derecha|miniaturadeimagen|255x255px|El periquito australiano consigue su color amarillo de un psittacofulvin pigmento y su color verde de una combinación del mismo pigmento amarillo y color estructural azul. El periquito azul con blanco del fondo carece del pigmento amarillo. Las marcas oscuras en ambas aves se deben al pigmento negro eumelanin. Los pigmentos biológicos, también conocidos como pigmentos naturales o biocromos son sustancias producidas por organismos vivos que tienen un color resultado de la absorción selectiva de color. Los pigmentos biológicos incluyen pigmentos vegetales y pigmentos de flores. Muchas estructuras biológicas, como los ojos, las plumas, la piel y el cabello contienen pigmentos como la melanina en células especializadas llamadas cromatóforo.

El color del pigmento difiere del color estructural, en que es el mismo color sin importar el ángulo desde el que se ve, mientras que el color estructural es el resultado de la iridiscencia o reflexión selectiva, normalmente debido a estructuras de múltiples capas. Por ejemplo, las alas de la mariposa típicamente contienen color estructural, a pesar de que muchas mariposas tienen células que también contienen pigmento.

Pigmentos biológicos Ver Sistema conjugado para conocer los enlaces del electrón que hacen que estas moléculas tengan pigmento. Hemo/porfirinas: Clorofila, bilirrubina, hemocianina, hemoglobina, mioglobina Emite luz: luciferina Carotenoides: Hematocromos: (algal pigmentos, mezclas de carotenoides y su derivados) Caroteno: Alfa y beta caroteno, licopeno, rodopsina Xantófila: cantaxantina, zeaxantina, luteína Proteico:fitocromo, ficobiliproteína Enolatos de polieno: Una clase de pigmentos rojos únicos para los loros Otro: melanina, urobilina, flavonoides

Pigmentos en plantas miniaturadeimagen|Modelo que llenado espacial de la molécula de clorofila. miniaturadeimagen|La antocianina da a estos pensamientos su pigmentación morada. La función primaria de los pigmentos en las plantas es la fotosíntesis, la cual utiliza el pigmento verde, clorofila junto con varios pigmentos rojos y amarillos que ayudan a capturar tanta energía luminosa como sea posible.

Otras funciones de los pigmentos en las plantas incluyen atraer insectos hacia las flores para alentar la polinización.

Los pigmentos de la planta incluyen una variedad de diferentes clases de molécula, incluyendo porfirina, carotenoides, antocianinas y betalaína. Todo pigmentos biológicos absorbe selectivamente ciertas longitudes de onda de la luz mientras reflejan otras.Lee, DW (2007) Nature's palette - the science of plant color.

Los principales pigmentos responsables son: Clorofila: es el pigmento primario en las plantas; es una clorina que absorbe longitudes de onda roja y azules de la luz mientras que refleja el verde. Es la presencia y relativa abundancia de clorofila lo que da el color verde a las plantas. Todos las plantas terrestres y las algas verdes poseen dos formas de este pigmento: clorofila a y clorofila b. La clorofila es el medio principal que usan las plantas para interceptar la luz y llevar a cabo la fotosíntesis. Carotenoides: son terpenos rojos, naranja, o amarillos. Durante el proceso de fotosíntesis, tienen funciones en la recolección de luz (como pigmentos accesorios), en fotoprotección (disipación de la energía mediante un apagado no fotoquímico así como la eliminación del oxígeno singlete para prevenir el daño foto-óxidativo ), también sirven como elementos proteicos estructurales. En plantas más altas, sirven como preformadores de la hormona de planta ácido abscisíco. Las plantas, en general, contienen seis carotenoides ubicuos: neoxantina, violaxantina, anteraxantina, zeaxantina, luteína y beta caroteno.Young AJ, Phillip D, Savill J. Carotenoids in higher plant photosynthesis. La luteína, es un pigmento amarillo encontrado en frutas y vegetales y es el carotenoide más abundante en plantas. Licopeno, es el pigmento rojo responsable para el color de los tomates. Otros carotenoides menos comunes en las plantas, incluyen a la epoxi-luteína (en muchas especie leñosas), lactucaxanthin (encontrado en la lechuga), y alfa caroteno (encontrado en las zanahorias).García-Plazaola JI, Matsubara S, Osmond CB. En las cianobacteria existen otros carotenoides como la cantaxantina, mixoxantófila, sineoxantina, y equinenona. Las algas fotótrofas como los dinoflagellata usan peridina como pigmento para absorber la luz. Mientras que los carotenoides pueden encontrarse unidos dentro de las proteínas que unen a la clorofila tales como los centros de reacción fotosintéticas obligatorias como los centros de reacción fotosintéticos y complejos fotosintéticos, también se encuentran dentro de las proteínas especializadas para carotenoides como la carotenoproteína naranja de cianobacterias. Antocianinas (Literalmente "florecer azul") es un pigmento flavonoide soluble en agua que aparece en el rango del rojo al azul, según el pH. Se encuentran en todos los tejidos de plantas altas, proporcionando color en hojas, raíces de plantas, raíces, flores y frutas, aunque no siempre en cantidades suficientes para ser perceptible. La antocianina es más visible en los pétalos de flores de muchas especies.Lee, DW (2007) Nature's palette - the science of plant color. miniaturadeimagen|Las Bráctea de las bugambilias deben su color a la betalaína. Betalaínas: son pigmentos rojos o amarillos. igual que las antocianinas son solubles en agua, pero a diferencia de ellas, estás son sintetizadas por la tirosina. Esta clase de pigmentos se encuentra sólo en los cariofilales (incluyendo el cactus y el amaranto), y nunca se encuentran en plantas que contengan antocianinas.Lee, DW (2007) Nature's palette - the science of plant color. También son responsables del color rojo del betabel. Una manifestación particularmente notable de la pigmentación en plantas se puede observar en el cambio de coloración en otoño, un fenómeno que afecta a las hojas normalmente verdes de muchos arbustos y árboles caducifolios por el cual toman, durante unas cuantas semanas en la estación de otoño, varias sombras de rojos, amarillos, púrpura, y marrón. La clorofila se degrada en tetrapirroles incoloros también conocido como catabolitos de clorofila no fluorescentes (NCCs). Cuando la predominante clorofila se degrada, se revelan los pigmentos escondidos de xantófilas amarillos y beta-carotenos naranjas. Estos pigmentos están presentes durante el año, pero los pigmentos rojos, las antocianinas, son de nuevo sintetizados una vez que aproximadamente la mitad de la clorofila se ha degradado. Los aminoácidos liberados por la degradación de los complejos fotosínteticos se almacenan durante el invierno en las raíces de árbol, ramas, raíces, y troncos hasta la próxima primavera cuándo se reciclan para volver a la hoja del árbol.

