La Segunda Categoría 2016, cuyo nombre comercial fue «Copa Banco del Pacífico Segunda Categoría 2016» fue la edición n.º 43 de la Segunda Categoría del fútbol ecuatoriano, este torneo fue el tercer escalafón en la pirámide del Fútbol Ecuatoriano por detrás de la Serie A y Serie B, las fases finales comenzaron a disputarse el 31 de julio de 2016 y finalizó el 11 de diciembre de 2016.
El América de Quito consiguió su primer título en la categoría tras una excelente campaña desde la etapa provincial donde fue subcampeón y en las fases regionales y nacionales en las cuales las superó con total comodidad, el título de campeón 2016 le permitió conseguir el ascenso a la Serie B tras 34 años, la última vez que jugó en la Serie B fue en 1982.
Por otra parte el subcampeón del torneo fue el Santa Rita de Vinces, que por segunda vez en su historia quedó en segundo lugar del torneo, el cuadro vinceño comenzó en la etapa provincial quedando campeón, en las etapas regionales y nacionales terminó en primer lugar de sus respectivos grupos, tras una muy buena campaña el equipo fluminense regresó a la Serie B tras 11 años, en la temporada 2005 fue su última participación en Primera B donde tras el descenso fue suspendido 5 años.
El torneo se celebra de manera anual desde 1967. En 1967, se denominó Segunda División Ecuatoriana de Fútbol ya que aún no se formaba la Serie B en los años 1967-1970. En los años 1968-1974, se jugó los campeonatos provinciales tras la desaparición de la Segunda División Ecuatoriana de Fútbol. En los años 1973 y 1983-1988 se desarrolló como el segundo nivel del fútbol ecuatoriano tras la desaparición de la Serie B y retomando su antiguo nombre.
El torneo comprendió 4 etapas: el primer semestre del año se jugaron los campeonatos provinciales, y en el segundo semestre las fases: regional, nacional y final.
Sistema de campeonato El formato para el torneo de Segunda Categoría 2016 fue confirmado el 26 de enero de 2016, en el Comité Ejecutivo Ampliado en la Federación Ecuatoriana de Fútbol, ahí las diferentes asociaciones aprobaron el sistema de campeonato, la cantidad de clubes participantes, que hasta el año pasado era de 44 equipos para este torneo se redujo a 33, es decir que los torneos provinciales que tengan 5 o menos equipos solo clasificará el campeón provincial y los torneos que tengan 6 o más equipos clasificará el campeón y vicecacampeón provincial.
Fase provincial (primera etapa) La primera fase fue conformada por las 22 asociaciones provinciales de fútbol del Ecuador, cada asociación tuvo su propio formato de clasificación. Asociaciones con 5 o menos equipos clasificaron 1 club a la Fase Regional Asociaciones con 6 o más equipos clasificaron 2 clubes a la Fase Regional Clasificaron 33 clubes a la fase regional.
Fase regional (segunda etapa) Zona OrientalZona OccidentalZona SurGrupo 1Grupo 2Grupo 1Grupo 2Grupo 1Grupo 220px|border Imbabura20px|border Orellana20px|border Carchi20px|border Pichincha 220px|border Bolívar 20px|border Chimborazo 20px|border Napo 20px|border Pastaza
20px|border Pichincha 120px|border Cotopaxi 2 20px|border Esmeraldas 2 20px|border Los Ríos 1 20px|border Manabí 1 20px|border Santa Elena 20px|border Cotopaxi 1 20px|border Esmeraldas 1 20px|border Los Ríos 2 20px|border Manabí 220px|border Azuay 1 20px|border Cañar 2 20px|border El Oro 1
20px|border Loja20px|border Azuay 2 20px|border Cañar 1 20px|border El Oro 2 20px|border Guayas 2
Un total de 33 clubes jugaron esta etapa. Se dividió en 6 grupos: tres de 6 y tres de 5 clubes. Cada grupo constó de 10 fechas con partidos de ida y vuelta. Clasificaron los 6 primeros y los 6 segundos a la fase nacional.
Fase nacional (tercera etapa) Un total de 12 clubes jugaron esta etapa. Se dividió en 3 grupos de 4 clubes por sorteo. Cada grupo constó de 6 fechas con partidos de ida y vuelta Clasificaron los 3 primeros y el mejor segundo a la fase final.
Fase final (cuarta etapa) Un total de 4 clubes jugaron esta etapa. El cuadrangular constó de 6 fechas con partidos de ida y vuelta. El primero y el segundo equipo lograron el ascenso a la Serie B 2017.
