La Comunidad Secreta es una novela de fantasía de Philip Pullman publicada en inglés el 3 de octubre de 2019 y en español el 19 de marzo de 2020. Es el segundo volumen de la trilogía El Libro de la Oscuridad. La Comunidad Secreta sigue a Lyra Lenguadeplata y al doctor Malcolm Polstead, ambos residiendo en la Universidad de Oxford: ella como estudiante en el Saint Sophia’s College y él como profesor en el Durham College. Este volumen de la trilogía transcurre veinte años después de los eventos de La Bella Salvaje y siete años después de El Catalejo Lacado.

Título La Comunidad Secreta hace referencia al "mundo de las hadas, los fantasmas y las luces espectrales"; es decir, a todos los seres mágicos o sobrenaturales que van más allá de nuestra comprensión, ocultos a simple vista. Pullman tomó prestado su título de La Comunidad Secreta de Robert Kirk, un tratado del siglo XVII que documentaba a los seres fantásticos procedentes de Escocia.

Aunque esta sería la interpretación oficial, la Comunidad Secreta también puede referirse a todas aquellas personas sin daimonions que ayudan a Lyra a lo largo de su aventura. A partir del cuaderno de Hassall y los nombres proporcionados por Sebastian Makepeace, Lyra descubre que muchas de estas personas, ignoradas por el resto de la sociedad, han formado una red de apoyo con el objetivo de ayudarse mutuamente, funcionando como una especie de “comunidad secreta”.

Trasfondo La historia se desenvuelve en un universo paralelo dominado por el Magisterio (llamado normalmente ‘’la Iglesia’’), una teocracia internacional que persigue activamente la herejía. En este mundo, las almas humanas existen fuera de sus cuerpos en la forma de seres sentientes llamados daimonions, que tienen forma animal y acompañan, ayudan y confortan a sus humanos. Un mecanismo argumental importante es el Aletiómetro, o lector de símbolos: un instrumento similar a una brújula o reloj, de cuyo tipo sólo se conocen seis en el mundo de Lyra. Al apuntar con tres manecillas del aletiómetro a los diversos símbolos en torno a su circunferencia, un practicante entrenado puede plantear preguntas, que son respondidas mediante el movimiento de una cuarta manecilla alrededor del dial.

Siete años después del final de El Catalejo Lacado, Lyra Lenguadeplata, previamente conocida como Lyra Belacqua, es universitaria en Oxford, donde estudia el aletiómetro. El joven Malcolm Polstead, personaje principal de La Bella Salvaje, ahora es doctor y profesor de historia en la universidad, en el Durham College, aunque Lyra no es consciente de su papel en su vida veinte años antes, cuando la cuidó durante los eventos del primer libro.

Lyra admira el trabajo de prominentes filósofos, que están ganando popularidad a través de Europa, que proponen que la racionalidad es la única manera correcta de entender el universo, y avanzan que los daimonions son una ilusión compartida por todos los humanos que carece de sustancia real. La relación entre Lyra y su daimonion, Pantalaimon, ha cambiado durante los meses previos. Durante los sucesos de El Catalejo Lacado, Lyra y Pantalaimon consiguen la capacidad de separarse libremente el uno del otro (lo que normalmente sólo es posible hacer unos pocos metros), y el segundo ha tomado la costumbre de vagar por el campo de noche sin Lyra.

Argumento La historia inicia una noche, cuando Pan, mientras recorre Oxford, presencia el asesinato de un hombre llamado Roderick Hassall a manos de dos agentes del Magisterio. Antes de morir, Hasall entrega a Pan una cartera, pidiendo que no deje que caiga en las manos equivocadas. En el interior de la misma, Pan y Lyra encuentran un ticket perteneciente a una taquilla de una estación de tren, de la cual, consiguen extraer un diario y un cuaderno repleto de nombres y direcciones.