Pigmentos en algas Las algas son organismos fotosintéticos muy diversos, que se diferencian de las plantas en que son organismos acuáticos, no presentan tejido vascular y no generan embrión. Sin embargo ambos tipos de organismos comparten el poseer pigmentos fotosintéticos, que absorben y liberan energía que posteriormente es utilizada por la célula. Estos pigmentos además de las clorofilas, son las ficobiliproteínas, fucoxantinas, xantofilas y carotenos, que sirven para atrapar la energía de la luz y conducirla al pigmento primario, que se encargará de iniciar las reacciones de fotosíntesis oxigénica.

Las algas llaminariales, diatomeas, y otras heterokontofita fotosínteticas contienen clorofila c en vez de b, mientras las algas rojas poseen sólo clorofila a. +Pigmentos fotosintéticos en los diferentes grupos de algasGrupoPigmentosAlgas verdes -Clorofila a y bAlgas rojas -Clorofila a -Ficobiliproteínas

-Ficoeritrina pigmento rojo-morado, es el dominante en las especies que tienen un color rojo-morado.Algas pertenecientes a la línea amarilla, diatomeas y algas cafés -Clorofila a y c -Xantofila

-Fucoxantina

Pigmentos en bacterias

Algunas bacterias producen pigmentos como carotenoides, melanina, violaceína, prodigiosina, piocianina, actinorrodina y zeaxantina. Las cianobacterias producen ficocianina, ficoeritrina, scytonemina, y clorofila a, clorofila d y clorofila f. Las bacterias verdes y púrpuras del azufre producen bacterioclorofila a y bacterioclorofila b. +Pigmentos en bacteriasGrupoPigmentoCianobacteria -Clorofila a, Clorofila d y Chlorofila f -Ficocianina pigmento azul-verde, es el pigmento dominante de las cianobacterias

-Aloficocianina

-Ficoeritrina pigmento rojo-morado, es el dominante en las especies que tienen un color rojo-morado.

-Scytonemina

-Cianoficina

-CarotenoidesBacterias púrpuras -Bacterioclorofila a y bBacterias verdes -Bacterioclorofila c y eChromobacterium -ViolaceinaStreptomyces -MelaninMicromonospora -Antraquinona

Pigmentos en animales La pigmentación es utilizada por muchos animales como un medio para protegerse, mediante el camuflaje, mimetismo, o coloración para advertir a otros animales su toxicidad y así evitar ser depredados. Algunos animales incluyendo peces, anfibios y cefalópodos tienen cromatóforos que usan para camuflarse con el fondo y pasar desapercibidos.

La pigmentación es utilizada entre animales para señalizar, tal como se hace en la selección sexual. Por ejemplo, algunos cefalópodos utilizan sus cromatóforos para comunicarse.

El fotopigmento rodopsina, atrapa la luz como primer paso en la percepción de la luz.

Los pigmentos de la piel como la melanina pueden proteger los tejidos de quemaduras solares por la exposición a radiación ultravioleta.

Aun así, algunas estructuras biológicas en animales, como el grupo hemo, que ayuda transportar oxígeno en la sangre, su color es resultado de su estructura. Su color no tiene una función de protección o de señalización.

Enfermedades y condiciones Hay una variedad de enfermedades y condiciones anormales en humanos y animales debido a la pigmentación, ya sea por la ausencia o perdida de pigmentación, por células de pigmento o por la producción en exceso de pigmento. Albinismo: es un desorden heredado caracterizado por la pérdida total o parcial de melanina. Humanos y animales que padecen albinismo son llamados albinista (el término albino también es utilizado, pero puede ser considerado como ofensivo cuándo es aplicado a personas). Ictiosisis: también llamada "piel de pez", es una condición heredada en la cual el síntoma es una producción en exceso de melanina. La piel es más oscura de lo normal, y se caracteriza por verse más oscura, escamosa y seca. Melasma: es una condición en qué manchas pigmentación marrón oscuro aparecen en la cara, influida por cambios hormonales. Cuándo ocurre durante un embarazo, esta condición se apellida la máscara de embarazo. La pigmentación ocular es una acumulación de pigmento en el ojo, y puede ser causada por medicación con latanoprost. Vitiligo: es una condición en qué hay una pérdida de células que producen pigmentos llamados melanocitos en partes de piel.

Pigmentos en animales marinos

Carotenoides y carotenoproteínas Los carotenoides son el grupo más común de los pigmentos encontrados en naturaleza.Nadakal A. M.. Se han encontrado alrededor de 600 clases diferentes de carotenoides en animales, plantas, y microorganismos.