Manuel Bonilla puede referirse a varias personas:
Manuel Bonilla (cantautor), cantante y compositor de música cristiana. Manuel Bonilla Atencio, futbolista panameño. Manuel Bonilla Chirinos, expresidente y político hondureño. Manuel Bonilla Elhart, niño héroe de Perú y de la guerra del Pacífico. Manuel Bonilla Valle, maestro y político mexicano. Manuel Casimiro Bonilla, militar e historiador peruano.