Australia, un vecino cercano tanto de Indonesia como de Timor Oriental, fue el único país que reconoció la anexión de Timor Oriental por parte de Indonesia. Algunos miembros del público australiano apoyaron la autodeterminación de Timor OrientalKelton, Maryanne "More Than an Ally?: Contemporary Australia-US Relations" Ashgate Publishing, Ltd., 2008 p 73 y también apoyaron activamente el movimiento de independencia dentro de Australia. El Gobierno australiano vio la necesidad tanto de estabilidad como de buenas relaciones con su vecino, Indonesia.In office: Paul Keating , Australia's Prime Ministers, National Archives of Australia, accessdate 4 May 2016 En 1998, el Gobierno de Howard cambió su postura y apoyó la autodeterminación de Timor Oriental, dando lugar a un referéndum que condujo a la independencia de Timor Oriental."Unanimous assembly decision makes Timor-Leste 191st United Nations member state", United Nations, 27 September 2002, accessdate 4 May 2016

Antecedentes

Con un cambio de gobierno tras la revolución portuguesa de 1974, el gobernante colonial de Timor Oriental, Portugal, se descolonizó. Como resultado, Portugal abandonó efectivamente su colonia de Timor Oriental. Posteriormente, en 1975, los dos principales partidos políticos de Timor Oriental, el Fretilin y el UDT, formaron un gobierno. En ese momento, Indonesia inició una operación secreta para construir una relación con la UDT, llamada «Operación Komodo». El UDT intentó un golpe de Estado, al que el Fretilin se resistió con la ayuda de los militares portugueses locales. Con los líderes del UDT que huían a Indonesia, el Fretilin hizo una declaración unilateral de independencia de la República Democrática de Timor Oriental (República Democrática de Timor-Leste en Portugués), el 28 de noviembre de 1975. Poco después, el 7 de diciembre de 1975, las fuerzas indonesias invadieron Timor Oriental.

Descripción general thumb|La casa de la bandera en Balibo Según la autora Clinton Fernandes, los gobiernos de Malcolm Fraser, Bob Hawke y Paul Keating cooperaron con el ejército indonesio y el presidente Suharto para ocultar detalles sobre las condiciones en Timor Oriental y para preservar el control indonesio de la región.Fernandes, Clinton (2004), Reluctant Saviour: Australia, Indonesia and East Timor Los gobiernos australianos vieron que las buenas relaciones y la estabilidad en Indonesia, el vecino más grande de Australia, brindaban un importante amortiguador de seguridad al norte de Australia. Sin embargo, Australia proporcionó un importante santuario a los defensores de la independencia de Timor Oriental como José Ramos-Horta, quien se asentó en Australia durante su exilio. Sin embargo, a lo largo de la duración de la ocupación de Timor Oriental en Indonesia, el público australiano se mostró generalmente incómodo, si no activamente en contra de la ocupación, inicialmente resaltado por la muerte de cinco periodistas australianos que llegaron a ser conocidos como el Balibo Five (los Cinco de Balibo). También las acciones de los timorenses para apoyar a las fuerzas australianas durante la batalla de Timor en la Segunda Guerra Mundial. Fueron bien recordados, particularmente por los veteranos. Estos dos problemas mantuvieron la ocupación de Timor Oriental en una luz negativa, durante toda la duración de la invasión y la ocupación. Las protestas se llevaron a cabo en Australia contra la ocupación, los timorenses orientales prominentes vivían en Australia y mantenían el problema encendido, y algunos ciudadanos australianos participaron en el movimiento de resistencia. Según el profesor James Cotton, al escribir en su libro sobre la invasión, Suharto, de hecho, evitó venir a Australia, sabiendo que habría protestas públicas.James Cotton, Professor School of Politics, "East Timor, Australia and Regional Order: Intervention and Its Aftermath", Routledge, p 33