Leyendo el diario, Lyra y Pan descubren que Hassall había participado en la investigación de unas rosas especiales que crecían en el desierto de Karamakán; cuyo aceite, estaba vinculado con el Polvo. Según Hassall, estas rosas llevan tiempo siendo arrasadas por unos misteriosos hombres de las montañas, los cuales, han estado destruyendo todo a su paso. En su viaje por el desierto de Karamakán, Hassall y su socio Strauss encontraron una misteriosa ciudad habitada por daimonions abandonados, conocida como Hotel Azul, así como un extraño edificio rojo donde los humanos debían renunciar a sus daimonions para poder entrar, sin esperanza alguna de salir. Strauss consiguió entrar, pero antes de desaparecer, había encomendado a Hassall que volviera a Oxford e informara de lo ocurrido con las plantaciones de rosas; tristemente, fue asesinado por los agentes del Magisterio antes de que pudiera terminar su misión.

A lo largo de los días siguientes, Lyra hace frente a importantes revelaciones: por un lado, su inevitable expulsión del Jordan College por parte del nuevo decano (debido a que los fondos que tenía para su educación se han agotado misteriosamente); y por otro, los extraños sucesos que vivió durante la Gran Inundación cuando sólo era un bebé. Esta historia es contada a Lyra por Malcolm Polstead (ahora agente de Oakley Street), Hannah Relf (mentora de Lyra) y Alice Lonsdale (antigua cuidadora de Lyra en el Jordan College), quienes creen que el Magisterio está volviendo a perseguirla, habiéndola retirado la protección del “asilo académico” y, posiblemente, el dinero para su educación. Al volver al Jordan College, Lyra descubre que los agentes del Magisterio han saqueado (sin éxito) su habitación en busca de la mochila de Hassall, y Malcolm decide enviarla a La Trucha para protegerla.

Durante su estancia en la vieja posada, la tensa relación entre Lyra y Pan acaba por explotar, con Pan acusando a Lyra de haberse vuelto apática, triste e ilusa por culpa de su obsesivo interés por las obras de filósofos modernos. A la mañana siguiente, Pan ha desaparecido, dejando a Lyra una sola nota que dice “He ido a buscar tu imaginación”. Creyendo que Pan la estará esperando en el Hotel Azul, Lyra pide ayuda a Dick Orchard (un antiguo amante) para que convenza al abuelo de éste, Giorgio Brabandt, de que la ayude a salir del país a bordo de su embarcación, Dama de Portugal. Brabandt accede, y Lyra consigue llegar a los Fens pocos días después, donde se reencuentra con Ma Costa y Farder Coram. Este último otorga a Lyra un pequeño bastón para que pueda defenderse en su aventura, aconsejándola además de que se haga pasar por bruja, a fin de no llamar la atención sobre su daimonion desaparecido. Lyra accede y se apresura a escribir a Malcolm para informarle sobre su viaje. Malcolm, quien también se dirigía hacia el Este para investigar los crecientes ataques en las plantaciones de rosas, se compromete a proteger a Lyra, esperando reunirse con ella durante su viaje.

Mientras todo esto sucede, Marcel Delamare, un ambicioso cardenal del Magisterio, propone celebrar en Ginebra un congreso para elegir al nuevo líder del Magisterio. El candidato escogido resulta ser el Patriarca de Constantinopla, san Simeón, quien es admirado por su gran devoción y humildad. Satisfecho con la elección, Delamare centra su atención en las plantaciones de rosas y, sobre todo, en Lyra Lenguadeplata, a quien considera responsable de la muerte de su hermana, Marisa Coulter. Con el objetivo de encontrar a su sobrina, Delamare se alía con un joven aletiometrista, el cual, ha obtenido recientemente un gran prestigio como descubridor de un nuevo método para leer el Aletiometro. Este “joven aletiometrista” resulta ser Olivier Bonneville, hijo de Gerard Bonneville, quien también desea encontrar a Lyra por haber “robado” el aletiómetro de su difunto padre. Usando el “nuevo método”, Olivier descubre que Lyra y Pan se han separado, y decide actuar por cuenta propia yendo en busca del daimonion desaparecido.

