nominalmente episcopales, eran muy diferentes en cuanto a gobierno y doctrina; los obispos escoceses eran calvinistas doctrinales que consideraban muchas prácticas de la Iglesia de Inglaterra poco mejores que el catolicismo.
Dado que los calvinistas creían que una monarquía "bien ordenada" formaba parte del plan de Dios, la gran mayoría de los escoceses estaban de acuerdo en que la monarquía en sí misma estaba divinamente ordenada, pero no estaban de acuerdo en quién tenía la máxima autoridad en los asuntos clericales. El punto de vista de los Covenanters fue resumido por Andrew Melville como ...Thair is twa Kings and twa Kingdomes in Scotland... Chryst Jesús es el Rey y este Reino es el Kirk, cuyo súbdito es el Rey James el Sajón. Los monárquicos tendían a ser "tradicionalistas" en la religión y la política, pero había muchos otros factores, incluida la lealtad nacionalista al kirk, y los motivos individuales eran muy complejos.
En 1618, la Asamblea General aprobó a regañadientes los Cinco Artículos de Perth; estos incluían formas conservadas en Inglaterra pero en gran medida abolidas en Escocia y fueron ampliamente resentidas. Cuando Carlos I sucedió a Jacobo, el desconocimiento de Escocia le hizo aún más dependiente de los obispos, especialmente de John Spottiswoode, arzobispo de St Andrews, y propenso a tomar decisiones repentinas. La Ley de Revocación de 1625, que anulaba todas las concesiones de tierras realizadas por la Corona desde 1540, se hizo sin consultar y alienó a gran parte de la nobleza y el clero escoceses.
thumb|right|upright=0.8|La Liga y el Pacto Solemne acordados por los presbiterianos ingleses y escoceses en 1643 A pesar del reducido número de católicos escoceses, el temor al papismo seguía siendo generalizado, en parte debido a los estrechos vínculos culturales y religiosos entre los escoceses y los hugonotes franceses. El aumento de las restricciones por parte del Estado francés provocó una serie de rebeliones hugonotes, mientras que muchos escoceses también lucharon en la guerra de los Treinta Años de 1618 a 1648, un conflicto religioso que causó unos 8 millones de muertos.
Las preocupaciones aumentaron cuando Carlos I se casó con la católica Enriqueta María de Francia y luego aceptó el primer enviado papal desde la Reforma. En 1636, el Libro de Disciplina de John Knox fue sustituido por un nuevo Libro de Cánones, con la amenaza de excomunión para quien negara la supremacía del rey en los asuntos eclesiásticos. Seguido en 1637 por un Libro de Oración Común, que alentó una ira generalizada y disturbios, supuestamente provocados por Jenny Geddes durante un servicio en la catedral de St Giles.
La percepción de que la Iglesia estaba amenazada llevó a representantes de todos los sectores de la sociedad a firmar un Pacto Nacional el 28 de febrero de 1638, objetando las "innovaciones" litúrgicas. El apoyo al Pacto fue generalizado, excepto en Aberdeen y Banff, el corazón de la resistencia episcopaliana durante los siguientes 60 años. Argyll y otros seis miembros del Consejo Privado de Escocia apoyaron el Pacto; en diciembre, la Asamblea General expulsó a los obispos de la iglesia.
thumb|left|upright=0.8|Dunbar, 1650; la derrota en la tercera guerra civil inglesa llevó a la incorporación de Escocia a la Commonwealth.
Los esfuerzos de Carlos por imponer su autoridad condujeron a las Guerras de los Obispos de 1639 y 1640, en las que la victoria de los Covenanter los dejó en control de Escocia. Esto obligó a Carlos a convocar el Parlamento de Inglaterra, que había estado suspendido desde 1629 y, finalmente, dio lugar al estallido de la primera guerra civil inglesa en 1642. Los escoceses se mantuvieron neutrales al principio, pero enviaron tropas al Úlster para apoyar a sus correligionarios en la Rebelión irlandesa de 1641; la amargura de este conflicto radicalizó las opiniones en Escocia e Irlanda. Argyll consideraba que la unión religiosa y económica con Inglaterra era la mejor manera de preservar un kirk presbiteriano; en octubre de 1643, el Parlamento inglés firmó la Liga y Pacto Solemne, acordando la unión a cambio del apoyo militar escocés.