Respuestas gubernamentales La era del gobierno de Whitlam 1974-75 thumb|Casa de Suharto-Whitlam en la meseta de Dieng (Indonesia), donde se discutió el destino de Timor Oriental en 1974 Hay varias razones por las que el Gobierno Whitlam apoyó la anexión de Timor Oriental por parte de Indonesia. Whitlam, hablando con el ABC, dijo hasta cierto punto que su Gobierno seguía opinando que Timor Oriental no era viable como Estado independiente. Además, había temores iniciales de que los timorenses instalaran un posible gobierno comunista en Timor Oriental, después de la retirada de los portugueses. Esto hizo que el Gobierno del Whitlam considerara favorablemente la anexión indonesia, y el Whitlam expresó su deseo de visitar a Suharto en 1974.

Michael Salla, escribiendo en el «Australian Journal of International Affairs», dijo que Whitlam percibió e interpretó el asunto en un marco anticolonial. El propio Whitlam dijo que la división de la isla de Timor no era más que un accidente de la historia colonial occidental. También se temía que una guerra civil prolongada pudiera causar grandes pérdidas de vidas durante un largo período, como la que había ocurrido en Angola, otra excolonia portuguesa.Salla, Michael (1995), "Australian foreign policy and East Timor", Australian Journal of International Affairs, 49:2, 207-222, DOI: 10.1080/10357719508445157 Hasta cierto punto, Whitlam estableció la lógica y el apoyo de la anexión, y esto fue llevado a cabo por los posteriores primeros ministros australianos y sus gobiernos. Además, el Gobierno australiano vio el deseo de paz en la región de la «ASEAN». Nicholas Klar, al escribir sobre la respuesta de Whitlam a la invasión indonesia, dijo que a Whitlam también le preocupaba que la revolución de los movimientos de separación pudiera extenderse a través de Indonesia, causando un efecto dominó que podría dar lugar a la balcanización de Indonesia en varios estados pequeños. Según el historiador Luke Miller, los documentos de Wikileaks indican que, antes de la invasión, existen algunas pruebas de que Australia estaba proporcionando información de inteligencia a Indonesia acerca de Portugal, con el fin de reducir al mínimo los malentendidos acerca de la situación entre los dos países.

Se ha argumentado que los comentarios del Gobierno Whitlam pudieron haber alentado al régimen de Suharto a la invasión de Timor Oriental,«Fed: Los cables muestran que Australia sabía de la invasión indonesia de Timor». AAP General News (Australia). 13 de septiembre de 2000. Obtenido el 3 de enero de 2008. con el exoficial del Ejército y comandante adjunto de UNTAET, Michael Smith, escribiendo que la invasión tenía al menos «aprobación tácita de Australia y Estados Unidos».Smith 2003, p. 38. A pesar de ello, y de la opinión general favorable de la anexión, el Gobierno australiano votó a favor de una resolución de las Naciones Unidas condenando la invasión, en 1975.

Durante el período previo a la invasión de Timor Oriental por Indonesia en 1975, el Servicio Australiano de Inteligencia (ASIS) pagó a un empresario australiano radicado en Dili, Frank Favaro, por proporcionar información sobre los acontecimientos políticos locales. La filtración de su identidad a finales de 1975 condujo a un enfrentamiento entre el entonces primer ministro del Trabajo, Gough Whitlam, y Bill Robertson, jefe de la ASIS, que dio lugar al despido del director de la agencia de inteligencia el 21 de octubre de 1975, con efecto a partir del 7 de noviembre. Bill Robertson cuestiona la razón de su despido en documentos presentados ante los Archivos Nacionales en 2009.