Equipos clasificados AsociaciónEquipoVía de clasificación Azuay2 cuposAtenas F. C.EstudiantesCampeón de la Segunda Categoría de Azuay 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Azuay 2016 Bolívar1 cupo UnibolívarCampeón de la Segunda Categoría de Bolívar 2016 Cañar2 cuposSan FranciscoCiudadelas del NorteCampeón de la Segunda Categoría de Cañar 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Cañar 2016 Carchi1 cupoAtlético TulcánCampeón de la Segunda Categoría de Carchi 2016 Chimborazo1 cupoStar ClubCampeón de la Segunda Categoría de Chimborazo 2016 Cotopaxi2 cuposAtlético SaquisilíUTCCampeón de la Segunda Categoría de Cotopaxi 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Cotopaxi 2016 El Oro2 cuposAudaz OctubrinoOrenseCampeón de la Segunda Categoría de El Oro 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de El Oro 2016 Esmeraldas2 cuposAtacames S. C.NazaretCampeón de la Segunda Categoría de Esmeraldas 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Esmeraldas 2016 Guayas2 cuposToreros F. C.Guayaquil SportCampeón de la Segunda Categoría de Guayas 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Guayas 2016 Imbabura1 cupoDeportivo OtavaloCampeón de la Segunda Categoría de Imbabura 2016 Loja1 cupoLa TebaidaCampeón de la Segunda Categoría de Loja 2016 Los Ríos2 cuposSanta RitaEl GuayacánCampeón de la Segunda Categoría de Los Ríos 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Los Ríos 2016 Manabí2 cuposDeportivo ColónGalácticosCampeón de la Segunda Categoría de Manabí 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Manabí 2016 Morona Santiago1 cupoJuvenil SevillaCampeón de la Segunda Categoría de Morona Santiago 2016 Napo1 cupoValle de QuijosCampeón de la Segunda Categoría de Napo 2016 Orellana1 cupoAnaconda F. C.Campeón de la Segunda Categoría de Orellana 2016 Pastaza1 cupoDeportivo PuyoCampeón de la Segunda Categoría de Pastaza 2016 Pichincha2 cuposPuerto QuitoAmérica de QuitoCampeón de la Segunda Categoría de Pichincha 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Pichincha 2016 Santa Elena1 cupoCarlos Borbor ReyesCampeón de la Segunda Categoría de Santa Elena 2016 Santo Domingo de los Tsáchilas2 cuposSan RafaelTalleresCampeón de la Segunda Categoría de Santo Domingo de los Tsáchilas 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Santo Domingo de los Tsáchilas 2016 Sucumbíos1 cupoCaribe JuniorCampeón de la Segunda Categoría de Sucumbíos 2016 Tungurahua2 cuposPelileo S. C.BolívarCampeón de la Segunda Categoría de Tungurahua 2016Subcampeón de la Segunda Categoría de Tungurahua 2016
Zona 1 Los equipos de Carchi, Imbabura, Sucumbíos, Orellana, Pichincha y Tungurahua.
– Clasificado para los Cuadrangulares semifinales.
– Perdió la categoría.
Clasificación EquipoPJPGPEPPGFGCDGPTS20px|border1.° Deportivo Otavalo 9 8 0 1 30 7 +23 2420px|border2.° América de Quito 9 7 1 1 23 7 +16 2220px|border3.° Pelileo S. C. 9 4 1 4 17 15 +2 1320px|border4.° Anaconda F. C. 8 4 0 4 20 11 +9 1220px|border5.° Atlético Tulcán 8 1 0 7 8 26 -18 320px|border6.° Caribe Junior 9 1 0 8 6 38 -32 3
Evolución de la clasificación <center> {| class="wikitable sortable" ! width="220" align=center|Equipo / Jornada !width=25|01 !width=25|02 !width=25|03 !width=25|04 !width=25|05 !width=25|06 !width=25|07 !width=25|08 !width=25|09 !width=25|10 |- |20px|border Deportivo Otavalo ||<center>3||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>1 |- |20px|border América de Quito ||style="background:#98FB98"|<center>1||style="background:#98FB98"|<center>2||<center>3||<center>3||style="background:#98FB98"|<center>2||style="background:#98FB98"|<center>2||style="background:#98FB98"|<center>2||style="background:#98FB98"|<center>2||style="background:#98FB98"|<center>2||style="background:#98FB98"|<center>2 |- |20px|border Pelileo S. C. ||style="background:#98FB98"|<center>2||<center>3||style="background:#98FB98"|<center>2||style="background:#98FB98"|<center>2||<center>4||<center>4||<center>4||<center>3||<center>3||<center>3 |- |20px|border Anaconda F. C. ||<center>4||<center>4||<center>4||<center>4||<center>3||<center>3||<center>3||<center>4||<center>4||<center>4 |- |20px|border Atlético Tulcán ||<center>5||<center>5||<center>6||<center>6||<center>6||<center>6||<center>5||<center>5||<center>5||<center>5 |- |20px|border Caribe Junior ||<center>6||<center>6||<center>5||<center>5||<center>5||<center>5||<center>6||<center>6||<center>6||6