Los monárquicos y los moderados, tanto en Escocia como en Inglaterra, se opusieron por motivos religiosos y nacionalistas, al igual que los Independientes como Oliver Cromwell que estaban en contra de cualquier iglesia ordenada por el Estado. Los Covenanters y sus aliados ingleses consideraban a los Independientes, que dominaban el New Model Army, como una amenaza mayor que los monárquicos y, cuando Carlos se rindió en 1646, comenzaron las negociaciones para restaurarlo en el trono inglés. En diciembre de 1647, Carlos aceptó imponer el presbiterianismo en Inglaterra durante tres años y suprimir a los independentistas, pero su negativa a tomar él mismo el Pacto dividió a los convenencieros en Engagers y fundamentalistas del Partido Kirk o Whiggamores. La derrota en la segunda guerra civil inglesa supuso la ejecución de Carlos en enero de 1649 y que el Partido Kirk tomara el control de la Asamblea General.
En febrero de 1649, los escoceses proclamaron a Carlos II Rey de Escocia y Gran Bretaña; bajo los términos del Tratado de Breda, el Partido Kirk acordó restaurar a Carlos en el trono inglés, a cambio de su aceptación del Pacto. Un ejército escocés invadió Inglaterra, pero la derrota en la tercera guerra civil inglesa dio lugar a la incorporación de Escocia a la Mancomunidad de Inglaterra, Escocia e Irlanda en 1652.
1651 a 1660: la Mancomunidad thumb|upright=0.6|right|Ejecución del manifestante James Guthrie en 1661 Tras la derrota de 1651, la iglesia se dividió en dos facciones. Más de dos tercios del ministerio apoyaron la Resolución de diciembre de 1650, que readmitía a los monárquicos y a los compromisarios, y fueron conocidos como "resolutivos". Los 'Protestantes' eran en su mayoría antiguos fundamentalistas del Kirk Party o Whiggamores que achacaban la derrota al compromiso con los 'malignos'. Las diferencias entre ambos eran tanto religiosas como políticas, incluyendo el gobierno de la iglesia, la tolerancia religiosa y el papel de la ley en una sociedad piadosa.
Tras los acontecimientos de 1648-51, Cromwell decidió que la única forma de avanzar era eliminar el poder de la élite terrateniente escocesa y de la iglesia. En febrero de 1652, se otorgó a un nuevo Consejo de Escocia la responsabilidad de regular los asuntos religiosos, en lugar del kirk, y con libertad de culto para todas las sectas protestantes, como congregacionalistas y cuáqueros. Aparte de un pequeño número de protestantes conocidos como separatistas, la gran mayoría del kirk no aceptó estos cambios y Escocia se incorporó a la Commonwealth sin más consultas el 21 de abril de 1652.
Las disputas por el control de los presbiterios individuales hicieron que la división fuera cada vez más amarga y en julio de 1653 cada facción celebró su propia Asamblea General en Edimburgo. El comandante militar inglés en Escocia Robert Lilburne utilizó la excusa de los servicios eclesiásticos de Resolutioner rezando por el éxito del insurrección de Glencairn para disolver ambas sesiones. No se celebraron más Asambleas hasta 1690, la mayoría de los Resolucionarios se reunieron en "Consultas" informales y los Protestantes celebraron asambleas de campo o Conventillos fuera de las estructuras de las iglesias controladas por los Residentes.
thumb|left|upright=0.7|James Sharp, Resolutioner, más tarde arzobispo de St Andrews, asesinado en 1679