Gobierno de Fraser y Timor Oriental 1975-84 El Gobierno de Malcolm Fraser fue el primero en reconocer oficialmente la anexión de facto de Timor Oriental por parte de Indonesia, en enero de 1978. A esto siguió el reconocimiento de jure, durante las negociaciones con Indonesia sobre el límite del lecho marino entre los dos países."Final Report on the Inquiry into East Timor", Informe del Senado, Gobierno de la Mancomunidad Australiana, 7 de diciembre de 2000, sección 7.2 El primer ministro ordenó la incautación de un enlace de radio bidireccional entre Timor Oriental y Australia que estaba siendo operado ilegalmente por partidarios del Fretilin cerca de Darwin. Tras su regreso de Yakarta, el Sr. Fraser dio instrucciones de que el servicio de radio del puesto avanzado de telecomunicaciones cerca de Darwin dejara de recibir y transmitir mensajes del Fretilin desde Timor Oriental. También denegó visados de entrada en Australia a portavoces del Fretilin que afirmaban representar a la República Democrática de Timor Oriental."Final Report on the Inquiry into East Timor", Informe del Senado, Gobierno de la Mancomunidad Australiana, 7 de diciembre de 2000 Sección 7.10

El partido de la oposición en ese momento, el Partido Laborista, en 1979, pidió al Gobierno de Fraser que retirara el reconocimiento.Thakur, Ramesh, "Responsibility to Protect and Sovereignty", Routledge, p68 El propio Fraser vio que no le quedaba más remedio que continuar con el reconocimiento, ya que habría causado graves repercusiones con Indonesia, y que Estados Unidos en ese momento no apoyaría a Australia, ya que veía al grupo de resistencia de Timor Oriental, FRETILIN, como comunistas,Fraser, Malcolm and Margaret Simons, "Malcolm Fraser: The Political Memoirs", Melbourne University Publishing, 2010 y se consideró de interés para Australia apoyar a Indonesia."Final Report on the Inquiry into East Timor", Informe final sobre la investigación en Timor Oriental, Gobierno de la Mancomunidad Australiana, 7 de diciembre de 2000, Sección 7.9

Gobierno Hawke 1983-91 thumb|La brecha de timor El Gobierno Hawke continuó y confirmó el reconocimiento de jure de Australia de la anexión indonesia de Timor Oriental. Portugal expresó su descontento al recordar a su embajador, Inacio Rebello de Andrade, de vuelta a Lisboa."Final Report on the Inquiry into East Timor", Informe del Senado, Gobierno de la Mancomunidad de Australia, 7 de diciembre de 2000, sección 7.40 Los representantes indonesios y australianos firmaron el Tratado sobre la Franja de Timor en un avión sobre el mar de Timor. El tratado entró en vigor el 9 de febrero de 1991. Estableció una zona de cooperación en una zona submarina rica en petróleo, con planes futuros para gestionar los recursos petrolíferos de la zona."Final Report on the Inquiry into East Timor", Informe del Senado, Gobierno de la Mancomunidad Australiana, 7 de diciembre de 2000, sección 7.43

La era de Keating 1994-98 Inicialmente, después de que Paul Keating asumiera el papel de primer ministro, simplemente continuó el reconocimiento de la anexión de Timor Oriental por parte de Indonesia. Sin embargo, el Gobierno de Keating intensificó sus relaciones militares y de otro tipo con Indonesia, más allá de los gobiernos anteriores. Tanto Australia como Estados Unidos participaron en la asistencia al ejército indonesio, y las relaciones mejoradas durante este tiempo incluyeron la firma de un tratado de seguridad. Según John Pilger y varios otros periodistas, Keating fue percibido como que no había hecho lo suficiente, mientras que el primer ministro, para prevenir los abusos de los derechos humanos en Timor Oriental,Pilger, John, "Blood On The Hands of the Mates", New Statesman & Society. 11 de marzo de 1994, Vol. 7, Número 293, p. 8.Personal de AAP, "Nobel Laureate Attacks Keating", The Age, 3 de abril, p. 3.Scott, David, "Keating and the politics of appeasement: The old guard should exit the Australia-Indonesia stage", The Age (Melbourne) 10 de mayo de 1999, p. 15. aunque otros, como Whitlam, han defendido las políticas de Keating.Whitlam, Gough, "Whitlam renueva el ataque a Timor Oriental", The Australian, (National, Australia). 28 de julio de 1999, 005