Resultados Fecha 1LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderDeportivo Otavalo1 - 0Anaconda20px|borderMunicipal de Otavalo6 de agosto16:0020px|borderAmérica de Quito3 - 0Caribe Junior20px|borderLa Armenia7 de agosto10:0020px|borderAtlético Tulcán1 - 3Pelileo20px|borderOlímpico (Tulcán)15:00 Fecha 2LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderAnaconda2 - 0Atlético Tulcán20px|borderJoya de los Sachas13 de agosto14:0020px|borderPelileo1 - 1América de Quito20px|borderCiudad de Pelileo16:1520px|borderCaribe Junior0 - 4Deportivo Otavalo20px|borderCarlos Vernaza14 de agosto13:00 Fecha 3LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderAmérica de Quito3 - 1Anaconda20px|borderLa Armenia17 de agosto10:0020px|borderAtlético Tulcán0 - 9Deportivo Otavalo20px|borderOlímpico (Tulcán)15:0020px|borderPelileo5 - 1Caribe Junior20px|borderCiudad de Pelileo16:15 Fecha 4LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderDeportivo Otavalo2 - 1América de Quito20px|borderMunicipal de Otavalo21 de agosto11:3020px|borderCaribe Junior3 - 1Atlético Tulcán20px|borderCarlos Vernaza13:0020px|borderAnaconda2 - 0Pelileo20px|borderJoya de los Sachas14:00 Fecha 5LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderPelileo0 - 2Deportivo Otavalo20px|borderCiudad de Pelileo27 de agosto16:1520px|borderAmérica de Quito2 - 0Atlético Tulcán20px|borderLa Armenia28 de agosto10:0020px|borderCaribe Junior1 - 6Anaconda20px|borderCarlos Vernaza15:00 Fecha 6LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderDeportivo Otavalo4 - 2Pelileo20px|borderMunicipal de Otavalo3 de septiembre15:3020px|borderAnaconda6 - 0Caribe Junior20px|borderJoya de los Sachas4 de septiembre14:0020px|borderAtlético Tulcán1 - 4América de Quito20px|borderOlímpico (Tulcán)15:00 Fecha 7LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderAmérica de Quito3 - 0Deportivo Otavalo20px|borderLa Armenia10 de septiembre14:0020px|borderAtlético Tulcán4 - 1Caribe Junior20px|borderOlímpico (Tulcán)15:0020px|borderPelileo3 - 1Anaconda20px|borderCiudad de Pelileo16:15 Fecha 8LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderCaribe Junior0 - 3Pelileo20px|borderCarlos Vernaza14 de septiembre12:0020px|borderAnaconda2 - 3América de Quito20px|borderJoya de los Sachas15:0020px|borderDeportivo Otavalo2 - 1Atlético Tulcán20px|borderMunicipal de Otavalo16:00 Fecha 9LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderAmérica de Quito3 - 0Pelileo20px|borderLa Armenia18 de septiembre10:0020px|borderDeportivo Otavalo6 - 0Caribe Junior20px|borderMunicipal de Otavalo12:0020px|borderAtlético Tulcán - Anaconda20px|borderNo se jugó Fecha 10LocalResultadoVisitanteEstadioFechaHora20px|borderAnaconda - Deportivo Otavalo20px|borderNo se programó20px|borderPelileo - Atlético Tulcán20px|border20px|borderCaribe Junior - América de Quito20px|border
Zona 2 Los equipos de Tungurahua, Pichincha, Bolívar, Chimborazo, Napo y Pastaza.
Clasificación EquipoPJPGPEPPGFGCDGPTS20px|border1.° Deportivo Puyo 10 7 3 0 26 4 +22 2420px|border2.° Puerto Quito 10 7 2 1 27 9 +18 2320px|border3.° Valle de Quijos 10 5 2 3 13 14 -1 1720px|border4.° Star Club 9 3 2 4 11 18 -7 1120px|border5.° Unibolívar 9 2 0 7 9 16 -7 620px|border6.° Bolívar 10 0 1 9 3 28 -25 1
Evolución de la clasificación <center>