La temporada 2016-17 de Segunda División de fútbol sala fue la 28.ª edición de la Segunda División de la Liga Nacional de Fútbol Sala de España. Comenzó el 17 de septiembre de 2016 y el play-off finalizó el 1 de mayo de 2017. Se disputó en formato de liga, con una fase regular, que enfrentaba todos contra todos a los 14 equipos participantes. Obtuvo el título de campeón FC Barcelona "B" Lassa. Al no poder ascender por ser equipo filial, ascendió el subcampeón, Naturpellet Segovia. El restante ascenso fue para el ganador de la eliminatoria disputada por los clasificados de la 2.ª a la 5.ª posición. El último clasificado descendió a Segunda División B.
Equipos participantes ClubCiudadComunidad autónoma PabellónProne Lugo F.S.Lugo Galicia Municipal de LugoCidade de NarónNarón Galicia Municipal de A GandaraO Parrulo FerrolFerrol GaliciaA MalataReal Betis FutsalSevilla AndalucíaAmateAtlético MengibarMengibar AndalucíaSebastián Moya LorcaCD UMA AntequeraAntequera AndalucíaFernando ArgüellesMassey Ferguson ValdepeñasValdepeñas Castilla-La ManchaVirgen de la CabezaFSD PuertollanoPuertollano Castilla-La ManchaPolideportivo Antonio RivillaNaturpellet SegoviaSegovia Castilla y LeónPedro DelgadoRivas FutsalRivas-Vaciamadrid Comunidad de MadridParque SuresteEl Pozo Ciudad de MurciaMurcia MurciaPalacio de Deportes de MurciaFC Barcelona "B" LassaBarcelona CataluñaCiutat Esportiva Joan GamperElche CFElche Comunidad ValencianaEsperanza LagTenerife Iberia ToscalSanta Cruz de Tenerife CanariasQuico Cabrera
Clasificación Equipo Puntos J G E P GF GC 1 59 26 18 5 3 122 65 2 58 26 18 4 4 97 59 3 56 26 17 5 4 95 65 4 51 26 16 3 7 99 73 5 47 26 14 5 7 87 61 6 45 26 13 6 7 80 64 7 43 26 13 4 9 84 75 8 34 26 10 4 12 83 80 9 29 26 7 8 11 78 90 10 27 26 7 6 13 74 77 11 26 26 7 5 14 93 106 12 23 26 6 5 15 95 129 13 8 26 1 5 20 49 116 14 6 26 1 3 22 51 127 Fuente: Federación Española de Fútbol: Clasificación de la Segunda División de Fútbol Sala ; actualización automática Playoff de ascenso a Primera División ElPozo Ciudad de Murcia al ser equipo filial, no disputó el play-off al no poder ascender a Primera División.
Asciende a Primera División O Parrulo Ferrol
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