La Eliminatoria a la Eurocopa Sub-16 2000 contó con la participación de 49 selecciones infantiles de Europa para definir a los 15 clasificados a la fase final del torneo a disputarse en Israel junto al país anfitrión.
Grupo 1 Los partidos se jugaron en Bosnia y Herzegovina del 6 al 10 de marzo de 2000.
PaísJGEPGFGCPts 3210507 3210307 3012041 3012041
Grupo 2 Los partidos se jugaron en Tbilisi, Georgia del 20 al 24 de octubre.
PaísJGEPGFGCPts 3300939 3111344 3102353 3012141
Grupo 3 Los partidos se jugaron en Györ, Hungría del 20 al 24 de setiembre.
PaísJGEPGFGCPts 2200606 2101233 2002050
Grupo 4 Los partidos se jugaron en Ploesti, Rumania del 20 al 24 de setiembre.
PaísJGEPGFGCPts 2200506 2101243 2002140
Grupo 5 Los partidos se jugaron en Limassol, Chipre del 5 al 9 de marzo de 2000.
PaísJGEPGFGCPts 2110424 2020332 2011241
Grupo 6 Los partidos se jugaron en Rusia del 15 al 19 de setiembre.
PaísJGEPGFGCPts 33001829 3201356 3102163 30031100
Grupo 7 Los partidos se jugaron en Hamar, Noruega del 15 al 19 de setiembre.
PaísJGEPGFGCPts 2110324 2020332 2011341
Grupo 8 Los partidos se jugaron en Tallinn, Estonia del 22 al 26 de setiembre.
PaísJGEPGFGCPts 22001006 2011021 2011081
Grupo 9 PaísJGEPGFGCPts 43109210 4211837 40041130
Grupo 10 Los partidos se jugaron en Eslovenia del 22 al 26 de octubre.
PaísJGEPGFGCPts 2200526 2101743 2002170
Grupo 11 Los partidos se jugaron en República de Irlanda del 25 al 29 de octubre.
PaísJGEPGFGCPts 3210307 3111134 3102443 3102343
Grupo 12 Los partidos se jugaron en Irlanda del Norte del 25 al 29 de octubre.
PaísJGEPGFGCPts 2200606 2011021 2011041
Grupo 13 Los partidos se jugaron en Vaduz, Liechtenstein del 18 al 22 de octubre.
PaísJGEPGFGCPts 2200636 2101333 2002140
Grupo 14 Los partidos se jugaron en Castelo Branco, Portugal del 14 al 18 de marzo de 2000.
PaísJGEPGFGCPts 2200606 2010141 2010141
Grupo 15 Los partidos se jugaron en Luxemburgo del 7 al 11 de marzo de 2000.
PaísJGEPGFGCPts 2200906 2101323 20021110
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