Pan, que se encontraba en Wittenberg en busca del novelista Gottfried Brande, lo acusa de haber corrompido a Lyra por medio de sus absurdas ideas, pero Brande ignora con miedo al daimonion, autoconvenciéndose a sí mismo de que sólo es un producto de su imaginación. Sin saber qué hacer a continuación, Pan se dispone a colarse en un barco de regreso a casa pero es capturado por Olivier, quien a su vez, es arrestado y torturado por los agentes del Magisterio, creyendo que éste ha traicionado a Delamare. Olivier consigue probar su inocencia, pero al momento de ser liberado, descubre con horror que Pan ha escapado de la celda. Pocos días después, Pan conoce a una refugiada llamada Nur Huda el-Wahabi, quien también ha perdido a su daimonion, y juntos deciden emprender el viaje al Hotel Azul, esperando encontrar allí a sus respectivas mitades.

Mientras tanto, Lyra continúa su viaje hacia el Este en busca de Pan, valiéndose de las direcciones del cuaderno de Hassall y siendo ayudada por simpatizantes de Oakley Street, así como por personas que han sido separadas de sus daimonions. En Praga, Lyra ayuda a un Hombre de Fuego a reencontrarse con su daimonion sirena, mientras que en Constantinopla es testigo de la conmoción ocurrida por el asesinato de san Simeón a manos de los “hombres de las montañas”. Como consecuencia de ello, el Magisterio celebra un congreso de emergencia en Ginebra, donde Marcel Delamare sale elegido como líder absoluto del Magisterio, usando el asesinato del patriarca como excusa para acumular pleno poder y unir a todas las fuerzas del Magisterio bajo su mando.

Al día siguiente, Lyra coge un ferry con destino a Esmirna, donde se encuentra con Bud Schlesinger (amigo de Malcolm y agente de Oakley Street) y su esposa Anita, una reconocida periodista que ha estado investigando los ataques en las plantaciones de rosas. Ambos ayudan a Lyra a disfrazarse para que pase inadvertida, y la aconsejan permanecer en Esmirna hasta que llegue Malcolm. Si bien Lyra se propone esperarlo allí, finalmente acaba cogiendo un tren en dirección a Seleukeia, al describir que han prendido fuego al domicilio de los Schlesinger. Bud Schlesinger, quien había logrado sobrevivir al ataque junto a su esposa Anita, se reúne con Malcolm en el consulado de Nueva Dinamarca y lo conduce a ver a Ted Cartwright, un científico malherido que ha logrado sobrevivir al ataque de los “hombres de las montañas” en la estación botánica de Tashbulak. Este último revela a Malcolm que las rosas en realidad proceden del misterioso edificio rojo que hay en el desierto de Karamakán, y que los hombres de las montañas que atacaron la estación estaban provistos de armas modernas. Malcolm se percata en ese momento de que la enfermera que lo estaba cuidando ha desaparecido, dejando inconsciente a Bud. Malcolm corre tras ella, pero ésta lo dispara en la cadera y, acto seguido, se suicida antes de que puedan atraparla.

Gracias a las investigaciones de Anita, Malcolm descubre que la enfermera trabajaba para Thuringia Potash, una compañía farmacéutica que ha estado financiando a los “hombres de las montañas" y suministrándoles armas, siendo ellos los responsables de toda la destrucción que ha estado sucediendo en las plantaciones de rosas. En este sentido, el domicilio de los Schlesinger había sido incendiado con el objetivo de destruir cualquier prueba que pudiera incriminar a la compañía. Malcolm se dispone a coger un tren a Alepo en busca de Lyra, pero durante el viaje, empieza a notar que le duele la herida. Poco tiempo después, el controlador del tren encuentra a Malcolm inconsciente, en medio de un charco de su propia sangre.